Гостевые лекции


Институт биоинформатики организует в Санкт-Петербурге открытые лекции с приглашёнными экспертами. Посещение бесплатное для всех желающих.

Если вы хотите выступить с лекцией, пожалуйста, напишите на info@bioinf.me.
Ближайшие лекции
В настоящее время гостевых лекций не ожидается.
Место проведения
Санкт-Петербург
ул. Кантемировская 2А, бизнес-центр «Таймс», 4 этаж.


По всем вопросам:
info@bioinf.me
Прошедшие лекции
Сергей Аганезов. Секвенирование и анализ раковых геномов: прошлое, настоящее, и будущее

О чем была речь

Рак — соматический эволюционный процесс, в ходе которого делящиеся клетки постепенно накапливают генетические мутации, и в конечном итоге образовывают злокачественные неоднородные клеточные образования.

В лекции были рассмотрены

Лектор рассмотрел базовые модели крупных структурных генетических изменений раковых геномов, их влияние на строения мутированных хромосом, а также на роль клеточной неоднородности при раковых образованиях.

Во второй части лекции Сергей рассказал про подходы и методологии для идентификации генетических мутаций различного типа и выявляемых между ними различий. На конкретном примере анализа клеток рака груди были рассмотрены преимущества и недостатки методологий обнаружения генетический мутаций, а также интеграция различных типов генетических мутаций для получения детальных кариотипов перестроенных раковых геномов.

В заключении лектор рассмотрел существующие открытые алгоритмические проблемы в области анализа раковых мутаций и анализа строения раковых геномов.

О лекторе

Сергей Аганезов — постдок Университета Джонcа Хопкинса.

Лекция состоялась 27 июня 2019 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Видео
Слайды

Дополнительно:
Some articles for mutation detection in cancer. Further articles can be found in reference lists of the mentioned ones.

Single Nucleotide Polymorphisms
  • Comprehensive benchmarking of SNV callers for highly admixed tumor data (link)
  • The Role of Single Nucleotide Polymorphisms in Predicting Prostate Cancer Risk and Therapeutic Decision Making (link)

Structural Variations (Novel Adjacencies)
  • Patterns and mechanisms of structural variations in human cancer (link)
  • Diverse Mechanisms of Somatic Structural Variations in Human Cancer Genomes (link)
  • Complex rearrangements and oncogene amplifications revealed by long-read DNA and RNA sequencing of a breast cancer cell line (link)
  • Integrative detection and analysis of structural variation in cancer genomes (link)

Copy Number Aberrations
  • TITAN: inference of copy number architectures in clonal cell populations from tumor whole-genome sequence data (link)
  • The evolutionary history of lethal metastatic prostate cancer (link)
  • Accurate quantification of copy-number aberrations and whole-genome duplications in multi-sample tumor sequencing data (link)

Cancer Genomes Karyotype Reconstruction:
  • Reconstruction of clone- and haplotype-specific cancer genome karyotypes from bulk tumor samples (link)

Reference and Structural Variations:
  • Characterizing the Major Structural Variant Alleles of the Human Genome (link)
Дмитрий Мелешко. Облака ридов: PacBio для бедных или что-то большее?

О чем была речь

Облака ридов (Linked-Reads) получают меньше внимания, чем технологии секвенирования длинных ридов. Но если раньше казалось, что у длинных ридов применений попросту больше, то сейчас начинают появляться идеи, уникальные для облаков.

В лекции были рассмотрены

В этой лекции слушатели познакомились с технологией секвенирования облачных ридов на примере 10X Genomics. После этого лектор сделал обзор алгоритмических подходов в применении облаков ридов в задачах вычислительной биологии: прикладывании ридов, сборке геномов, поиске структурных вариаций и других.

О лекторе

Дмитрий Мелешко — аспирант Корнеллского университета, выпускник Института биоинформатики и СПбАУ.

Лекция состоялась 22 марта 2019 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Видео
Слайды
Максим Артёмов. Анализ иммунного ответа на уровне отдельных клеток в ходе иммунотерапии рака

О чем была речь

Противораковая checkpoint-blockade иммунотерапия открыла новый подход к борьбе с раковыми опухолями, однако клинический успех далёк от идеального.

В лекции были рассмотрены

Проведённое single-cell РНК-секвенирование раковых опухолей, подвергавшихся checkpoint-blockade иммунотерапии. В основе этой терапии лежит подавление ингибирующего сигнала клеток опухоли, препятствующего естественному иммунному ответу организма. По результатам исследования были описаны детали межклеточной динамики и клеточных трансформаций иммунных клеток в случаях, когда опухоль отторгалась и когда убивала организм.

О лекторе

Максим Артёмов — профессор в Университете Вашингтона в Сент-Луисе

Лекция состоялась 6 февраля 2019 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.
Яна Сафонова. Биоинформатика в иммунологии: вычислительный анализ адаптивных иммунных репертуаров

О чем была речь

Адаптивная иммунная система позволяет организму приобретать защиту от разнообразных патогенов и сохранять ее при повторных заболеваниях. Основная сложность изучения адаптивного иммунитета связана с тем, что основные его агенты (В и Т-клеточные рецепторы) не закодированы в геноме напрямую, а являются результатом соматической рекомбинации генов. Рекомбинация не только обеспечивает максимальное разнообразие иммунных рецепторов, но и делает адаптивный иммунитет уникальным для каждого человека.

Развитие технологий секвенирования в начале 2010-х годов позволило сканировать индивидуальные репертуары иммунных рецепторов, что, в свою очередь, вызвало необходимость разработки вычислительных методов для обработки данных иммуносеквенирования. Недавние исследования показали эффективность использования таких данных при анализе предрасположенности к заболеваниям, оценке эффективности вакцин и разработке лекарств. Благодаря этим достижениям иммуноинформатика стала одним из самых приоритетных направлений в персональной медицине.

В лекции были рассмотрены

Базовые вычислительные задачи, связанные с анализом данных иммуносеквенирования, и их приложения в медицине и фармацевтике, а также будущие направления развития иммуноинформатики.

О лекторе

Яна Сафонова — постдок Калифорнийского университета в Сан-Диего.

Лекция состоялась 25 декабря 2018 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Слайды
Видео
Виктор Петухов. P-values: как посчитать достоверность вашего исследования, а точнее, как не нужно этого делать

О чем была речь

P-values используются повсеместно как доказательство научности того или иного утверждения. За последние 40 лет было опубликовано множество статей, призывающих изменить научные практики и отказаться от проверки гипотез в том виде, в котором она есть сейчас. Более того, смысл, вкладываемый в p-values Рональдом Фишером, популяризовшим их в начале прошлого века, сильно отличался от современной интерпретации. Тем не менее, до сих пор каждый день публикуются статьи, 99% математики в которых состоит из бездумной проверки длинного списка статистических гипотез.

В лекции были рассмотрены

Моменты, когда можно, а когда нельзя применять p-values, грабли, густо разложенных в поле принятия решений на основании статистических гипотез, а также даны советы о том, как построить светлый мир, в котором нет слов "Утверждение значимо на уровне 0.05".

О лекторе

PhD студент в University of Copenhagen по направлению "Biostatistics and bioinformatics". Занимается анализом данных single-cell RNA-seq в Khodosevich lab, а также разработкой методов для обработки RNA-seq и spatial данных в коллаборации с Peter Kharchenko lab (Harvard Medical School).

Лекция состоялась 24 октября 2018 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Слайды
Видео
Алексей Абызов. Определение и анализ соматических мутаций в клетках человека

О чем была речь

О наличии геномных изменений в отдельных клетках человеческого организма, то есть о наличии соматических мутаций, было известно давно. Но только всего несколько лет назад, благодаря развитию целого ряда биотехнологий, их изучение приобрело массовость и системность.

