Выпускники

2022/23 год обучения

Проект: Сравнение методов работы с пропусками в данных для оценки референсных значений антропометрических параметров перинатального периода развития человека
Руководители: Дмитрий Жакота, Ева Шелли

Заканчиваю магистратуру на кафедре биофизики физфака МГУ им. М.В.Ломоносова. В рамках дипломной работы занимаюсь изучением взаимосвязи структуры и функции белков, а также физическими основами фолдинга и функционирования полипептидов в живых организмах. Провожу анализ различных групп вирусов, разрабатываю софт для вирусологов в НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи. Научные интересы: биофизика, биоинформатика, вирусология, фолдинг белка, эволюция, хиральность биомолекул.

Проект: Биостатистический анализ транскриптомных данных пациентов с меланомой кожи из открытой базы данных TCGA
Руководители: Евгений Бакин, Максим Кузнецов

Магистрант Университета Сириус. Участвую в проекте по палеогеномике Русской равнины, интересуюсь анализом данных NGS, single-cell транскриптомикой, машинным обучением.

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Ева Шелли

По образованию финансист (магистр). Последние 5 лет работаю в области биотехнологий. Научные интересы – популяционные исследования, валидация результатов биоинформатического анализа, генетика человека. Люблю вникать в процесс «от корки до корки».

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Матвей Славенко

По образованию программист, студент 1 курса магистратуры по программе «Искусственный интеллект и программирование». Активно изучаю биоинформатику и биостатистику.

Проект: Расчёт референсных значений морфометрических параметров с помощью R в перинатальном периоде развития человека
Руководитель: Матвей Славенко, Дмитрий Жакота

Молекулярный генетик. В настоящий момент работаю в лаборатории генетики и эпигенетики ФИЦ Биотехнологии РАН. С помощью технологии NGS изучаю геномы и эпигеномы древних людей, живших тысячи лет назад. Область интересов – палеогенетика, палеоэпигенетика, эволюционная генетика, редактирование генома и эпигенома, исследование эпигенетических маркеров различных заболеваний, в частности – ожирения.

Проект: Расчёт референсных значений морфометрических параметров с помощью R в перинатальном периоде развития человека
Руководители: Матвей Славенко, Дмитрий Жакота

Биолог по образованию. Работаю в департаменте R&D фармацевтической компании, занимаюсь доклиникой. Научные интересы: иммуноонкология, биоинформатика, разработка лекарственных средств.

Проект: Биостатистический анализ транскриптомных данных пациентов с меланомой кожи из открытой базы данных TCGA
Руководители: Евгений Бакин, Максим Кузнецов

Работаю биостатистиком в компании Ифарма. Выпускница магистратуры НИУ ВШЭ по прикладной статистике. В свободное от работы и учебы время занимаюсь спортом, путешествую, увлекаюсь фотографией, рукоделием (шитье, бомбочки для ванны и т.д.) и фигурным катанием (как зритель).

Проект: Сравнение методов работы с пропусками в данных для оценки референсных значений антропометрических параметров перинатального периода развития человека
Руководители: Дмитрий Жакота, Ева Шелли

Проект: Экспрессия генов и иммунный ответ на вакцинацию по данным открытой базы данных ImmuneSpace
Руководители: Евгений Бакин, Максим Кузнецов

Студент 5 курса медико-психолого-фармацевтического факультета по специальности «Медицинский кибернетик» Красноярского государственного медицинского университета им. проф. В.Ф.Войно-Ясенецкого.

Проект: Расчёт референсных значений морфометрических параметров с помощью R в перинатальном периоде развития человека
Руководители: Матвей Славенко, Дмитрий Жакота

Учусь на третьем курсе ПМГМУ им. И.М. Сеченова по направлению «Биоинженерия и биоинформатика». В свободное время увлекаюсь изучением развития животного мира, получила сертификат «фелинолога-заводчика», изучаю языки программирования.

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Ева Шелли

Во время обучения на программе Ольга начала работать биостатистиком в компании BIOCAD.

Экономист по образованию, почти 10 лет занимаюсь анализом данных, последние несколько лет – медицинских. Люблю решать интересные задачки, вязать шарфы и шапки, рисовать, кататься на беговых лыжах и учиться чему-нибудь новому.

Проект: Экспрессия генов и иммунный ответ на вакцинацию по данным открытой базы данных ImmuneSpace
Руководители: Евгений Бакин, Максим Кузнецов

По специальности – врач-радиолог, научные интересы сосредоточены в области ядерной медицины и биомедицинской визуализации. Свободное время посвящаю природе, особенно Южного Урала.

Проект: Сравнение методов работы с пропусками в данных для оценки референсных значений антропометрических параметров перинатального периода развития человека
Руководители: Дмитрий Жакота, Ева Шелли

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Матвей Славенко

Занимаюсь количественной и системной фармакологией, мат. моделированием, особенно в области нейродегенеративных заболеваний.

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Ева Шелли

Во время обучения на программе Алиса начала работать биостатистиком в компании Герофарм.

Тема выпускного проекта посвящена подростковым депрессиям. Долгое время я была техническим переводчиком, переводила статьи по медицине, биологии, анализу данных и электротехнике, а так же преподавала английский язык. Закончила СПбГЭТУ «ЛЭТИ», кафедру Биотехнических систем. Люблю сравнительную лингвистику и теорию переводов, с удовольствием читаю статьи, продвигающие доказательный подход в медицине.

Проект: Связь депрессивных расстройств и различных факторов у подростков
Руководитель: Дмитрий Серебренников

Сотрудник Института Регенеративной Медицины Сеченовского Университета, студент 6 курса по направлению «Врач-исследователь». Научные интересы: иммунология, регенеративная медицина. Хобби: пеший и горный туризм, катание на сноуборде.

Проект: Экспрессия генов и иммунный ответ на вакцинацию по данным открытой базы данных ImmuneSpace
Руководители: Евгений Бакин, Максим Кузнецов

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Матвей Славенко

Врач по образованию, биолог по профессии. Занимаюсь молекулярной эндокринологией, веду доклинические исследования препаратов (аллостерических модуляторов рецептора ТТГ) для лечения патологии щитовидной железы. Вне науки занимаюсь акробатикой и преподаю старшеклассникам естественнонаучные дисциплины.

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Матвей Славенко

Студентка 4 курса бакалавриата РХТУ им. Менделеева по направлению Биотехнологии. Дипломная работа посвящена получению препаратов белков, включенных в липосомы, и исследованию их свойств. Научные интересы: биостатистика, клинические исследования, липосомальные препараты, молекулярная биология. Из ненаучного: путешествия, фигурное катание, керлинг, чтение.

Проект: Анализ базы данных АНО «Благотворительная больница»
Руководители: Сергей Иевков, Ева Шелли

Выпускница бакалавриата и магистратуры РТУ МИРЭА, Института тонких химических технологий имени М.В. Ломоносова по направлению «Химия и технология биологически активных веществ». Научный сотрудник в фармацевтической компании, занимаюсь исследовательской деятельностью, разработкой и поддержкой ПО для автоматических систем приготовлений растворов. Научные интересы: программирование, биостатистика, органический синтез. Хобби: играю на гитаре и преподаю старшеклассникам математику.

Проект: Связь депрессивных расстройств и различных факторов у подростков
Руководитель: Дмитрий Серебренников

Врач по специальности детская ревматология, к м.н., член Европейского сообщества детских ревматологов (PRES), член Европейского сообщества по клиническим исследованиям в детской ревматологии (PRINTO). Сфера интересов – биостатистика, детская ревматология, клинические исследования.

Проект: Расчёт референсных значений морфометрических параметров с помощью R в перинатальном периоде развития человека
Руководители: Матвей Славенко, Дмитрий Жакота

Учусь на 2 курсе магистратуры по программе «Молекулярная биология и биотехнология». Научные интересы: биоинформатика, молекулярная биология, нанобиотехнология.

