Блок AlphaGenome посвящён предсказанию функциональных свойств генома по последовательности ДНК. Вы научитесь выполнять предсказания для геномных последовательностей и интервалов, работать с выходными данными модели, оценивать влияние генетических вариантов (variant scoring), проводить in silico мутагенез и интерпретировать результаты.
8 августа
Суббота
12:30 - 14:10
AlphaGenome: практика | Никита Ваулин
Все задания выполняются в Google Colab. Для блока AlphaGenome рекомендуется заранее получить API-ключ. При желании код можно запускать локально в среде Python с пакетами alphagenome, pandas и matplotlib.
15 августа
Суббота
11:00 - 12:00
Как AlphaFold изменил биологию | Александра Мамчур
В блоке AlphaFold вы освоите предсказание структуры белков и белковых комплексов с помощью AlphaFold Server и AlphaFold DB, а также научитесь оценивать качество моделей по метрикам pLDDT, PAE и pTM.
15 августа
Суббота
12:15 - 13:15
Работа с AlphaFold Server и базой данных | Александра Мамчур
15 августа
Суббота
14:00 - 15:30
AlphaMissense – предсказание патогенности мутаций | Александра Мамчур
Заключительный блок посвящён AlphaMissense — модели для оценки патогенности миссенс-вариантов. Вы научитесь интерпретировать её предсказания в контексте структуры белка и применять их при анализе данных медицинской генетики.
Полезные ссылки
ТУТ БУДЕТ ССЫЛКА
Our managers are always ready to answer your questions. You can call us during the weekends and at night. Also, you can visit our office for a personal consultation.
Our company works according to the principle of individual approach to every client. This method allows us to succeed in tasks of any level.
Записи лекций и презентации будут появляться после занятий
Чтобы не пропустить анонсы новых лекториев, оставайтесь с нами: