Открыт набор на программу 2025/26!

Подано заявок: 50

Онлайн-программа
переподготовки
по биоинформатике

Обучение длится год и проходит онлайн.
Идет набор на направление «Биоинформатика для биологов», группа 60 мест. Ждем ваши заявки!
Формат
Год, по субботам с 10 до 18 МСК и в 1–2 будних вечера,
с начала сентября
по начало июня.
Лекции, семинары, научные проекты, карьерные консультации в онлайн-формате.
Стоимость
81 тысяча рублей в семестр при оплате по семестрам (можно платить полностью или
в рассрочку) или 150 тысяч рублей за оба семестра при единовременной оплате. Абитуриенты могут получить грант, покрывающий 30%. Количество грантов ограничено.
Диплом
При успешном окончании программы выдается диплом о профессиональной переподготовке Института биоинформатики.
В частых вопросах мы описали подробности про каждый этап. Для быстрого ответа на вопросы также есть чат абитуриентов в Telegram.
Поступление
1
Подать заявку
До 16 марта 23:59 МСК
2
Пройти онлайн-курс
До 30 марта 23:59 МСК
3
Решить онлайн-тестирование
3 апреля 19:00 МСК
6 апреля 13:00 МСК
4
Участвовать в собеседовании
С середины апреля по конец мая
Запись дня открытых дверей
Программы по биоинформатике, рассказы студентов и выпускников, ответы на вопросы и детальный рассказ по поступление в этом году.
Ответы про оплату, поступление и многие другие — в FAQ.
Пожалуйста, прочитайте их, прежде чем задать вопрос!
Преимущества обучения
  • 1
    Актуальная программа
    Каждый год мы обновляем программу обучения, следим за развитием технологий и методов анализа данных.
  • 2
    много практики
    Все предметы направлены на получение практических навыков и их отработку.
  • 3
    Научный проект
    Полгода работы над реальными данными под руководством ученых из разных стран с итоговой презентацией результатов.
  • 4
    Публикация результатов
    Сборник тезисов Института
    индексируются в РИНЦ, а оформленный репозиторий с результатами проекта можно добавить в CV.
  • 5
    Помощь в трудоустройстве
    Помогаем оформить CV и карьерные профили, проводим встречи с работодателями, учим писать сопроводительные письма.
  • 6
    Отзывчивые преподаватели
    Команда преподавателей и ассистентов готова объяснять непонятные вещи понятным языком и помогает преодолевать проблемы.
  • 7
    Поддержка кураторов
    У каждого направления есть куратор. Студенты ежегодно оценивают нашу работу и организацию обучения на 9.5 из 10.
  • 8
    Сообщество выпускников
    Можно найти выпускников Института по всему миру, спросить у них совета лично или в закрытом онлайн-сообществе.
  • 9
    Закрытые мероприятия
    Мы проводим закрытые семинары на разные темы и зовем на них студентов и выпускников разных лет.
Требования и мотивация
Требования: что нужно знать, чтобы поступить
«Биоинформатика для биологов» – программа для студентов, аспирантов и выпускников биологических и медицинских специальностей (в т.ч. ветеринаров).

Мы ожидаем систематизированных знаний генетики и клеточной биологии, молекулярных механизмов хранения, передачи и изменения наследственной информации. Вы должны разбираться в принципах и методах генетической инженерии и биотехнологии в целом и уметь читать научные статьи на английском языке.

Как правило, успешные кандидаты — это студенты старших курсов, магистранты и начинающие аспиранты профильных биологических специальностей. Но у нас нет ограничений по возрасту на подачу заявки и обучение.

Программа открыта для поступления медиков и ветеринаров и есть успешные выпускники. Однако, медикам в подготовке к поступлению и на первых порах сложнее учиться и догонять биологическую базу.
Подготовка к поступлению
Освежить знания рекомендуем с помощью:

Онлайн-курсов «Mолекулярная биология и генетика», «Молекулярная биология клетки», «Генная инженерия», «Биотехнологии: генная инженерия», «Молекулярная филогенетика», «Введение в NGS».

Литературы:
Глик, Б. — Молекулярная биотехнология (2002)
Щелкунов, С. — Генетическая инженерия (2004)
Alberts, B. — Molecular biology of the cell (2008)
Lodish, H. — Molecular Cell Biology (7th ed., 2012)
Журавлева Г.А. — Генная инженерия в биотехнологии (2017)

Про этапы поступления
1.
Заявка
Мы ждем мотивированные заявки, с описанием того, почему вы хотите учиться на программе. Уделите заявке достаточно времени — она дает 50% баллов к собеседованию и по ней можно получить отказ перед ним. В этом году анкету редактировать нельзя: для подготовки ответов на развернутые вопросы заранее мы опубликовали шаблон заявки.

2. Онлайн-курс по основам программирования на Python, статистике в R и работе в Linux
Ссылка на курс придет в ответ на заполненную заявку на указанную в заявке почту. Обратите внимание, что на его прохождение требуется время, а пройденный ранее прогресс (если вы поступали ранее) не переносится. Это необходимо для того, чтобы все абитуриенты освежили знания и навыки.

3. Тестирование
Проводится для тех, кто прошел вступительный курс, и проверяет знания молекулярной биологии, генетики, основ статистики и программирования на Python, базовой работы в командной строке. Тестирование проходит на платформе Stepik. Пример теста. Также для удобства мы добавили примеры заданий из теста в онлайн-курс (п. 2).