В лекции были рассмотрены

• Исследования в определении геномных изменений в кожных клетках фибробластах
• Исследования в определении геномных изменений в стволовых клетках прародителях нейронов
• Технологии и подходы, позволяющие изучение геномных изменений в отдельных клетках
• Сравнение обсуждаемых подходов и технологий

О лекторе

Абызов Алексей Николаевич, выпускник МФТИ 2002 года, д. ф.-м.н., заведующий научной лабораторией в клинике им. Майо, ассистент-профессор в медицинском колледже при клинике им. Майо, приглашённый профессор в университете Миннесота, приглашённый профессор в Йельском университете. Защитил Ph.D. в Северовосточном университете (Northeastern University) в 2008 году. В 2008-2013 годах работал научным сотрудником в Йельском университете (Yale University). С 2014 года возглавляет научную лабораторию при клинике им. Майо (Mayo Clinic). Основное направление научной деятельности (www.abyzovlab.org) – геномные изменения и вариации, их происхождение и влияние на здоровье и биологическое разнообразие.

Лекция состоялась 6 июля 2017 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Никита Артемов. Medical genetics. From gene discovery to clinical decision making

О чем была речь

Основная цель медицинской генетики - способствовать открытию новых методов терапии и клинического прогноза. В процессе лекции мы пройдем через основные научные открытия, которые сформировали современный аппарат экспериментальных и вычислительных методов. Как далеко современное положение вещей от поставленной цели и как все-таки ее достичь. А также на реальных примерах посмотрим к чему приводит правильное и неправильное использование статистических методов в генетике.

Для кого

Лекция предназначена для интересующихся генетикой, как биоинформатиков так и молекулярных биологов. Мы будем говорить и об экспериментальной и о вычислительной науке, поэтому, надеюсь, каждый найдет для себя интересное.

О лекторе

Никита Артемов, PhD - постдок в группе Марка Дейли (Mark Daly) в Analytic and Translational Genetics Unit, Massachusetts General Hospital / Broad Institute. Специализируется на анализе NGS данных, в частности, изучении врожденной предрасположенности к раковым заболеваниям и разработкой методов для функциональной интерпретации ассоциативных исследований. Закончил аспирантуру в Harvard University.


Лекция состоялась 19 мая 2017 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 2 этаж.
Артур Залевский. Жизнь — боль. Трехмерная боль

О чем была речь

NGS перевернул мир биоинформатики, завалив исследователей огромным количеством данных. В попытке переварить лавины информации в ход идут все доступные средства - от статистики до глубокого машинного обучения. К сожалению, за ширмой бесконечных цифр и графиков нередко теряются конкретные биологические и химические механизмы. А ведь биологические молекулярные машины - одни из самых удивительных и прекрасных созданий эволюции.

В процессе беседы мы обсудим как структурная биоинформатика перешагнула порог от описательной науки к инженерной. При помощи каких инструментов можно превратить белки и даже ДНК в конструтор. Чем забить очередь суперкомпьютера и, внезапно, получить большие данные (sic!).

А также на небольшом практическом примере попробуем проложить мост между мирами биоинформатики последовательностей и структур.

О лекторе

Артур Залевский - аспирант Факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ им. М. В. Ломоносова. Специализируется на структурной биоинформатике и высокопроизводительных вычислениях. Помимо основной научной деятельности развивает проект научных стримов Future Biotech Live. Энтузиаст свободного программного обеспечения.


Лекция состоялась 28 апреля 2017 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 2 этаж.

Виктор Петухов. Single-cell RNA sequencing: современные методы и области применения

О чем была речь

На настоящий момент РНК-секвенирование является основным инструментом анализа генной экспрессии. В 2011 году подобный анализ стал возможен для отдельных клеток внутри одного организма (single-cell RNA-sequencing). С тех пор технология scRNA-seq применяется в таких задачах, как изучение регуляции генов и дифференцировки клеток, а также для анализ клеточных субпопуляций. Кроме того, важным направлением развития области является увеличение производительности секвенаторов, и благодаря успехам здесь, размеры датасетов (то есть число клеток, используемых для анализа) растут с каждым годом. В этой обзорной лекции Виктор расскажет о технологиях, используемых в настоящее время для РНК-секвенирования, а также об областях их применения и некоторых интересных методах, разработанных в последние годы.

О лекторе

Магистр СПбПУ по направлению "Биоинформатика", сотрудник EPAM Systems. Выполняет научную работу по анализу данных scRNA-seq на Harvard Medical School, Peter Kharchenko Lab.