Проект: Биостатистический анализ транскриптомных данных пациентов с меланомой кожи из открытой базы данных TCGA
Руководители: Евгений Бакин, Максим Кузнецов

Проект: Сравнение методов работы с пропусками в данных для оценки референсных значений антропометрических параметров перинатального периода развития человека
Руководители: Дмитрий Жакота, Ева Шелли

Проект: SANS Serif optimization
Руководитель: Кирилл Антонец

Проект: The reproducibility of the Crustacean phylogenetic analyses on open source data
Руководитель: Полина Дроздова

Учусь в НИТУ МИСиС на кафедре Инженерной кибернетики. Работаю в лаборатории «Центр Биоинформатики и Алгоритмических Биотехнологий СПбГУ» , участвую в разработке сборщика генома SPAdes. Сфера научных интересов: генетика, метагеномика, алгоритмы. А ещё я увлекаюсь спортивным программированием и учу ему детей.

Проект: Development of a tool for analysis of protein families
Руководитель: Степан Овчинников

Проект: SNP Grouping and evaluation of epistatic interaction for phenotypic traits in agricultural plants
Руководители: Елена Григорьева, Лаврентий Данилов

Студент факультета Математики и Компьютерных наук СПбГУ. Текущий научный проект связан с идентификацией пептидных природных соединений по масс–спектрам. Научные интересы: биоинформатика, машинное обучение, теория вероятностей. Преподаю школьникам олимпиадную математику.

Проект: Selection of antibodies humanized by scaffolding
Руководители: Георгий Мамиствалов, Наталья Зенкова, Владислав Страшко

Закончила факультет математики НИУ ВШЭ, стажёр-исследователь в Международной лаборатории статистической и вычислительной геномики. Работаю над проектом «Коалесцентная теория и ее приближения». Научные интересы: популяционная генетика, биоинформатика.

Проект: Analysis of developmental gene expression dynamics during anterior and posterior regeneration of Platynereis dumerilii (Nereididae, Annelida) and Pygospio elegans (Spionidae, Annelida)
Руководители: Елена Новикова, Максим Нестеренко

Проект: Re-analysis of the public dataset: comparison and evaluation of T cells in paired tumor and normal lung single cell samples
Руководитель: Екатерина Есаулова

Выпускница института информатики и телекоммуникаций СибГУ им. М. Ф. Решетнева. Работаю ML-инженером. Научные интересы: машинное обучение и анализ данных.

Проект: Cell types annotation of cycling T lymphocytes in the tumor microenvironment
Руководитель: Сергей Исаев

Текущее место работы: Hong Kong University of Science and Technology (HKUST)

Студентка магистратуры «Разработка ПО и науки о данных» на факультете «Математика и компьютерные науки», СПбГУ. Закончила бакалавриат по программе «Математика, алгоритмы и анализ данных» на том же факультете. Моя дипломная работа была посвящена изучению многомерного устойчивого телеком–процесса. Научные интересы: теория вероятности, случайные процессы, математическая статистика, машинное обучение, биоинформатика.

Проект: Prediction of protein-protein binding affinity
Руководители: Ольга Лебеденко, Николай Скрынников

Проект: SANS Serif optimization
Руководитель: Кирилл Антонец

Текущее место работы: Constructor University Bremen / Helmholtz Munich

Сейчас учусь в Германии, в Бременском университете Якобса. Ранее училась на программе «Прикладная математика и информатика» во ВШЭ СПб. Выполнила проект по кластеризации мономеров из сборки центромер в ЦАБ СПбГУ. Хотела бы далее профессионально заниматься геномной биоинформатикой и машинным обучением в биоинформатике. Люблю походы, теннис, путешествия и общение :)

Пример: Development of DNA methylation data imputation algorithm for RRBS and WGBS protocols
Руководители: Олег Шпынов, Роман Чернячик

Сутдент ФМБФ МФТИ, работал над несоколькими проектами в области онкологии. Занимался валидацией NGS биомаркеров ответа на ICI терапии. Также занимался изучением интерактома белка из семейства p53-p73. Параллельно участвовал в нескольких менее масштабных биоинформатических проектах. Научные интересы: in silico и in vitro методы биологических исследований.

Проект: Studying thymic selection with deep profiling of T-cell receptor repertoires
Руководители: Елизавета Власова, Михаил Шугай

Окончила университет ИТМО, кафедра речевых информационных систем; несколько лет работала в области обработки естественного языка, на данный момент интересуюсь анализом данных в биологии и медицине, планирую продолжать развиваться в этом направлении.

Проект: Machine Learning for molecules: Pre-training in Single-step Retrosynthesis
Руководитель: Нина Лукашина

Студент 1 курса магистратуры физического факультета СПбГУ, кафедра статистической физики. Занимаюсь применением методов статистической физики к исследованию молекулярных систем. Работаю с методами молекулярной динамики и Монте-Карло. Также интересуюсь квантовой химией и высокопроизводительными вычислениями.

Проект: Prediction of protein-protein binding affinity
Руководители: Ольга Лебеденко, Николай Скрынников

Текущее место работы: BIOCAD

Ведущий разработчик в BrainGarden, занимаюсь машинным обучением, компьютерным зрением и робототехникой. Научные интересы: мультиагентное обучение с подкреплением, геометрическое глубокое обучение, машинное обучение в структурной и системной биологии.

Проект: Antigen-aware antibody design with encoder-decoder architectures
Руководитель: Наталия Зенкова

Студент 1 курса магистратуры ФБМФ МФТИ. Работаю в BostonGene, занимаюсь транслокационным подтипом рака почки. Научные интересы: scRNAseq, машинное обучение, молекулярная и вычислительная биология.

Проект: Somatic mutation calling validation using in silico approach
Руководители: Анастасия Юдина, Данил Ступичев

Занимаюсь геномным редактированием вишни во ВНИИ Сельскохозяйственной Биотехнологии, интересуюсь биотехнологией растений, молекулярной биологией и анализом геномов. Хобби: изучение иностранных языков.

Проект: SNP Grouping and evaluation of epistatic interaction for phenotypic traits in agricultural plants
Руководители: Елена Григорьева, Лаврентий Данилов

Выпускница НИИ медицинской генетики ТНИМЦ, врач–лабораторный генетик, интерпретатор NGS-данных. Научные интересы: структурная вариабельность генома при многофакторных болезнях, вклад CNV в развитие сердечно-сосудистых заболеваний.

Проект: Comparison of genotype-to-phenotype relations in mouse and human
Руководитель: Юрий Барбитов

Закончила кафедры биохимии (бакалавриат), цитологии и гистологии (магистратура) на биологическом факультете СПбГУ. Некоторые научно–исследовательские проекты, над которыми удалось поработать: моделирование фибриллогенеза транстиретина в культурах эукариотических клеток; регуляция экспрессии гена ABCA1 при оксидативном стрессе в клетках гепатомы человека HepG2; исследования частот встречаемости полиморфизмов HNA и HPA у доноров крови и пациентов с гематологическими заболеваниями. Несколько лет назад перешла в индустрию: разрабатывала тест-системы на основе ПЦР в реальном времени. В настоящий момент работаю в компании, занимающейся разработкой и производством тест-систем, основанных на технологии высокопроизводительного секвенирования (NGS). Профессиональные интересы сосредоточены в области биоинформатики и молекулярной биологии.

Проект: Global gene expression of NSCLC TIL
Руковолитель: Екатерина Есаулова

Студент 5 курса специалитета Первого МГМУ им. Сеченова по направлению Биоинженерия и биоинформатика. В настоящий момент занимаюсь математической моделью взаимодействия и конкуренции РНК-полимераз. Научные интересы: single-cell подходы, машинное обучение и нейросети в медицине. Из ненаучного: дайвинг, треккинг, путешествия (по крайней мере были), театр.

Проект: Optimizing the search for significant SNPs associated with important agronomic traits in plants
Руководители: Елена Григорьева, Лаврентий Данилов

Область научных интересов — эпигенетика.

