Институт биоинформатики | Университет ИТМО
Магистратура
«Биоинформатика и системная биология»
Совместная магистерская программа Университета ИТМО и Института биоинформатики по биоинформатике и системной биологии.
Программа реализуется на английском языке и готовит высококвалифицированных специалистов, способных разрабатывать и применять методы биоинформатики
для решения задач в области биологии и медицины.
Программа реализуется на английском языке и готовит высококвалифицированных специалистов, способных разрабатывать и применять методы биоинформатики
для решения задач в области биологии и медицины.
Актуальность
На сегодняшний день, когда биология находится на постгеномном этапе своего развития, практически любое исследование сопровождается генерацией огромных объемов экспериментальных данных: геномных, транскриптомных, протеомных и других омиксных данных. В связи с этим, остро стоит вопрос их правильного анализа, интеграции и интерпретации, чем и занимается биоинформатика и системная биология.
Методы биоинформатики и системной биологии применяются для решения широкого круга задач от фундаментальной науки до клинической практики и индустрии, среди которых:
Методы биоинформатики и системной биологии применяются для решения широкого круга задач от фундаментальной науки до клинической практики и индустрии, среди которых:
- изучение эволюционных процессов: происхождение видов, появление и распространение антибиотикорезистентности и т.д.;
- диагностика и изучение молекулярных механизмов генетических заболеваний;
- структурное моделирование для задач фармакологии;
- персонализированный подбор терапии для пациентов с раковыми и другими заболеваниями.
О программе
Сегодня практически любое исследование в биологии сопровождается генерацией огромных объемов экспериментальных данных. На данной программе студенты учатся грамотно работать с такими данными, и как использование вычислительных методов помогает совершать биологические открытия.
Программа рассчитана как на абитуриентов биологических специальностей, так и с образованием в области информатики. Студенты-биологи смогут получить навыки программирования, обработки и анализа данных. Студенты-информатики научатся применять свои знания для разработки новых вычислительных методов и их использованию для решения важных биологических задач. При этом, всех студентов мы учим находить общий язык друг с другом и тому, как интеграция экспериментальных и вычислительных методов позволяет внести вклад в развитие наук о жизни.
Выпускники программы будут иметь глубокое понимание процесса исследования в современной биоинформатике: от планирования эксперимента до анализа экспериментальных данных, их интерпретации и формирования проверяемых биологических гипотез.
Обучение подразумевает выбор одной из двух специализаций:
Анализ данных в биологии и медицине: обучение студентов биологических и медицинских специальностей навыкам программирования, обработки данных и статистического анализа и их применению для решения задач в различных областях системной биологии.
Алгоритмы в биоинформатике: обучение студентов информатических, математических и других технических специальностей применению их знаний в биоинформатике, в том числе углубленным курсам по статистике, алгоритмам и структурам данных, а также вводным курсам по биологии.
Подробности на сайте Университета ИТМО
Программа рассчитана как на абитуриентов биологических специальностей, так и с образованием в области информатики. Студенты-биологи смогут получить навыки программирования, обработки и анализа данных. Студенты-информатики научатся применять свои знания для разработки новых вычислительных методов и их использованию для решения важных биологических задач. При этом, всех студентов мы учим находить общий язык друг с другом и тому, как интеграция экспериментальных и вычислительных методов позволяет внести вклад в развитие наук о жизни.
Выпускники программы будут иметь глубокое понимание процесса исследования в современной биоинформатике: от планирования эксперимента до анализа экспериментальных данных, их интерпретации и формирования проверяемых биологических гипотез.
Обучение подразумевает выбор одной из двух специализаций:
Анализ данных в биологии и медицине: обучение студентов биологических и медицинских специальностей навыкам программирования, обработки данных и статистического анализа и их применению для решения задач в различных областях системной биологии.
Алгоритмы в биоинформатике: обучение студентов информатических, математических и других технических специальностей применению их знаний в биоинформатике, в том числе углубленным курсам по статистике, алгоритмам и структурам данных, а также вводным курсам по биологии.