Лекция состоялась 15 февраля 2017 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Михаил Садовский. Удивительная синхрония в эволюции нуклеарных и митохондриальных геномов

О чем была речь

Современная биоинформатика пошла по «жадному» пути: исследователи пытаются отыскать множество конкретных и специфических фактов из жизни генов и геномов, слишком часто пренебрегая общими ограничениями и неоправданно игнорируя необходимость доказательства наиболее общих утверждений. В частности, это приводит к тому, что такая сравнительно хорошо проработанная область биоинформатики, как изучение частотных словарей, всё равно страдает от недостатка теорем и теоремоподобных утверждений, накладывающих принципиальные ограничения на те эффекты, которые можно на них наблюдать.

Напротив, мы стараемся получить так много знания о символьных последовательностях, соответствующих геномам (либо иным генетическим «единичкам»), как можно, без привлечения дополнительного, внешнего знания о свойствах этих самих последовательностей.

Пример такого подхода и некоторые результаты будут представлены на лекции. Если совсем кратко, то мы рассмотрим корреляции между кластерами, в которые «сбиваются» геномы митохондрий исключительно на основе знаний о частотах триплетов (sic!) и филогенией их носителей. Эта корреляция (и очень сильная) и доказывает факт «удивительной синхронии»: близкие по структуре геномы оказываются близкими и по филогении. Всё бы ничего, да только близость структур определялась по геномам митохондрий, а филогенетическая — по морфологии...


О лекторе

Родился в Ленинграде (конкретно — в Пулково, не в аэропорту), живет в Красноярске. Работает ведущим научным сотрудником в Институте вычислительного моделирования СО РАН. В определённых кругах гораздо более известен как многолетний организатор Красноярской летней школы.


Лекция состоялась 21 декабря 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 2 этаж.

Мария Зуева. Референсный геном в виде графа как «геномный паспорт» человечества

О чем была речь

Одним из величайших достижений человечества стала расшифровка генома человека в 2003 году. С тех было секвенировано более 250 000 тысяч человек, и это число удваивается каждый год. Гаплоидный геном не позволяет адекватно отразить весь объем быстрорастущей информации, выходом является референс в виде графа, построенного таким образом, чтобы геном каждого человека мог быть представлен в виде пути в этом графе.

Отражение геномной информации в единой структуре данных – серьезный научный вызов. Решение данной задачи принесет плоды в различных областях современной биоинформатики, но прежде всего в популяционной генетике и поиске новых мутаций.


Лекция состоялась 25 октября 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Михаил Колмогоров.Секвенирование нанопорами: от ДНК до белковых последовательностей

О чем была речь

В последние годы технология секвенирования ДНК с помощью нанопор успешно применяется в различных исследованиях, включая как анализ с помощью референса, так и сборку de novo. Несмотря на большое количество ошибок в ридах, простота и дешевизна эксперимента делает технологию привлекательной для многих задач. С другой стороны, секвенирование белковых последовательностей до сих пор оставалось нерешенной проблемой. В этой лекции я расскажу о технологии и сопутсвующих алгоритмах для секвенирования ДНК с помощью нанопор, а также про применение нанопор для анализа белков.


Лекция состоялась 13 октября 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 2 этаж.
Александр Тискин. Полулокальное и локальное выравнивание последовательностей

О чем была речь

Вычисление наибольшей общей подпоследовательности (longest common subsequence, LCS) двух строк — одна из классических алгоритмических задач, имеющая широкое применение как в информатике, так и в вычислительной биологии, где она известна как «глобальное выравнивание последовательностей». Во многих приложениях необходимо обобщение этой задачи, которое мы называем вычислением полулокальной LCS (semi-local LCS), или «полулокальным выравниванием». В этом случае требуется вычислить LCS между строкой и всеми подстроками другой строки, и/или между всеми префиксами одной строки и всеми суффиксами другой. Помимо важной роли этой обобщенной задачи в строковых алгоритмах, у нее обнаруживаются неожиданные связи с алгеброй полугрупп и вычислительной геометрией, с сетями сравнений (comparison networks), а также практические применения в вычислительной биологии. Кроме того, задача вычисления полулокальной LCS может использоваться в качестве гибкого и эффективного подхода к точному локальному выравниванию биологических последовательностей.