Проект: Pervasive duplication of tumor suppressors in Afrotherians during the evolution of large bodies and reduced cancer risk
Руководитель: Юрий Маловичко

Занимаюсь изучением систем CRISPR-Cas первого типа in vivo, в частности типов I-E и I-C с применением NGS. Также интересуюсь применением методов математического моделирования к биологическим задачам.

Проект: Development of in silico models of metagenomic communities with given properties and a pipeline for their generation
Руководители: Артем Иванов, Владимир Ульянцев

Текущее место работы: МГУ, ИИ в биоинформатике и медицине

Студент 4 курса факультета естественных наук Новосибирского Государственного Университета, дипломная работа посвящена дизайну биолюминесцентого белка целентеразина с новыми физико–химическими свойствами с использованием методов мутагенеза и молекулярного моделирования. Научные интересы: белковый дизайн, иммуноинформатика, deep learning. Увлечение: функциональные тренировки, бег.

Проект: Sufficient mutation landscape for machine learning of antibody binding
Руководитель: Дарья Балашова

Я занимаюсь биологией симбиотических систем. Моллюски рода Littorina и их взаимодействие с прокариотами моя модель для анализа феномена симбиоза. Сейчас мое исследование направлено на выяснение механизмов и последствий взаимодействия литторин и прокариот с привлечением масс-спектрометрии и метагеномики.

Проект: Comparative transcriptomic analysis of the abdominal ganglia of the hermit crabs Pagurus minutus, non-infected and parasitised by Peltogaster reticulata ("Crustacea": Rhizocephala)
Руководители: Максим Нестеренко, Алексей Миролюбов

Студент–магистр Биологического факультета СПбГУ. Выпускник бакалавриата СПбГТИ(ТУ) по специальности Молекулярная биотехнология. Работаю в лаборатории «Клеточных механизмов гомеостаза крови» ИЭФБ РАН, где занимаюсь разработкой методов анализа деформационно-функциональных характеристик эритроцитов и диагностики гематологических заболеваний, а также исследованием анемий, индуцируемых противоопухолевыми агентами.

Проект: Hybrid assembly of the Myodes centralis genome
Руководители: Ольга Бондарева, Геннадий Захаров, Сергей Бодров

Студентка магистратуры направления Биофизика в Санкт-Петербургском политехническом университете. Участвую в исследованиях механизмов деления бактерий. Сфера научных интересов: исследования свойств и взаимодействий белков цитоскелета различных видов бактерий.

Проект: Comparative transcriptomic analysis of the abdominal ganglia of the hermit crabs Pagurus minutus, non-infected and parasitised by Peltogaster reticulata (“Crustacea": Rhizocephala)
Руководители: Максим Нестеренко, Алексей Миролюбов

Выпускница бакалавриата факультета биологической и медицинской физики МФТИ. Работаю больше года в Институте молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта в лаборатории регуляции внутриклеточного протеолиза. Мои научные интересы заключены вокруг исследования поведения иммунных протеасом при различных патологиях: онкологических, нейродегенеративных, аутоиммунных заболеваниях. Помимо науки люблю фотографировать на пленку, кататься на сноуборде и путешествовать.

Проект: Sufficient mutation landscape for machine learning of antibody binding
Руководитель: Дарья Балашова

Выпускница кафедры Зоологии Беспозвоночных, Биологического факультета МГУ. Сейчас занимаюсь экологией моря и побережий.

Проект: Spatial mapping of potential enzymes encoded in the global ocean microbiome
Руководители: Erik Zhivkoplias

Бакалавриат и магистратуру закончила в Санкт-Петербургском политехническом университете Петра Великого. Тема магистерской диссертации «Экспрессия генов оментина–1 и транскрипционного фактора PPARγ в эпикардиальной и подкожной жировой ткани у пациентов с ишемической болезнью сердца». На данный момент аспирант ПСПбГМУ им. акад. И.П. Павлова. Исследовательская работа посвящена изучению влияния экстраклеточных везикул жировой ткани на обратный транспорт холестерина.

