Интенсив по анализу данных NGS
27 сентября - 18 октября | ОНЛАЙН

Запись на курс закрыта.
Онлайн-интенсив для исследователей биологических направлений позволяет в сжатые сроки получить максимум практических навыков по работе с геномными данными

По итогам выдается удостоверение о повышении квалификации
По средам 19:00 – 21:00 МСК
По субботам 11:00 – 18:00 МСК

Записи занятий будут доступны участникам уже на следующий день!
    Популяционная генетика

    30 сентября, 4 октября
    • Выравнивание прочтений и его предобработка;
    • Поиск и аннотация генетических вариантов;
    • Сравнительный и популяционный анализ генетических вариантов.
    Анализ данных
    RNA-seq

    7 и 11 октября
    • Препроцессинг данных;
    • Выравнивание ридов для получения каунтов;
    • Анализ дифференциальной экспрессии;
    • Оценка обогащения групп и коэкспрессии.
    Single cell секвенирование

    14 и 18 октября
    • Контроль качества;
    • Нормализация и выделение высоковариабельных генов;
    • Снижение размерности, кластеризация;
    • Дифференциальная экспрессия и аннотация клеточных типов;
    • Анализ траекторий.
    Заявки принимаются до 29 сентября, но до этого нужно пройти вводный онлайн-курс. Записывайтесь, чтобы успеть!
    Для кого
    Курс подходит тем, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.

    Вам подойдет интенсив, если:

    • у вас пока нет данных, но вы хотите побольше узнать о работе с данными NGS и попробовать их проанализировать;
    • в лабораторию купили секвенатор, вы получили сырые данные и не знаете, что с ними делать;
    • вы сделали базовую обработку данных и хотите узнать, как интерпретировать полученный результат и какую ещё информацию можно извлечь из данных.

    Ожидания от участников:

    • интерес к биоинформатике и анализу данных;
    • знания в молекулярной биологии;
    • наличие ноутбука для работы на практических занятиях;
    • базовые навыки работы в командной строке, R и Python на уровне онлайн-курса.
              Преимущества
              Много практики
              Интенсив нацелен на получение практических знаний, которые вы сможете применить к своим данным
              Доступность
              Занятия проходят онлайн, можно учиться из любой точки мира
              Поддержка
              Преподаватели и ассистенты готовы отвечать на вопросы и объяснять непонятные вещи
              Удобно сочетать с работой
              Занятия по субботам и в среду вечером, можно сочетать с работой или учебой
              Равномерный поток информации
              Промежутки между занятиями позволяют запомнить пройденный материал и подготовиться к новой порции знаний
              Адаптивная нагрузка
              Возможность выбрать один, два или три модуля в зависимости от интересов
              Формат
              Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке.

              Занятия будут проходят удаленно на платформе Zoom

              Программы прошлых мероприятий: весна 2023, 2022, осень 2021, весна 2021, 2019, 2018
                    Количество мест на интенсиве ограничено, успейте занять свое!
                    Организационные взносы
                    Взносы оплачиваются в рублях.

                    • 25 000 рублейодин модуль для физических лиц
                    • 29 000 рублейдва любых модуля для физических лиц
                    • 35 000 рублейтри модуля для физических лиц
                    • 45 000 рублей для юридических лиц

                    Место бронируется после произведения оплаты или по официальному гарантийному письму.
                    Количество мест ограничено.
                      Как принять участие
                      Для того чтобы принять участие, необходимо выполнить два шага:

                      1. Пройти вводный онлайн-курс
                      Это первый обязательный этап подготовки!

                      За интенсив сложно рассказать все детали анализа данных, но программа разработана с целью дать максимум полезных навыков. Онлайн-курс короткий, но позволит вам разобраться в программном обеспечении, используемом на занятиях, и сэкономит время на решении технических проблем.

                      2. Заполнить анкету и оплатить взнос

                      Ссылка на анкету станет доступна после того как вы наберете необходимые баллы в онлайн-курсе — для вас откроется следующий модуль курса на Stepik. Заявка оцениваться не будет, но ее заполнение обязательно — так мы сможем скорректировать программу и понять ваши ожидания.

                            Преподаватели
                            • Юрий Барбитов
                              Институт биоинформатики
                            • Александр Ткаченко
                              Университет ИТМО,
                              НИИ акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д. О. Отта

                            • Владимир Шитов
                              Munich School for Data Science
                            Часто задаваемые вопросы
                            Какой документ выдается по окончании?
                            По итогам выдается удостоверение о повышении квалификации Института биоинформатики с указанием прослушанных занятий и академических часов.
                            На какой уровень рассчитана программа интенсива?
                            Программа рассчитана на начинающих биоинформатиков. Однако мы ожидаем от участников владение командной строкой и знаниями в области технологий NGS уровне обязательного к прохождению онлайн-курса.
                            Претендуют ли студенты и аспиранты на скидку?
                            Нет, скидка не предоставляется.
                            Для записи на интенсив необходимо пройти онлайн-курс. Это обязательное условие?
                            Да. На интенсиве мы хотим сконцентрироваться на максимально полезной информации, поэтому важно подготовиться к ее получению и установить нужные программы.
                            Я набрал необходимое количество баллов в онлайн-курсе, что делать дальше?
                            Для тех, кто наберет необходимое количество баллов, в курсе станет доступен дополнительный модуль с инструкциями по заполнению анкеты и оплате.

                            Если модуль недоступен, значит на ближайшем интенсиве закончились места. Однако набранные баллы перезачтутся для будущих интенсивов.
                            Будут ли доступны записи занятий и обязательно нужно присутствовать лично?
                            Личное присутствие помогает лучше погрузиться в тему и сразу задать все вопросы. Но если обстоятельства не позволяют, участникам будут доступны записи занятий уже на следующий день после их проведения. Доступ к ним останется в течение 6 месяцев после окончания интенсива.
                            Я прошел курс, но подача анкет уже закончилась, когда я смогу записаться на следующий интенсив?
                            Интенсив проводится ежегодно один или два раза в год. Советуем подписаться на новости Института и следить за анонсами.
                            Отзывы
                            Контакты
                            Институт биоинформатики
                            Cанкт-Петербург, ул. Кантемировская 2А,
                            Бизнес-центр «Таймс»

                            Занятия онлайн на платформе Zoom

                            Вопросы – info@bioinf.me