Лекция состоялась 27 сентября 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Илья Минкин. Граф де Брюина и сравнительная геномика

О чем была речь

Граф де Брюина широко используется в бионформатике для сборки генома. В последнее время эта модель находит применение и для сравнительного анализа последовательностей. В лекции пойдет речь о том как граф де Брюина используется в сравнительной геномике и как построить такой граф для большого числа длинных геномов.

Лекция состоялась 16 сентября 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 2 этаж.

Максим Артемов. Метаболическая регуляция иммунного ответа

О чем была речь

Ответные реакции имунных клеток регулируются с помощью широкого набора внутриклеточных механизмов: от фосфорилирования белков сигнальных путей до последовательной активации транскрипционных факторов и эпигенетических изменений в клетках. Долгое время метаболизм рассматривался исключительно с точки зрения энергетических и строительных нужд клеточного цикла. В последние несколько лет были открыты новые функции метаболитов — как регуляторов клеточных сигналов, в частности как регуляторов иммунного ответа. В своей лекции Максим рассмотрел современные представления о метаболитах как регуляторах клеточного иммунного ответа, и, в частности, о новом метаболите — итаконате — который регулирует активацию клеток врожденной иммунной системы: дендритных клеток и макрофагов.

О лекторе

Maxim Artyomov is an Assistant Professor at Immunology & Pathology Department of Washington University in St.Louis. Dr. Artyomov's lab applies next generation sequencing and novel computational techniques to address fundamental questions in immunology. His recent work is devoted to development of high-throughput RNA-seq approaches and applications of this technology to uncover relation between genes implicated in autoimmunity through genome-wide association studies. Dr. Artyomov obtained his PhD from MIT at 2009 working at Arup Chakraborty's lab where he studied stochastic behavior in the signal transduction networks at early stages of T-cell activation. For his postdoctoral studies Dr. Artyomov joined Broad Institute of MIT and Harvard, working with Aviv Regev to explore (both experimentally and computationally) the transcriptional networks that govern activation of dendritic cells in response to immune stimuli. Dr. Artyomov also serves as Co-Chair of Scientific Advisory Board (along with Doug Lauffenburger) for Cambridge based Immuneering Inc.

Лекция состоялась 22 мая 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.
Василий Раменский. В поисках генетической основы сложных признаков у человека и приматов

О чем была речь

Наше понимание геномных данных значительно отстает от современных возможностей производить эти данные. Интерпретация и предсказание функционального эффекта для полного спектра геномных вариантов является важнейшим шагом в поиске генетической основы сложных фенотипов и критически важно для персонализированной медицины. Долгосрочные проекты нашего центра включают в себя геномные исследования колонии зеленых мартышек, важнейшего модельного организма в ряду приматов, синдрома Туретта, а также поиск генетических факторов, отвечающих за метаболические фенотипы.

На лекции Василий опишет текущее состояние этих проектов, а также планы развития методов анализа современных масштабных биологических данных.

О лекторе

Выпускник физического факультета МГУ, кандидат физ.-мат. наук по специальности "Молекулярная биология". С 1996 сотрудник лаборатории биоинформатики и системной биологии Института молекулярной биологии им. Энгельгардта РАН. С 2010 г. по настоящее время работает в центре нейрогенетики университета Калифорнии в Лос-Анджелесе. Область научных интересов -- разработка и применение методов биоинформатики для поиска функционального полиморфизма генома человека; соавтор ряда пионерских работ в этой области.

Лекция состоялась 22 марта 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Запись лекции


Татьяна Татаринова. Вперёд в прошлое. Методы генетического анализа древних ДНК

О чем была речь

Древние геномы - это доступный лифт в прошлое, без которого эволюционная генетика была бы куда менее увлекательна и информативна. Однако, анализ останков древних геномов осложнён фрагментарным количеством деградированной ДНК с крайне вариабельным покрытием.

О лекторе

PhD, профессор, Школа Медицины Кека, Университет Южной Калифорнии, Директор лаборатории вычислительной биологии, Детский госпиталь, Лос-Анджелес, США.