Проект: Re-analysis of the public dataset: comparison and evaluation of T cells in paired tumor and normal lung single cell samples
Руководитель: Екатерина Есаулова

Работаю младшим научным сотрудником в лаборатории направления генетика ЦГиНЖ НТУ Сириус, учусь в аспирантуре Сириуса. В рамках своей диссертации занимаюсь изучением эпигенетики агрессивного поведения.

Проект: The diversity of opsins in Lake Baikal amphipods (Amphipoda: Gammaridae)
Руководитель: Полина Дроздова

Проект: The reproducibility of the Crustacean phylogenetic analyses on open source data
Руководитель: Полина Дроздова

В настоящее врем работаю в двух научных лабораториях. В ИВНДиНФ РАН мы занимаемся исследованием дифференциальной экспрессии нейронов первичной культуры гиппокампа крысят в ответ на активацию пикротоксином методом секвенирования кДНК на матрице полноразмерных мРНК на платформе Oxford Nanopore (MinION). Также в рамках данного проекта мы ведём поиск альтернативных сплайс-вариантов мРНК в ответ на воздействие пикротоксином в течение разных временных промежутков. В лаборатории центра Гамалеи Минздрава России участвую в проектах по разработке мРНК вакцинных платформ и платформ на основе вируса жёлтой лихорадки против вирусных инфекций. Среди моих научных интересов генная инженерия и NGS и их безграничные возможности для изучения живого.

Проект: SNP Grouping and evaluation of epistatic interaction for phenotypic traits in agricultural plants
Руководители: Елена Григорьева, Лаврентий Данилов

Студент бакалавриата направления 19.03.01 «Биотехнологии», ОП – Биомедицинские технологии. Научные интересы: нейробиология, нейробиофизика, молекулярная биология, биоинформатика, системы диагностики нейродегенеративных заболеваний (фМРТ, МРС, различные импульсные последовательности МРТ).

Проект: Pervasive duplication of tumor suppressors in Afrotherians during the evolution of large bodies and reduced cancer risk
Руководитель: Юрий Маловичко

Закончила магистратуру по биологии в ЮФУ. Изначально я молекулярный биолог растений, исследовала структурно–функциональную организацию пластидного генома и особенности ядерно–цитоплазматических взаимодействий у хлорофилл дефицитных мутантов подсолнечника с внеядерным типом наследования. Год назад решила переквалифицироваться на биоинформатика. Училась и писала магистерскую ВКР в Институте белка РАН. Проводила биоинформатический анализ специфичности взаимодействия белка YB-1 с ДНК in vitro и in vivo.

Проект: dipQUAST: quality assessment tool for diploid genome assemblies
Руководитель: Алексей Гуревич

Выпускник бакалавриата кафедры генетики и клеточной биологии Томского Государственного Университета. Научная работа связана с изучением ферментативных параметров белка системы репарации ДНК. Сфера научных интересов охватывает молекулярную биологию (особенно интересны механизмы сигнальных каскадов в клетке), биохимию. Кроме науки, увлекаюсь бадминтоном, аквариумистикой, люблю путешествовать.

Проект: Development of a tool for analysis of protein families
Руководитель: Степан Овчинников

Выпускница биоинженерии и биоинформатики БФУ им. И. Канта, лаборант-исследователь Центра геномных исследований. Занимаюсь изучением изменчивости мтДНК нематод, также участвую в проекте по поиску и анализу детерминант митохондриальной гетероплазмии пожилых людей в качестве молекулярного биолога. Научные интересы: эволюция и мутагенез мтДНК, генная инженерия. Хобби: ролевые игры живого действия, театр.

Проект: Pervasive duplication of tumor suppressors in Afrotherians during the evolution of large bodies and reduced cancer risk
Руководитель: Юрий Маловичко

Учусь в Jacobs university в Германии по направлению «Biochemistry and Cell Biology». До переезда в Германию я работала лаборантом-исследователем в Институте цитологии РАН. Наша лаборатория занималась редокс биологией стволовых клеток. Интересы: клеточная биология, молекулярная биология.

