Онлайн-интенсив
по анализу данных NGS:
введение в медицинскую и статистическую генетику

6 — 13 марта 2021
Онлайн-интенсив по анализу данных NGS для исследователей биологических направлений позволяет в сжатые сроки получить максимум практических навыков по работе с геномными данными

1
Пайплайны и форматы
Форматы данных и их отличия на разных этапах анализа
2
Оценка качества ридов и выравнивания
Какие программы использовать и на какие метрики следует обратить внимание
3
Выравнивание коротких фрагментов и SNP-calling
Как найти однонуклеотидные замены в коротких ридах
4
Генетика сложных признаков и GWAS
Сравнение результатов анализа между образцами и в больших выборках
Для кого
Для всех, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.

В первую очередь приглашаются исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, поиска вариаций и GWAS.

Ожидания от участников

  • Интерес к биоинформатике и анализу данных
  • Знания в молекулярной биологии
  • Наличие ноутбука для работы на практических занятиях
  • Возможность подключиться для удаленной работы
  • Умение работать в командной строке Linux или желание быстро её освоить на вводном онлайн-курсе
        Формат
        Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке. Занятия проходят удаленно на платформе ZOOM 6 и 13 марта с 11:00 до 19:00, 11 марта с 19:00 до 21:00.

        Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть: 2019, 2018, 2016
              Преподаватели и лекторы
              Юрий Барбитов
              Институт биоинформатики
              Михаил Райко
              СПбГУ ЦАБ
              Ростислав Скитченко
              Университет ИТМО
              Александр Предеус
              Wellcome Sanger Institute, Cellular Genetics Informatics Group
              Условия участия
              За короткий срок сложно рассказать все детали анализа данных, но программа интенсива разработана с целью дать максимум полезных навыков за этот срок.

              При записи на мероприятие необходимо пройти вводный онлайн-курс. Это позволит разобраться в программном обеспечении, используемом на занятиях, и сэкономит время на решении технических проблем.

              Как принять участие:

              1. Пройти открытый вводный онлайн-курс. Запись на курс является первым этапом подготовки к участию.
              2. Заполнить анкету и оплатить взнос.
                Ссылка на анкету станет доступна после того, как будет набрано необходимое количество баллов в онлайн-курсе. Заявка оцениваться не будет, но ее заполнение обязательно — так мы сможем скорректировать нагрузку и понять ваши ожидания от программы.

              Запись на интенсив закрыта.
                    Организационные взносы
                    • Физическим лицам — 13 000 рублей, сотрудники государственных и коммерческих учреждений по договору оферты. При оплате до 15 февраля — 10 000 рублей.
                    • Юридическим лицам — 18 000 (при заключении договора с организацией).

                    Взносы покрывают участие и материалы.

                    Количество мест ограничено.

                    Договор оферты для физических лиц
                      Часто задаваемые вопросы
                      На какой уровень рассчитана программа интенсива?
                      Программа рассчитана на начинающих биоинформатиков. Однако мы ожидаем от участников владение командной строкой и знаниями в области технологий NGS уровне обязательного к прохождению онлайн-курса.
                      Я набрал необходимое количество баллов в онлайн-курсе, что делать дальше?
                      Для тех, кто наберет необходимое количество баллов, в курсе станет доступен дополнительный модуль с инструкциями по заполнению анкеты и оплате.

                      Если модуль недоступен, значит на ближайшем интенсиве закончились места. Однако набранные баллы перезачтутся для будущих интенсивов.
                      Я прошел курс, но подача анкет уже закончилась, когда я смогу записаться на следующий интенсив?
                      Интенсив проводится ежегодно один или два раза в год. Советуем подписаться на новости Института и следить за анонсами.
                      Для участия необходим ноутбук, какое ПО требуется установить?
                      Если вы планируете участие в семинаре, то рекомендуем вам выполнять здания онлайн-курса на том же ноутбуке, который вы планируете использовать на семинаре, чтобы устанавливать необходимое ПО один раз в процессе решения задач. Накануне семинара организаторы вышлют подробные инструкции по установке дополнительных программ.
                      Партнеры
                      Контакты
                      Санкт-Петербург
                      ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»
                      Ближайшее метро: Лесная

                      По всем вопросам:
                      info@bioinf.me
                      Подписаться на новости Института биоинформатики

                      Интенсив по анализу данных NGS 2021