Лекция состоялась 15 марта 2016 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.
Олег Яснев. Биоинформатик в тридевятом царстве или двое программистов из ларца KNIME

О чем была речь

Несмотря на несерьезное название, на лекции разговор пойдет о важной проблеме в работе биоинформатика, почти любая реальная задача которого связана с обработкой и анализом больших данных. И решить задачу нужно не только правильно, но и эффективно. Процесс решения можно условно разделить на две части: «придумать», как решать, и «обучить» этому компьютер. И на лекции речь пойдет именно об эффективном «обучении».

Наивно реализованные алгоритмы работают неприемлемо долго, когда дело доходит до гигабайтов реальных данных. От биоинформатика уже требуются не просто базовые навыки программирования, но и знание технических нюансов. И даже у профессионального программиста уйдет немало времени, например, чтобы выгодно использовать возможности Hadoop при работе с Big Data. Так можно ли современному ученому обойтись без тщательного изучения кучи языков, библиотек и фреймворков и сосредоточиться именно на решении?

Олег Ясенев расскажет про то, как это сделать, используя KNIME - профессиональную open-source платформу для обработки и анализа данных.

«Несмотря на сложность технологий, выглядит это все как конструктор, в котором можно собирать программы из кирпичиков. Кирпичики бывают на любой вкус и цвет: хотите data mining - пожалуйста, хотите Big Data - не вопрос, хотите биоинформатику - не поверите! Мировое сообщество активно внедряет в KNIME свои инструменты по анализу последовательностей и NGS, масс-спектрометрии, обработке изображений, хемоинформатике и прочему: SeqAn (Knut Reinert), EMBL-EBI Nodes, HCS Tools (Max Planck Institute), Knime4Bio (Pierre Lindenbaum) и другие», - объясняет Олег.

В конце лекции мы узнаем, счастливый ли у этой сказки конец, и причем тут был ларец.


О лекторе

Олег Ясенев окончил Санкт-Петербургский академический университет по направлению «Алгоритмическая биоинформатика» в 2015 году. Сейчас работает в KNIME.com, разрабатывая платформу для промышленного анализа данных и data mining. По мере возможностей помогает биоинформатическим группам в её освоении.

Лекция состоялась 19 декабря 2015 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Запись лекции
Александр Предеус. Зачем биологам суперкомпьютеры: "машина чудес" и истории успеха на стыке биологии, математики и программирования

О чем была речь

Ядерный век прошел, и становится все понятнее, что в фокусе науки 21-го века будут живые системы, медицина, и человек во всех его проявлениях. Здесь осуществляются самые масштабные финансовые вливания, и на эту отрасль человечество возлагает самые большие надежды. Все чаще слышатся предметные обсуждения тем, казавшихся еще недавно научной фантастикой: сможет ли человечество победить старение, рак, и другие смертельные заболевания? Сможет ли менять свой геном по собственному желанию? Будем ли мы хозяевами своим телам в той же мере, как мы хозяйничаем на Земле?

Многие десятилетия биология и медицина развивались как описательные науки. Однако по мере созревания и накопления информации, любая наука рано или поздно переходит на более точный язык - язык математики. Проект "Геном человека" обеспечил технологический прорыв, который будет питать науку о живом еще много лет - но который также поставил много новых глобальных вопросов перед современными учеными.

Александр Предеус рассказал о первых попытках решения этих вопросов.

О лекторе

Александр Предеус закончил Химический факультет МГУ им. Ломоносова в 2003-м году. После этого учился в аспирантуре Michigan State University под руководством William D. Wulff, по результатам чего в 2009-м году получил степень Ph.D. Далее Александр сменил род деятельности, и изучал молекулярную динамику протеинов и комплексов протеинов с ДНК под руководством Michael Feig. C 2012 по 2015-й год изучал биоинформатику высокоэффективного секвенирования (RNA-seq, ChIP-seq) под руководством Максима Артемова в Washington University School of Medicine (St. Louis). С августа 2015-го года Александр возглавляет научную работу в Институте биоинформатики.

Лекция состоялась 8 декабря 2015 г.
Место проведения: Санкт-Петербург, ул. Кантемировская, д. 2, БЦ "Таймс", 4 этаж.

Подписаться на новости Института биоинформатики
Left
Right