Студенты

Студенты годовой программы по биоинформатике 2018/19
БИОИНФОРМАТИКА ДЛЯ БИОЛОГОВ
АЛГОРИТМИЧЕСКАЯ БИОИНФОРМАТИКА

Фирулёва Мария
СПбГУ, кафедра цитологии и гистологии
Студентка 4 курса кафедры цитологии и гистологии в СПбГУ. Научная работа посвящена изучению транскриптомных данных при фолликулярной лимфоме. Научные интересы: молекулярная биология, цитология, эволюционная генетика. Увлечения: программирование, прохождение онлайн-курсов, научпоп про физику и путешествия.

Моршнева Алиса
СПбГУ/ ИНЦ РАН
Работаю в лаборатории молекулярных основ дифференциации клеток Института Цитологии РАН. Основная тема исследований - изучение молекулярного механизма действия ингибиторов гистоновых деацетилаз (HDACi); влияние бутирата натрия на активность транскрипционных факторов FoxO. Научные интересы: эпигенетика, канцерогенез, клеточное старение, регуляция экспрессии генов, биомедицина, биофармацевтика. В свободное время практикую иностранные языки (английский, немецкий), слушаю образовательные подкасты.

Горбач Дарья
СПбГУ, кафедра биохимии
Бакалаврская работа, посвященная методам анализа протеомов и поиску специфических биомеркеров множественной миеломы человека, выполнена в ИНЦ РАН. Научные интересы: протеомика, психофармакология, генетика высшей нервной деятельности. Увлечения: научная фантастика, классическая музыка.

Павлова Полина
СПбГУ, кафедра биохимии
В ИЭФБ им. И.М.Сеченова выполняю работу, посвященную совершенствованию методологии доклинического исследования тестирования компонентов антидотной терапии отравлений фосфороорганическими соединениями, в частности изучается эстеразная активность альбумина. Научные интересы: молекулярная биология, биохимия, системная биология, медицинская генетика. Прохожу онлайн-курсы на Stepic и Coursera. Люблю биологию и химию и стараюсь по возможности передавать свои знания школьникам.

Погодина Надежда
СПбГУ, кафедра цитологии и гистологии
Являюсь младшим научным сотрудником лаборатории по изучению лейкозов в НИИ Гематологии и Трансфузиологии. Там же выполняю научную работу по изучению ниши гемопоэтических стволовых клеток при апластической анемии. Научные интересы: онкогематология, биология стволовых клеток, иммунология, молекулярная биология. В свободное время прохожу курсы на платформах stepic, coursera.

Лонишин Любовь
СПбПУ, кафедра медицинской физики
Студентка 2 курса бакалавриата СПбПУ на кафедре медицинской физики. Выполняет исследовательскую работу в лаборатории пренатальной диагностики наследственных и врожденных заболеваний института акушерства и гинекологии им. Д.О.Отта РАМН. Научная работа посвящена изучению механизмов развития наследственных нарушений соединительной ткани. Научные интересы: молекулярная биология, медицинская генетика.

Кизенко Алена
СПбГУ, кафедра цитологии и гистологии
Научно-исследовательская работа, выполняемая на базе Лаборатории Регуляции Экспрессии Генов Института Цитологии РАН, посвящена изучению функциональной роли раково-тестикулярных антигенов в опухолевых клетках. Научные интересы: клеточная и молекулярная биология, белок-белковые взаимодействия, регуляция экспрессии генов, посттрансляционные модификации, эпигенетика, эволюционная геномика. В свободное время изучает иностранные языки, проходит онлайн-курсы по программированию и биологии, играет на укулеле.
https://www.linkedin.com/in/alena-kizenko-44907a166/

Матюхина Наталья
ЗАО Биокад
В 2013 году я окончила СПбГТИ(ТУ) по специальности Биотехнология. В период обучения я выполняла научно-исследовательскую работу, посвященную изучению структуры гликогена в норме и при патологии, в Лаборатории клеточной патологии Института цитологии РАН.
После окончания института я несколько лет работала в Лаборатории онкогематологии ФГБУ НМИЦ им. В.А.Алмазова Минздрава России. В период работы я принимала участие в изучении механизмов патогенеза миелопролиферативных заболеваний, а также выполняла молекулярные исследования для пациентов Отделения гематологии. В настоящее время я работаю в компании ЗАО Биокад, в которой занимаюсь сборкой и верификацией генетических конструкций, а также определением стабильности клеточных линий продуцентов. Я также участвовала в нескольких проектах компании, связанных с увеличением продуктивности клеточной линии СНО. Круг моих научных интересов включает генную инженерию, молекулярную биологию и регуляцию экспрессии генов.