Проект: RNA-seq Analysis of Senescent Mesenchymal Stem Cells
Руководитель: Юлия Иванова

Выпускница кафедры зоологии беспозвоночных СПбГУ. Сотрудница Зоологического института РАН. Занимаюсь корнеголовыми ракообразными и особенностями их взаимодействия с нервной системой хозяина с помощью как стандартных морфологических, так и с помощью молекулярных методов (протеомный анализ). Люблю свою кошку и айкидо.

Проект: Comparative transcriptomic analysis of the abdominal ganglia of the hermit crabs Pagurus minutus, non-infected and parasitised by Peltogaster reticulata ("Crustacea": Rhizocephala)
Руководители: Максим Нестеренко, Алексей Миролюбов

Выпускница СПбГМУ им. Павлова (лечебное дело) и University of East Anglia (молекулярная биология). Работаю и прохожу аспирантуру в Институте цитологии РАН, в лаборатории моделирования мембран и ионных каналов. Научные интересы: анализ данных, молекулярная биология.

Проект: Antibacterial action of amyloidogenic peptide R23I on proteome of T. thermophilus
Руководитель: Оксана Гальзицкая

Закончила бакалавриат СПбГУ, поступаю туда же в магистратуру. Работаю над проектами, связанными с изучением трансляции у дрожжей и геномным редактированием.

Проект: Cell types annotation of cycling T lymphocytes in the tumor microenvironment
Руководитель: Сергей Исаев

Студентка магистратуры Сколтеха, направление «Науки о жизни». Магистерская диссертация посвящена роли транскрипционных факторов с неструктурированными доменами в активации транскрипции. Научные интересы: 3D-геномика, эпигенетика, регуляция транскрипции, анализ омиксных данных.

Проект: Optimizing the search for significant SNPs associated with important agronomic traits in plants
Руководители: Елена Григорьева, Лаврентий Данилов

Аспирант Института Биологии Развития. Занимаюсь разработкой систем искусственного сперматогенеза.

Проект: Search for markers of the Sertoli-like cell population we discovered
Руководитель: Елена Новикова

Работаю на биологическом факультете МГУ им. М.В. Ломоносова в лаборатории эндокринологии. Моя работа в бакалавриате была посвящена исследованию различию экспрессии субъединиц Na/K-АТФазы в структурах почки крыс при обструктивном холестазе на фоне гиперпролактинемии; моя работа в магистратуре была посвящена изучению зависимости от пола и солёности воды профилей экспрессии генов пролактинов и его рецепторов в мозге и осморегуляторных органах особей трёхиглой колюшки G. aculeatus. В аспирантуре и в настоящее время я продолжаю исследовать профили экспрессии генов самок и самцов трёхиглой колюшки в различных полевых условиях.

Проект: Comparison of genotype-to-phenotype relations in mouse and human
Руководитель: Юрий Барбитов

Студентка биологического факультета СПбГУ, занимаюсь изучением динамики плюрипотентности в лаборатории молекулярной биологии стволовых клеток в ИНЦ РАН. Помимо науки пытаюсь разобраться в изобразительном, архитектурном исскустве и фитодизайне.

Проект: Interactions in multi-layer biological networks
Руководитель: Юрий Барбитов

Закончила специалитет медико-биологического факультета РНИМУ им. Н.И.Пирогова по специальности медицинская биохимия. 2 года работала в лаборатории эпигенетики МГНЦ. Научная работа посвящена диагностике точковых мутаций с малой представленностью патогенного аллеля. Область научных интересов: молекулярная биология, клиническая и лабораторная генетика. Хобби: путешествия, горные лыжи и настольные игры с друзьями.

Проект: Non-canonical start-codons and where to find them
Руководитель: Ольга Бочкарева

Окончила аграрный факультет РУДН по специальности «Ветеринария». Научные интересы: эпигенетические аспекты в медицине и наследование эпигенетической информации, а также технологии редактирования генома. Люблю интересные задачи по программированию на Python. Увлекаюсь авиацией, люблю волейбол, настольный теннис, горные лыжи, ролики; много читаю.