Подробности на сайте Университета ИТМО
Курсы
Профильные
Общие (для обеих специализаций):
Введение в биоинформатику/ Introduction to Bioinformatics
Системная биология/ Systems Biology
Медицинская генетика/ Medical Genetics
Прикладная биоинформатика/ Applied Bioinformatics
Прикладная статистика/ Applied Statistics
Программирование на языке Python для научных задач/ Scientific Python
Структурная биоинформатика/ Structural Bioinformatics
Высшая математика/ Higher Mathematics (факультатив)
Введение в Linux/ Introduction to Linux (факультатив)
Анализ данных в биологии
Статистика/ Statistics
Дискретная математика/ Discrete Mathematics
Программирование на языке Python/ Programming in Python
Биотехнологии/ Biotechnology
Сравнительная геномика/ Comparative genomics
Омиксные технологии микроорганизмов/ Microbial Omics
Алгоритмы в биоинформатике
Статистика (углубленный курс)/ Advanced Statistics
Алгоритмы и структуры данных/ Algorithms and Data Structures
Молекулярная биология/ Molecular Biology
Алгоритмы в биоинформатике/ Bioinformatics Algorithms
Оптимизация и сэмплирование/ Optimization and Sampling
Машинное обучение (углубленный курс)/ Advanced Machine Learning
Общеуниверситетские
Обработка и анализ данных/ Data Processing and Analysis
Прикладной искусственный интеллект/ Applied Artificial Intelligence
Мировоззренческий модуль (на выбор): Креативные технологии/ Creative Technologies, Создание технологического бизнеса/ High Tech Business Creation, Мышление (Мышление и научная рациональность)/ Thinking (Conceptual Analysis of Trends in Science Today)
Soft Skills (на выбор): Переговоры, управление конфликтом и техники влияния/ Negotiations, Influence and Conflict Management, Эмоциональный интеллект/ Emotional Intelligence, Основы организации международных научных исследований/ International Research Management Essentials, Жизнь в науке: путеводитель молодого исследователя/ Life in Science – Guide for Young Researchers
Иностранный язык в профессиональной деятельности/ Foreign Language in Professional Activity
Общие (для обеих специализаций):
Введение в биоинформатику/ Introduction to Bioinformatics
Системная биология/ Systems Biology
Медицинская генетика/ Medical Genetics
Прикладная биоинформатика/ Applied Bioinformatics
Прикладная статистика/ Applied Statistics
Программирование на языке Python для научных задач/ Scientific Python
Структурная биоинформатика/ Structural Bioinformatics
Высшая математика/ Higher Mathematics (факультатив)
Введение в Linux/ Introduction to Linux (факультатив)
Анализ данных в биологии
Статистика/ Statistics
Дискретная математика/ Discrete Mathematics
Программирование на языке Python/ Programming in Python
Биотехнологии/ Biotechnology
Сравнительная геномика/ Comparative genomics
Омиксные технологии микроорганизмов/ Microbial Omics
Алгоритмы в биоинформатике
Статистика (углубленный курс)/ Advanced Statistics
Алгоритмы и структуры данных/ Algorithms and Data Structures
Молекулярная биология/ Molecular Biology
Алгоритмы в биоинформатике/ Bioinformatics Algorithms
Оптимизация и сэмплирование/ Optimization and Sampling
Машинное обучение (углубленный курс)/ Advanced Machine Learning
Общеуниверситетские
Обработка и анализ данных/ Data Processing and Analysis
Прикладной искусственный интеллект/ Applied Artificial Intelligence
Мировоззренческий модуль (на выбор): Креативные технологии/ Creative Technologies, Создание технологического бизнеса/ High Tech Business Creation, Мышление (Мышление и научная рациональность)/ Thinking (Conceptual Analysis of Trends in Science Today)
Soft Skills (на выбор): Переговоры, управление конфликтом и техники влияния/ Negotiations, Influence and Conflict Management, Эмоциональный интеллект/ Emotional Intelligence, Основы организации международных научных исследований/ International Research Management Essentials, Жизнь в науке: путеводитель молодого исследователя/ Life in Science – Guide for Young Researchers
Иностранный язык в профессиональной деятельности/ Foreign Language in Professional Activity
Формат
Программа очная, обучение проводится в течение двух лет полностью на английском языке.
Студентам будет предоставлена возможность проходить стажировки в ведущих российских и зарубежных центрах, таких как международная лаборатория «Компьютерные технологии» Университета ИТМО, ФГБУ «НМИЦ им. В. А. Алмазова» Минздрава России, Washington University in St. Louis, Broad Institute, George Washington University, University of Nice-Sophia Antipolis и ряде других.
Первый набор студентов состоялся в 2018 году.