4. Собеседование
Проходит онлайн и длится один час: 30 минут для чтения статьи, 30 минут — ответы на вопросы по ней и общения с комиссией. Примеры статьи и вопросов.
Что я буду уметь после окончания программы

  1. Читать и писать код на Python
  2. Проводить статистическую обработку данных и проверять достоверность гипотез в R
  3. Находить и использовать сторонние библиотеки и программы, разбираться в документации
  4. Иметь представление о форматах данных NGS и их анализе
  5. Оценивать сложность и время работы программ
  6. Работать в командной строке и ОС Linux
  7. Подбирать подходящий дизайн анализа для различных типов данных
и многое другое.

Эти навыки востребованы не только непосредственно в сфере биоинформатике, но также дают старт в сферах, связанных с анализом данных и разработкой специализированного программного обеспечения.
Что вы будете изучать
Дискретная математика
Базовые понятия теории множеств, булевы функции и логические высказывания, комбинаторика, асимптотический анализ алгоритмов, алгоритмы сортировки, динамическое программирование, теория графов и алгоритмы на графах.
Практикум по биоинформатике
Выравнивание на референс и поиск SNP, сборка геномов de novo, аннотация геномов, филогенетика, РНК-секвенирование и дифференциальная экспрессия генов, метагеномика. Серия научных проектов в течение года.
Программирование на Python
Переменные и операции, классы и типы, модули, virtualenv, pip, pipenv, pandas/numpy/biopython, Git / GitHub, регулярные выражения, исключения, debugging, базы данных, структуры данных, pep 8.
Работа в командной строке
ssh, awk, grep, построение пайпов, zcat, sed, базовая работа с геномными утилитами bwa, samtools, bedtools.
Статистика в R
Правила постановки эксперимента, гипотезы, методы создания выборок, корреляция, линейные модели, логистическая регрессия, Байесовская статистика, глобальное и локальное окружение, git, Rroject, ggplot2, readxl, dplyr, subset, apply, пользовательские функции, .Rmd.
Алгоритмы в биоинформатике
Глобальное и локальное выравнивание, поиск прочтений, графы де Брейна и графы перекрытий в задаче сборки геномов, поиск вторичной структуры РНК, скрытые марковские модели, вычислительная масс-спектрометрия, кластеризация и филогенетические деревья.
Введение в машинное обучение
Pandas, numpy, логические методы, методы подбора оптимальных гиперпараметров модели, основы кластеризации, Decision Trees, Random forest, градиентный бустинг, сверточные нейронные сети.
Молекулярная эволюция и филогенетика
Выравнивание нуклеотидов и белков, дрейф генов, анализ популяционной структуры, оценка давления отбора, демографическая история популяций, геномные тренды в эволюции.

Мы поддерживаем актуальность учебного плана и можем вносить в него изменения.

Подробная программа объявляется перед началом каждого семестра.

Научный проект
С декабря по май студенты выполняют научно-исследовательский проект, основанный на реальных данных под руководством научных сотрудников университетов и компаний из разных стран. Итоги проекта защищают онлайн в конце мая перед комиссией и публикуют в сборнике Института биоинформатики. Работа над проектом занимает 10-15 часов в неделю.

Проекты часто приводят к дальнейшему сотрудничеству, трудоустройству и публикациям.

Подробнее о работе над проектами и про проекты разных лет на английском языке.
Занятия проходят с начала сентября по начало мая.
Каникулы от лекций – с конца декабря до начала февраля. Это время посвящено распределению и старту работы над научными проектами.
Преподаватели
  • Юрий Барбитов
    Институт биоинформатики
    Молекулярная эволюция
  • Рустам Басыров
    Институт биоинформатики
    Коммандная строка Linux
  • Никита Ваулин
    Сколтех
    Программирование на Python
  • Полина Дроздова
    НИИ Биологии ИГУ
    Филогенетика
  • Артем Ершов
    MGI
    Программирование на Python
  • Алексей Замалутдинов
    Сколтех
    Статистика и анализ данных в R
  • Геннадий Захаров
    Datagrok
    Коммандная строка Linux
  • Артем Иванов
    Университет ИТМО
    Дискретная математика, Алгоритмы
  • Александр Коваленко
    Department of Biochemistry, University of Oxford
    Машинное обучение
  • Иван Козлов
    НИИ СБМ
    Программирование на Python
  • Владимир Пирогов
    Ecole normale supérieure
    Статистика и анализ данных в R
  • Михаил Райко
    Институт биоинформатики
    Практикум по биоинформатике
  • Анна Рыбина
    Сколтех
    Практикум по биоинформатике
  • Георгий Сарапулов
    BIOCAD
    Машинное обучение
  • Антон Сидорин
    СПбГУ
    Программирование на Python
  • Игнат Сонец
    ИБГ РАН / НИИ СБМ Роспотребнадзора
    Программирование на Python
  • Владислав Станин
    Центр Вычислительной Биологии
    Машинное обучение
  • Екатерина Сытник
    Mislab
    Программирование на Python
  • Владимир Шитов
    Munich School for Data Science
    Практикум по биоинформатике
Ответы на многие вопросы можно найти в FAQ.
По остальным пишите на admissions@bioinf.me
или в чат абитуриентов.
Места работы выпускников
Контакты
Институт биоинформатики
Cанкт-Петербург, ул. Кантемировская 2А,
Бизнес-центр «Таймс»

Занятия онлайн в Zoom

По поступлению – admissions@bioinf.me
По общим вопросам – info@bioinf.me

Онлайн-программа
переподготовки
по биоинформатике