Интенсив по анализу данных NGS
2019 | Санкт-Петербург
2019 | Санкт-Петербург
Интенсив по анализу данных NGS для исследователей биологических направлений позволяет в сжатые сроки получить максимум практических навыков по работе с геномными и транскриптомными данными.
Программа
Версия для печати
Версия для печати
1
Пайплайны и форматы
Форматы данных и их отличия на разных этапах анализа
2
Оценка качества ридов и выравнивания
Какие программы использовать и на какие метрики следует обратить внимание
3
Выравнивание коротких фрагментов и SNP-calling
Как найти однонуклеотидные замены в коротких ридах
4
Дифференциальная экспрессия генов
Сравнение результатов RNA-seq между образцами
5
Визуализация данных
Как правильно нарисовать красивые картинки из имеющихся у вас данных или посмотреть на геномное выравнивание
6
Обзор других развивающихся областей биоинформатики
Метагеномные исследования, технологии секвенирования одиночных клеток
Для кого
Для всех, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.
В первую очередь приглашаются исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, поиска вариаций и GWAS.
Ожидания от участников
В первую очередь приглашаются исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, поиска вариаций и GWAS.
Ожидания от участников
- Интерес к биоинформатике и анализу данных
- Знания в молекулярной биологии
- Наличие ноутбука для работы на практических занятиях
- Возможность подключиться для удаленной работы
- Умение работать в командной строке Linux или желание быстро её освоить на вводном онлайн-курсе
Формат
Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке. Занятия проходят в бизнес-центре «Таймс» с 10:00 до 18:00. По вечерам — полезный нетворкинг.
Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть: 2018, 2016
Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть: 2018, 2016
Преподаватели и лекторы
Евгений Бакин
Институт биоинформатики
Юрий Барбитов
Институт биоинформатики
Алексей Гуревич
СПбГУ ЦАБ
Константин Зайцев
Университет ИТМО
Михаил Райко
СПбГУ ЦАБ
Оксана Станевич
НИИ ДОГиТ им. Р.М. Горбачёвой
Александр Ткаченко
Университет ИТМО
Условия участия
За четыре дня сложно рассказать все детали анализа данных, но программа интенсива разработана с целью дать максимум полезных навыков за этот срок.
При записи на мероприятие необходимо пройти вводный онлайн-курс. Это позволит разобраться в программном обеспечении, используемом на занятиях, и сэкономит время на решении технических проблем.
Как принять участие:
Запись на интенсив закрывается по мере заполнения группы.
При записи на мероприятие необходимо пройти вводный онлайн-курс. Это позволит разобраться в программном обеспечении, используемом на занятиях, и сэкономит время на решении технических проблем.
Как принять участие:
- Заполнить заявку.
- Пройти вводный онлайн-курс.
- Ссылка на курс придёт в ответ на заполненную заявку. Пожалуйста, внимательно вносите и проверяйте адрес вашей электронной почты.
- Оплатить взнос в течение 5 дней с момента получения реквизитов.
- Ссылка на детали оплаты придёт на почту в течение двух дней после завершения онлайн-курса. Если вы её не получили, проверьте папку «Спам».
Запись на интенсив закрывается по мере заполнения группы.
Организационные взносы
- Студентам — 15 000 (очный бакалавриат, специалитет, магистратура при оплате по договору оферты)
- Физическим лицам — 20 000 (сотрудники государственных и коммерческих учреждений по договору оферты)
- Юридическим лицам — 30 000 (при заключении договора с организацией)
Взносы принимаются в рублях и покрывают участие, материалы, кофе-брейки и фуршет. Проживание и обеды участники оплачивают самостоятельно. Мы посоветуем, где пообедать недалеко от места проведения.
Количество мест ограничено.
Для того чтобы гарантировать место, оплатить участие необходимо в течение 5 рабочих дней после получения реквизитов. Студентам необходимо быть готовыми подтвердить право на льготу.
Договор оферты для физических лиц
Часто задаваемые вопросы
На какой уровень рассчитана программа интенсива?
Программа рассчитана на начинающих биоинформатиков. Однако мы ожидаем от участников владение командной строкой и базовым синтаксисом языка R на уровне обязательного к прохождению онлайн-курса.
Претендуют ли аспиранты, ординаторы, интерны на студенческую скидку?
Нет, скидка предоставляется только студентам очной формы: бакалавриат, специалитет, магистратура при оплате по договору-оферте и документе, подтверждающем студенческий статус.
Для записи на интенсив необходимо пройти онлайн-курс. Это обязательное условие?
Да.
Я набрал необходимое количество баллов в онлайн-курсе, что делать дальше?
Для тех, кто наберет необходимое количество баллов, в курсе станет доступен дополнительный модуль с инструкциями по заполнению анкеты и оплате.