Проект: Analysis of the genetic changes effect on the manifestation of the prion-like factor [MCS +] in Saccharomyces cerevisiae strains
Руководители: Лаврентий Данилов, Александр Рубель

Выпускник Университета ИТМО по направлению Молекулярная биология и биотехнология. Работаю в лаборатории «Передовые технологии нуклеиновых кислот в генной терапии рака».

Проект: DNsorder: An Application for Designing DNAzymes Sensors Detection of Nucleic Acids

Текущее место работы: Геноаналитика

Студент медицинского факультета Кыргызско–Российского Славянского университета им. Ельцина. Научные интересы: молекулярная биология, геронтология, биоинформатика.

Проект: Non-canonical start-codons and where to find them
Руководитель: Ольга Бочкарева

Бакалавр 4 курса СПбПУ им. Петра Великого направления биотехнические системы и технологии. Являюсь сотрудником НИЛ «Математическая биология и биоинформатика». В данный момент занимаемся изучением взаимодействия паразит–хозяин на примере фузариозного заражения льна.

Проект: Host-pathogen interaction in Fusarium infection of flax
Руководители: Анастасия Самсонова, Александр Канапин

Аспирантка Томского Политехнического Университета. Научные интересы: геномное редактирование, тканевая инженерия. Участвую в выполнении исследовательской работы, направленной на выявление механизмов приобретения стволовости опухолевыми клетками. А также занимаюсь диссертационным исследованием, связанным с исследованием дифференцировки мезенхимальных стволовых клеток под воздействием магнитного поля.

Проект: Taxonomy of the genus Serratia
Руководители: Кирилл Антонец, Антон Шиков

Студентка направления «Медицинская биохимия» ПМГМУ им.И.М. Сеченова, работаю в Лаборатории анализа постгеномных данных Института биомедицинской химии. Занимаемся сравнением экспрессии генов с помощью методов секвенирования ONT и Illumina HiSeq применительно к клеткам печени здоровых доноров и линии карциномы человека HepG2. Принимаю участие в поиске метаболомных маркеров ожирения. Научные интересы: общая и клиническая биохимия, генетика человека, фармакодинамика. Другие увлечения: джаз, мифология, прогулки и путешествия.

Проект: Meat wars: omics for antibacterial production safety
Руководитель: Екатерина Ильгисонис

Студент-биолог в РГПУ им. А.И.Герцена. Пишу диплом в области нейроморфологии в ИЭМ. Интересы: физиология ВНД (особенно памяти) морфология и генетика ЦНС, микроскопия, цифровое зрение, психофармакология.

Проект: Prediction of response to melanoma immunotherapy using gut metagenomic data
Руководитель: Евгений Олехнович

Выпускник лечебного дела ФФМ МГУ 2021. Ординатор 1-го года по специальности неврология ФФМ МГУ. Научная работа связана с поиском новых методов диагностики лобно-височной деменции. Научные интересы: биоинформатика, молекулярная биология, нейродегенеративные заболевания и нейровизуализация.

Проект: Analysis of developmental gene expression dynamics during anterior and posterior regeneration of Platynereis dumerilii (Nereididae, Annelida) and Pygospio elegans (Spionidae, Annelida).
Руководители: Елена Новикова, Максим Нестеренко

Выпускница Биофака МГУ, кафедры физиологии человека и животных. Сейчас работаю в Bostongene аналитиком. Научные интересы: нейробиология, молекулярная биология, иммунология. Из увлечений: иностранные языки.

Проект: Amino acid transfer learning for antibody binding prediction
Руководитель: Дарья Балашова

Являюсь студенткой бакалавриата Pompey Fabra University по Биоинформатике. Работала в Сколтехе, в лаборатории метагеномов, изучала систему бактериального иммунитета PARIS. Ранее изучала эмбриональный скейлинг на модели Nematostella vectensis в лаборатории молекулярных основ эмбриогенеза ИБХ. Научные интересы: молекулярное моделирование и машинное обучение в науках о жизни, геномика. Хобби: походы и путешествия, алтимат фрисби.

Проект: Development of in silico models of metagenomic communities with given properties and a pipeline for their generation
Руководители: Артем Иванов, Владимир Ульянцев