Легковой Станислав
СПбГУ, кафедра биохимии
Аспирант СПбГУ, кафедра биохимии. Выполняет кандидатскую диссертацию в Отделе общей патологии и патологической физиологии Института экспериментальной медицины. Научная работа посвящена исследованию взаимодействия антимикробных белков нейтрофилов человека с белками системы комплемента. Текущие научные интересы: протеомика, интерактомика, драг-дизайн, эпигенетика. Считает залогом успеха человека во всех сферах жизни силу воли и стремление к саморазвитию. В свободное время читает художественную литературу, интересуется электротехникой, проходит курсы на платформах Stepic и Coursera.

Намятова Анна
ЦКП «Хромас» / СПбГУ
Ведущий специалист в Ресурсном центре «Хромас» СПбГУ, закончила бакалавриат и магистратуру на кафедре энтомологии СПбГУ. Закончила аспирантуру (PhD) и постдок в School of Biological, Earth and Environmental Sciences, University of New South Wales, Австралия. Изначально изучала классическую таксономию и систематику насекомых, несколько лет назад начала работать в области молекулярной филогенетики. В данный момент развивает проекты по филогенетике в филогеографии насекомых. Также планирует применять геномные данные для своих исследований. Свободно владеет английским языком, автор 20 научных статей, есть опыт преподавания и научного руководства. Считает, что постоянное изучение нового - это основа для интересной и продуктивной жизни.

Творогова Варвара
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Текущий научный проект - изучение генов WOX, CLE и NF-Y в регуляции соматического эмбриогенеза у люцерны. Научные интересы: генетика развития, размножение и генетическая трансформация растений, эпигенетика, редактирование генома.

Романова Ольга
СКГИ ОМОМР ГБ№40
Специалист сектора клинико-генетических исследований городской больницы №40 г.Сестрорецка. Основное образование: Санкт-Петербургский государственный Политехнический университет Петра Великого, кафедра биофизики. Основные направления работы: высокопроизводительное (NGS) секвенирование, диагностика моногенных заболеваний, пренатальная диагностика. Увлечения: алтимат фрисби, музыка, путешествия.

Лебеда Юрий
ПСПбГМУ им. акад. И.П.Павлова
Студент 4 курса ПСПБГМУ им. акад. И.П.Павлова лечебного факультета. Участвовал в хакатоне по биоинформатике «Biohack 2018», на котором работал над проектом «Поиск патогенных пар мутаций в геноме человека», суть которого заключалась в анализе человеческого генома, отборе пар мутаций и их статистическому анализу, с последующим сравнением результатов с базой известных взаимодействий между генами. Научные интересы: медицинская молекулярная биология, генетика, методы современной терапии.

Лихолетова Дарья
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Выпускница биологического факультета СПбГУ 2018 года, выполняла ВКР на кафедре генетики и биотехнологии на тему «Исследование формирование агрегатов Sup35 при возникновении приона [PSI+]». Научные интересы: молекулярная биология, прионы, drug design, молекулярная психиатрия.

Сытник Екатерина
СПбПУ, кафедра биофизики
Выполняю исследовательскую работу в лаборатории молекулярной биологии стволовых клеток Института цитологии РАН. Научные интересы: эпигенетика, биология стволовых клеток, внутриклеточные сигнальные системы.

Рудая Елизавета
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Выполняет исследовательскую работу в Петербургском Институте Ядерной Физики (Курчатовский институт). Научная работа посвящена поиску и исследованию микробных психрофильных сообществ на территории озера Восток, скважин глубокого бурения Гренландии, а также горных снежников. Научные интересы: молекулярная биология, молекулярная генетика, филогенетика, экологическая микробиология

Федорова Яна
Skoltech, Center of Life Sciences
Я аспирант Сколтеха, занимаюсь изучением CRSIPR Cas систем и созданием на их основе новых средств изменения генома растений и животных. Биохимически характеризую Cas белки из бактерий, живущих в травах, курах и подводных источниках. О себе: люблю своего лабрадора Тотошку, рисую маслом и иногда взбираюсь на холмы.
https://www.linkedin.com/in/iana-fedorova-b7843b129/

Лебеденко Ольга
СПбПУ, кафедра биофизики
В настоящий момент выполняет магистерский проект в центре геномной биоинформатики СПбГУ им. Ф. Г. Добржанского. Цель работы: реализация алгоритма поиска генетических маркеров лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis, как конвергентных эволюционных событий. Вненаучная деятельность: обучение детей игре в шахматы.

