Интенсив по анализу данных NGS

6 – 8 декабря 2018 | Санкт-Петербург

Три дня интенсивной практики по обработке геномных данных и нетворкинга для научных сотрудников лабораторий и компаний
УЧАСТВОВАТЬ

Пройти вводный онлайн-курс

Зарегистрироваться и пройти онлайн-курс для подготовки
Заполнить анкету до 15/11

Анкету участника получат все прошедшие онлайн-курс.
Оплатить взнос

Чтобы гарантировать место на интенсиве
Программа
1
Базы данных
Что и где искать, какие полезные онлайн-сервисы существуют
2
Пайплайны и форматы
Форматы данных и их отличия на разных этапах анализа
3
Оценка качества ридов и выравнивания
Какие программы используют и на какие метрики следует обратить внимание
4
Сборка и аннотация генома, оценка качества
Как собрать de novo геном из коротких ридов и найти в нем гены
5
Выравнивание коротких фрагментов и SNP-calling
Как найти однонуклеотидные замены в коротких ридах
6
Дифференциальная экспрессия генов
Как сравнивать между собой два результата RNA-seq
7
Визуализация данных
Как нарисовать красивые картинки из имеющихся данных или посмотреть на геномное выравнивание
Для кого
Для всех, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.

В первую очередь приглашаются исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, аннотации генов, поиске вариаций и других.

Ожидания от участников

  • Знания в молекулярной биологии
  • Умение работать в командной строке Linux или желание быстро её освоить на вводном онлайн-курсе
  • Наличие ноутбука для работы на практических занятиях
        Формат
        Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке. Занятия проходят с 10:00 до 18:00 в бизнес-центре «Таймс». По вечерам — полезный нетворкинг.

        Также, для участников будет организован поддерживающий вебинар с приглашёнными специалистами. Дата вебинара будет объявлена дополнительно.

        Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть по ссылке.

              Пройти вводный онлайн-курс и подать заявку можно до 15 ноября.
              Организационные взносы
              • Студенческий — 10 000 рублей (студентам очных форм обучения)
              • Академический —15 000 рублей (аспирантам и сотрудникам государственных организаций)
              • Корпоративный — 25 000 рублей (сотрудникам коммерческих компаний)

              Взнос покрывает участие, материалы, кофе-брейки, один вебинар, приветственный фуршет и обед в заключительный день. Обеды в первый и второй день участники оплачивают самостоятельно.

              Количество мест ограничено. Для того чтобы гарантировать место, оплатить необходимо в течение 5 дней после получения реквизитов. Приём анкет и оплат будет закрыт, как только наберётся группа. Мы рекомендуем не оставлять прохождение курса на последний момент.
              Договор оферты для физических лиц.

              Скидки

              За прохождение онлайн-курса и подачу анкеты до 31 октября предоставляется скидка 10%.
              Студентам и выпускникам Института биоинформатики скидка 30%. Скидки не суммируются.
                Подтверждённые преподаватели
                Юрий Барбитов
                Институт биоинформатики
                Михаил Райко
                СПбГУ
                Евгений Бакин
                Институт биоинформатики
                Алексей Гуревич
                Центр алгоритмической биотехнологии СПбГУ
                Константин Зайцев
                Washington University in Saint Louis / Университет ИТМО
                Как стать участником
                1. Пройти вводный онлайн-курс.

                Прохождение курса позволит освежить или приобрести навыки работы в командной строке, познакомиться с языком R и особенностями технологий секвенирования. Эти знания понадобятся для работы на интенсиве. Если вы уже ими владеете, курс не отнимет много времени.

                2. Заполнить анкету.

                Анкета участника придёт на указанный при регистрации на Stepik электронный адрес всем, кто пройдёт онлайн-курс.

                3. Оплатить организационный взнос.

                Вы получите детали оплаты сразу после отправки анкеты на указанный в ней электронный адрес. Для подготовки документов для юридических лиц потребуются реквизиты вашей организации. Если вы не можете оплатить в течение 5 дней, вы можете предоставить гарантийное письмо на бланке организации. В противном случае, место будет передано следующему кандидату.
                      Пройти вводный онлайн-курс и подать заявку можно до 15 ноября.
                      Партнеры
                      Место проведения и контакты
                      Санкт-Петербург
                      ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»

                      По всем вопросам:
                      info@bioinf.me

                      Интенсив по анализу данных NGS 2018

                      Пройти онлайн-курс и подать заявку можно до 15 ноября.