Студентам будет предоставлена возможность проходить стажировки в ведущих российских и зарубежных центрах, таких как международная лаборатория «Компьютерные технологии» Университета ИТМО, ФГБУ «НМИЦ им. В. А. Алмазова» Минздрава России, Washington University in St. Louis, Broad Institute, George Washington University, University of Nice-Sophia Antipolis и ряде других.
Первый набор студентов состоялся в 2018 году.
Научная работа
Студенты программы работают над реальными научно-исследовательскими проектами на протяжении всех двух лет обучения, чтобы к концу магистратуры иметь дипломный проект высокого уровня.
1 семестр: вводные групповые проекты
2 семестр: индивидуальные курсовые проекты
3-4 семестр: дипломные проекты
Важно, что на каждом этапе можно как продолжить, так и сменить проект. Научными руководителями студентов являются российские и зарубежные специалисты в области биоинформатики и системной биологии.
Примеры курсовых проектов
Примеры дипломных проектов
1 семестр: вводные групповые проекты
2 семестр: индивидуальные курсовые проекты
3-4 семестр: дипломные проекты
Важно, что на каждом этапе можно как продолжить, так и сменить проект. Научными руководителями студентов являются российские и зарубежные специалисты в области биоинформатики и системной биологии.
Примеры курсовых проектов
Примеры дипломных проектов
Поступление
Набор в магистратуру открывается ежегодно весной.
Варианты вступительных испытаний и даты:
Мегаолимпиада ИТМО (трек Молекулярная биология и/или Математическое моделирование).
Конкурс «Портфолио» Университета ИТМО.
Вступительный экзамен. Включает в себя вопросы по биологии и математике/ программированию.
Подача документов осуществляется через информационную систему приемной комиссии Университета ИТМО. Подробнее о сроках поступления в текущем году и заполнению документов можно прочитать на сайте ИТМО.
На программе 16 бюджетных и 5 контрактных мест.
Варианты вступительных испытаний и даты:
Мегаолимпиада ИТМО (трек Молекулярная биология и/или Математическое моделирование).
Конкурс «Портфолио» Университета ИТМО.
Вступительный экзамен. Включает в себя вопросы по биологии и математике/ программированию.
Подача документов осуществляется через информационную систему приемной комиссии Университета ИТМО. Подробнее о сроках поступления в текущем году и заполнению документов можно прочитать на сайте ИТМО.
На программе 16 бюджетных и 5 контрактных мест.
Контакты
Подробности программы и поступления на официальном сайте программы, сайте Университета ИТМО и в группе ВКонтакте.
Связаться с кураторами программы можно по почте bioinf@itmo.ru.
Связаться с кураторами программы можно по почте bioinf@itmo.ru.
В чем разница между программой переподготовки Института биоинформатики и магистратурой ИТМО?
Разница между программами состоит в следующем:
Мы советуем:
Если вам не нужен сразу статус студента-магистранта, мы советуем сначала учиться в Институте биоинформатики, а потом идти в магистратуру ИТМО. В этом случае часть курсов у вас будет перезачтена, что освободит больше времени для научной работы. Вы уже попробуете несколько проектов и сможете определиться с интересующей темой, плюс войдете в биоинформатическое сообщество.
Обучение на двух программах последовательно может дополнить образование в биоинформатике по выбранному направлению
- Время обучения. Длительность обучения в Институте один год, в ИТМО — два года.
- Программа. Большая часть содержания курсов пересекается, в т.ч. и преподавателями. Однако, в отличие от магистратуры, в Институте биоинформатики мы не добавляем в программу общеобразовательных курсов.
- Научная работа. В Институте есть возможность выполнять учебные проекты, научный проект и взять летнюю стажировку на другую тему. В ИТМО студенты выполняют два научных проекта и дипломную работу.
- Язык. Обучение в Институте ведется на русском языке, в ИТМО — на английском.
- Диплом. По окончании Института биоинформатики вы получите диплом о профессиональной переподготовке. В ИТМО выдается диплом магистра.
Мы советуем:
Если вам не нужен сразу статус студента-магистранта, мы советуем сначала учиться в Институте биоинформатики, а потом идти в магистратуру ИТМО. В этом случае часть курсов у вас будет перезачтена, что освободит больше времени для научной работы. Вы уже попробуете несколько проектов и сможете определиться с интересующей темой, плюс войдете в биоинформатическое сообщество.
Обучение на двух программах последовательно может дополнить образование в биоинформатике по выбранному направлению
Подписаться на новости Института биоинформатики
Previous
Образование
Next
Наука
© Bioinformatics Institute