Матиив Антон
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Выполняю исследовательскую работу в лаборатории физиологической генетики. Работа посвящена поиску потенциально амилоидогенных белков. Ранее занимался изучением механизмов супрессии мутаций в генах, контролирующих биосинтез хлорофилла у Chlamydomonas reinhardtii. Научные интересы: молекулярная биология, биотехнология, генная инженерия, микробиология, вирусология

Косолапова Анастасия
СПбГУ
Выполняет исследовательскую работу в лаборатории протеомики надорганизменных систем Института сельскохозяйственной микробиологии, посвященную поиску новых амилоидных белков у протеобактерий. Сфера научных интересов: разнообразие прокариот, микробные сообщества, организация геномов, сравнительные протеомные исследования.

Матвеенко Андрей
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Выпускник кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ, к.б.н. по специальности «Генетика». Текущая научная деятельность связана с изучением прионов, шаперонов и терминации трансляции у дрожжей. Другие научные интересы: системы редактирования геномов, транскрипционные факторы. Занимаюсь музыкой, гитарист группы Eli band.

Бабкина Ирина
СПбГУ, кафедра зоологии беспозвоночных
Закончила бакалавриат СПбГУ (каф. Зоологии беспозвоночных). Занималась изучением протеомного и метаболического ответа трематод в ответ на термальный стресс. В область научных интересов входит анализ метаболических сетей и статистическая обработка данных. В магистратуре планирую заниматься антимикробными пептидами моллюсков. Имеется опыт участия в естественно-научных турнирах.

Нисканен Сергей
ЗАО Биокад
Закончил магистратуру СПбГУ на кафедре биохимии. Исследовательская работа проводилась в Институте цитологии РАН и была посвящена изучению влияния малых молекул на функционирование клеточного шаперона Hsp70. Наибольший интерес для меня представляют исследования на стыке клеточной биологии, биохимии и хемоинформатики: подбор оптимальной структуры лигандов для взаимодействия с клеточными рецепторами, предсказание биологических свойств различных соединений на основе их химической структуры (QSAR), белковая инженерия. Помимо этого, интересуюсь синтетической биологией, иммунологией и астрофизикой. Персональная страница: https://www.linkedin.com/in/sergei-niskanen-7a5691104/

Килина Дарья
НМИЦ им. В. А. Алмазова, кафедра лабораторной медицины и генетики
Ординатор второго года обучения НМИЦ им. В.А. Алмазова на кафедре лабораторной медицины и генетики. Выполняет исследовательскую работу в отделе биохимических исследований Центра доклинический и экспериментальных исследований НМИЦ им. В.А. Алмазова. Заняты в проведении этих двух научных проектов: исследование роли полиморфизма гена тирозинкиназы в патогенезе аутоимунных заболеваний и создание нокаутной модели шизофрении на модельных организмах Danio rerio. Научные интересы: медицинская генетика, онкология, молекулярная биология, генная инженерия, секвенирование следующего поколения. В свободное время слушает курсы на платформах Stepic и Coursera, занимается альпинизмом и скалолазонием.

Балашова Дарья
МГУ им. М. В. Ломоносова, кафедра теории вероятностей
Аспирантка кафедры теории вероятностей механико-математического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова. Персональная страница: https://istina.msu.ru/profile/dashabalashova/

Зенкова Наталья
СПбГУ, кафедра статистического моделирования
Защитила бакалаврскую работу на тему «Множественные сравнения для повторных наблюдений» на кафедре статистического моделирования математико-механического факультета СПбГУ. На данный момент являюсь студенткой первого курса магистратуры на той же кафедре. Область научных интересов -- применение статистических методов и методов машинного обучения к задачам биоинформатики. Занимаюсь танцами, изучаю немецкий язык и обожаю фигурное катание.

Исаев Василий
СПБПУ, кафедра программной инженерии
Студент 2 курса бакалавриата СПбПУ на программной инженерии. Научные интересы: Биоинформатика, Java, нейронные сети. Стремится к постоянному саморазвитию и самосовершенствованию. Слушает множество курсов на платформе Stepik, изучает Python, профессионально играет в шахматы.

