Интенсив по анализу данных NGS

6–8 декабря 2018 | Санкт-Петербург

Набор на интенсив закрыт
Три дня интенсивной практики по обработке геномных данных и нетворкинга для научных сотрудников лабораторий и компаний
Подписаться на новости Института биоинформатики
Программа
1
Базы данных
Что и где искать, какие полезные онлайн-сервисы существуют
2
Пайплайны и форматы
Форматы данных и их отличия на разных этапах анализа
3
Оценка качества ридов и выравнивания
Какие программы используют и на какие метрики следует обратить внимание
4
Сборка и аннотация генома, оценка качества
Как собрать de novo геном из коротких ридов и найти в нем гены
5
Выравнивание коротких фрагментов и SNP-calling
Как найти однонуклеотидные замены в коротких ридах
6
Дифференциальная экспрессия генов
Как сравнивать между собой два результата RNA-seq
7
Визуализация данных
Как нарисовать красивые картинки из имеющихся данных или посмотреть на геномное выравнивание
Подробное расписание | Версия для печати

Для кого
Для всех, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.

В первую очередь приглашаются исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, аннотации генов, поиске вариаций и других.

Ожидания от участников

  • Интерес к биоинформатике и анализу данных
  • Знания в молекулярной биологии
  • Умение работать в командной строке Linux или желание быстро её освоить на вводном онлайн-курсе
  • Наличие ноутбука для работы на практических занятиях
        Формат
        Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке. Занятия проходят с 10:00 до 18:00 в бизнес-центре «Таймс». По вечерам — полезный нетворкинг.

        Также, для участников будет организован поддерживающий вебинар с приглашёнными специалистами. Дата вебинара будет объявлена дополнительно.

        Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть по ссылке.

              Организационные взносы
              • Студенческий — 10 000 рублей (студентам очных форм обучения)
              • Академический —15 000 рублей (аспирантам и сотрудникам государственных организаций)
              • Корпоративный — 25 000 рублей (сотрудникам коммерческих компаний)

              Взнос покрывает участие, материалы, кофе-брейки, один вебинар, фуршет и обед в заключительный день. Обеды в первый и второй день участники оплачивают самостоятельно.

              За прохождение онлайн-курса и подачу анкеты до 31 октября предоставляется скидка 10%.
              Студентам и выпускникам Института биоинформатики скидка 30%. Скидки не суммируются и предоставляются только при условии оплаты в течение 5 дней с момента получения счёта.
                Принять участие
                Приём заявок на интенсив 2018 завершён 15 ноября, все места заняты. Подписывайтесь на новости Института, чтобы не пропустить следующие запуски.

                Участники 2018
                1. Авдюнина Полина, МГУ им. М.В. Ломоносова
                2. Аксенова Татьяна, ВНИИСХМ
                3. Балкин Александр, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза
                4. Барановская Марианна, ЗАО BIOCAD
                5. Бодров Семен, ЗИН РАН
                6. Бражник Евгений, ООО "БИОТРОФ"
                7. Григоров Артем, ИБХ РАН
                8. Диденко Антон, СПбПУ
                9. Ефименко Богдан, БФУ им. И. Канта
                10. Желудкевич Анна, ООО"Геномед"
                11. Клименко Елизавета, ЛИН СО РАН
                12. Козин Максим, ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
                13. Колчина Нина, НИК НаноБио
                14. Комиссаров Андрей, ФГБУ НИИ Гриппа
                15. Короткова Дарья, МГУ им. М.В. Ломоносова / ИБХ РАН
                16. Макаревич Анна, Институт цитологии и генетики НАН Беларуси
                17. Певзнер Алина, ТНИМЦ НИИ онкологии
                18. Петрова Татьяна, ЗИН РАН
                19. Пинахина Дарья, ФГУП ВСЕГЕИ
                20. Суарес Веласкес Хосе Андрес, Университет ИТМО
                21. Сысоев Максим, Институт Экспериментальной Медицины
                22. Тужилкина Татьяна, Северо-западный центр доказательной медицины
                23. Хворых Геннадий, Геномед
                24. Царев Александр, СПбГУ
                25. Челушкин Максим, МГУ им. М.В. Ломоносова
                26. Червова Альмира, НМИЦ ДГОИ им. Д.Рогачева
                Подписаться на новости Института биоинформатики
                Преподаватели
                Юрий Барбитов
                Институт биоинформатики
                Михаил Райко
                СПбГУ
                Евгений Бакин
                Институт биоинформатики
                Алексей Гуревич
                Центр алгоритмической биотехнологии СПбГУ
                Константин Зайцев
                Washington University in Saint Louis / Университет ИТМО
                Илья Корвиго
                Университет ИТМО / ВНИИСХМ/ Ksivalue
                Оксана Станевич
                НИИ ДОГиТ им. Р.М. Горбачёвой
                Партнеры
                Место проведения и контакты
                Санкт-Петербург
                ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»

                По всем вопросам:
                info@bioinf.me

                Интенсив по анализу данных NGS 2018