Если модуль недоступен, значит на ближайшем интенсиве закончились места. Однако набранные баллы перезачтутся для будущих интенсивов.
Если модуль недоступен, значит на ближайшем интенсиве закончились места. Однако набранные баллы перезачтутся для будущих интенсивов.
Я прошел курс, но подача анкет уже закончилась, когда я смогу записаться на следующий интенсив?
Интенсив проводится ежегодно один или два раза в год. Советуем подписаться на новости Института и следить за анонсами.
Для участия необходим ноутбук, какое ПО требуется установить?
Если вы планируете участие в семинаре, то рекомендуем вам выполнять здания онлайн-курса на том же ноутбуке, который вы планируете использовать на семинаре, чтобы устанавливать необходимое ПО один раз в процессе решения задач. Накануне семинара организаторы вышлют подробные инструкции по установке дополнительных программ.
Скидки
- Прохождение онлайн-курса и подача анкеты до 1 марта — 10%
- Участие в двух интенсивах: по анализу данных NGS и медицинской статистике — 20%
- Студентам и выпускникам Института биоинформатики — 30%
Скидки не суммируются и предоставляются только при оплате в течение 5 дней с момента получения счёта.
Участники 2019
1. Ольга Бровкина, ФНКЦ ФМБА России
2. Андрей Введенский, Геномед
3. Дмитрий Ткачук, Джонсон&Джонсон, подразделение Янссен
4. Татьяна Усенко, ФГБУ "ПИЯФ" НИЦ "Курчатовский институт"
5. Надежда Орлова, Институт Биоинженерии ФИЦ Биотехнологии РАН
6. Никита Багаев, ПМГМУ им. И. М. Сеченова (Сеченовский Университет)
7. Юлия Суворова, ФИЦ Биотехнологии РАН
8. Валентин Полтораченко, ИМГ РАН
9. Никита Зубашенко, Сеченовский университет
10. Анастасия Огиенко, ИМГ РАН
11. Анна Грибкова, МГУ
12. Надежда Маркевич, НИУ ВШЭ
13. Дмитрий Буг, ПСПбГМУ
14. Антон Кузьменко, Институт Молекулярной Генетики РАН
15. Мария Голубева, ПМГМУ им.Сеченова
16. Юлия Васильева, Институт Иммунологии ФМБА
17. Евгений Генельт-Яновский, ЗИН РАН
18. Павел Воробьев, Институт молекулярной биологии, Москва
19. Тамара Рычагова, ЗАО Биокад
20. Максим Дюков, ЗАО Биокад
21. Дарья Уварова, ФГБУ ВНИИКР
22. Екатерина Володина, ФГБУ ВНИИКР
23. Антон Лопаткин, ФГБУ ВНИИКР
24. Анастасия Яремко, ФГБУ ВНИИКР
25.Елена Минина, УО "Витебский государственный ордена Дружбы народов медицинский университет"
2. Андрей Введенский, Геномед
3. Дмитрий Ткачук, Джонсон&Джонсон, подразделение Янссен
4. Татьяна Усенко, ФГБУ "ПИЯФ" НИЦ "Курчатовский институт"
5. Надежда Орлова, Институт Биоинженерии ФИЦ Биотехнологии РАН
6. Никита Багаев, ПМГМУ им. И. М. Сеченова (Сеченовский Университет)
7. Юлия Суворова, ФИЦ Биотехнологии РАН
8. Валентин Полтораченко, ИМГ РАН
9. Никита Зубашенко, Сеченовский университет
10. Анастасия Огиенко, ИМГ РАН
11. Анна Грибкова, МГУ
12. Надежда Маркевич, НИУ ВШЭ
13. Дмитрий Буг, ПСПбГМУ
14. Антон Кузьменко, Институт Молекулярной Генетики РАН
15. Мария Голубева, ПМГМУ им.Сеченова
16. Юлия Васильева, Институт Иммунологии ФМБА
17. Евгений Генельт-Яновский, ЗИН РАН
18. Павел Воробьев, Институт молекулярной биологии, Москва
19. Тамара Рычагова, ЗАО Биокад
20. Максим Дюков, ЗАО Биокад
21. Дарья Уварова, ФГБУ ВНИИКР
22. Екатерина Володина, ФГБУ ВНИИКР
23. Антон Лопаткин, ФГБУ ВНИИКР
24. Анастасия Яремко, ФГБУ ВНИИКР
25.Елена Минина, УО "Витебский государственный ордена Дружбы народов медицинский университет"
Партнеры
Контакты
Санкт-Петербург
ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»
Ближайшее метро: Лесная
По всем вопросам:
info@bioinf.me
ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»
Ближайшее метро: Лесная
По всем вопросам:
info@bioinf.me
Интенсив по анализу данных NGS 2019
© Bioinformatics Institute
направления