Капанина Анастасия
Grid Dynamics
Закончила бакалавриат в 2017 году, выпускная работа была посвящена идентификации автора текста с помощью методов машинного обучения. Работаю инженером по автоматизации тестирования, последнее место работы - компания Grid Dynamics. Стремлюсь постоянно изучать что-то новое, прохожу курсы на Stepic и Coursera. Научные интересы: data science, machine learning, генная инженерия, эволюционная биология. Хобби: скалолазание, игра на фортепиано.

Картышева Елена
СПбГУ, кафедра статистического моделирования
В данный момент занимаюсь проектом предсказания оттока абонентов с помощью методов ML и работаю junior-разработчиком C#. Прошла курсы EPAM по Data Science. Научные интересы: статистика и все, что с ней связано, data science, MCMC, исследование мутаций в геноме. Так же интересуюсь когнитивной психологией, научно-популярными статьями по биологии и частенько прохожу курсы на Stepik. Люблю книги, неоклассику, русскую оперу, активный отдых и путешествия.

Лукашина Нина
BeKitzur LLC
Я закончила магистратуру Политехнического университета в 2017 году по направлению «Информатика и вычислительная техника». В качестве научно-исследовательской работы в магистратуре занималась семантическим анализом предложений на естественном языке. С 2014 года работаю в области разработки программного обеспечения, занималась разработкой приложений в life science. Интересуюсь применением IT в естесственных науках, биоинформатикой. В свободное время изучаю материалы по биоинформатике, прохожу курсы на Coursera и Stepic. Linkedin: https://www.linkedin.com/in/nina-lukashina-a3139baa/

Мурзина Анастасия
Университет ИТМО, кафедра компьютерных технологий
Студентка магистратуры Университета ИТМО, кафедры Компьютерных Технологий. Занимается разработкой структуры хранения различных пространственных изомеров в дискретном представлении. В сферу интересов входят изучение алгоритмов, построение физических моделей. В свободное время занимается спортивным ориентированием, бегом по пересечённой местности, кайтингом.

Полякова Елена
EPAM Systems
Закончила механико-математический факультет в Белорусском Государственном факультете в Беларуси. По специальности математика-производственная деятельность. В то время устроиться по специальности в Беларуси было сложно, я начала работать frontend разработчиком, а последние годы занимаюсь UX/UI проектированием в компании EPAM. В университете изучала С++, Java. Сейчас восполняю знания и изучаю Python и R. Читаю много научно-популярной литературы и интересуюсь исследованиями. Сделали научный проект scitech.by, где публикуем наиболее интересные научные работы Беларуси и России. Перерабатываем их на более простой и научно-популярный язык. Также, переводим интересные научные работы на английский язык: scitechub.io. Достижения: Работа на lifescience проектах в компании EPAM, разработка интерфейса для научного микроскопа компании molecular devices. Также, организация научного хакатона в Минске http://sciencehit.by/hackathon, в котором приняло участие 13 научных команд и были созданы mvp для задач из различных научных тематик: химия, биология, физика, медицина. Интересы: молекулярная биология, генная инженерия, медицинская биоинформатика.

Чаплыгина Дарья
СПбГУ, кафедра информационно-аналитических систем
Занималась изучением статей о дизайне пептидов, способных присоединяться к данной поверхности протеина. Изучала программу PyMOL и библиотеку PyRosetta. Принимала участие в проекте по написанию параллельной версии программы HMMER на CUDA (выполнила задачу распараллеливания фильтра Витерби).

Шешуков Илья
СПбГУ
Студент математико-механического факультета СПбГУ.

Орехов Дмитрий
СПбГУ, кафедра проблем конвергенции естественных и гуманитарных наук
Студент 4 курса факультета свободных искусств и наук СПбГУ, программа «Сложные системы». Курсовая работа третьего года была посвящена исследованию возможности оценки патогенных свойств штаммов E. Coli методами машинного обучения. Научные интересы: биология развития, сигнальные пути, алгоритмы машинного обучения, сетевой анализ, математические модели в биологии. Языки программирования: Python, C++.

Сажнева Елизавета
СПбГУ
Научные интересы: алгоритмы, формальные языки, биоинформатика. Люблю активный отдых и путешествия.

Климина Александра
EPAM Systems
Программист. Работаю в компании EPAM в life science направлении. Последний проект был посвящен разработке платформы для анализа редких заболеваний.

Абасов Руслан
НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева
Выпускник кафедры ИУ7 факультета ИУ МГТУ им.Н.Э.Баумана. На данный момент занимаюсь технической поддержкой лаборатории,анализом данных NGS (таргетные панели,клинические экзомы,поиск герминальных и соматических мутаций по профилю центра,в котором работаю).