En
Интенсив
«Продвинутые разделы биостатистики»
Следующий набор откроется зимой 2027 года
Курс лекций и практических занятий для специалистов с базовыми знаниями биостатистики и опытом работы в R, которые хотят освоить более сложные методы анализа данных

Подписывайтесь на новости Института биоинформатики

Программа интенсива 2026


8 модулей:

0. Открытие интенсива | Евгений Бакин
1. Смешанные линейные модели | Матвей Славенко
Темы:
– Повторение линейной регрессии, интерпретация и её ограничения, случайные эффекты
– Интерпретация смешанных моделей, разница между фиксированным и смешанным эффектом
– Структуры зависимости, вложенные (nested) и перекрестные (crossed) случайные эффекты
– Заключение, возможные обобщения и альтернативы
2. Продвинутые модели анализа выживаемости | Ольга Мироненко
Темы:
– Непропорциональность рисков
– Эстиманды в анализе выживаемости
– Варьирующиеся во времени ковариаты
– Конкурирующие события
3. Разработка интерактивных приложений в R/Shiny | Владислав Станин
Темы:
– Введение в Shiny (cтруктура кода приложения, базовые элементы интерфейса, основы реактивности, создание первого приложения)
– Расширенные возможности Shiny (интерактивное взаимодействие с графиками, работа с файлами, взаимодействие с пользователем, расширенная кастомизация интерфейса, создание более сложного проекта Shiny-приложения)
4. Машинное обучение в R | Ева Шелли
Темы:
– От статистики к машинному обучению: смена парадигмы
– ML-пайплайн на tidymodels: архитектура и подготовка данных
– Регуляризованные модели: Lasso, Ridge, Elastic Net
– Деревья, случайные леса, бустинг
– Unsupervised learning: кластеризация и снижение размерности
– Клиническая предсказательная модель: от данных до валидации
5. Обработка пропущенных значений | Максим Кузнецов
Темы:
– Паттерны и механизмы пропущенных значений
– Методы статистического вывода в условиях пропущенных значений
– Множественное восполнение
– Восполнение пропущенных значений с использованием пакета mice
6. Методы на основе ресемплинга | Матвей Славенко
Темы:
– Методы аппроксимации и Монте-Карло
– Эмпирическая функция распределения и семплинг из эмпирического распределения, классический непараметрический бутстреп (plug-in principle), оценки и тесты с помощью бутстрепа
– Перестановочные процедуры, ограничения и подводные камни
7. Введение в байесовскую статистику | Евгений Бакин
Темы:
– Элементы теории вероятностей, байесовский взгляд на вероятность
– Априорные и апостериорные распределения, функция правдоподобия
– Оценка параметра и тестирование гипотез
– Вычислительные аспекты работы с Байесовскими моделями, метод Монте-Карло на марковских цепях (MCMC).
– Байесовский анализ в R: пакеты rstan и brms
8. Причинно-следственный вывод | Артемий Охотин и Максим Кузнецов
Темы:
– Введение в модели причинно-следственного вывода
– Модель Перла, графы причинно-следственного вывода (DAG).
– Критерии отбора признаков на основе DAG
– Модель Неймана-Рубина, типы эстимандов
– Методы идентификации причинно-следственного эффекта в модели Рубина
– Специализированные пакеты: Daggity, matchIt

Для кого этот интенсив

Ожидания от участников:


  • Уверенное использование R (в частности, знание методов работы с табличными данными и построения графиков)

  • Классические методы однофакторного анализа: t-тест, тест Манна-Уитни-Уилкоксона, тесты на таблицах сопряженности

  • Методы многофактороного анализа: простые линейные и логистические регрессии, ANOVA

Преподаватели

  • Евгений Бакин
    Руководитель программы
    кандидат технических наук, биостатистик

  • Максим Кузнецов
    Разработчик биостатистического программного обеспечения
  • Ольга Мироненко
    Кандидат экономических наук, биостатистик
  • Артемий Охотин
    Врач–кардиолог
  • Матвей Славенко
    Биостатистик
  • Владислав Станин
    Биоинформатик
  • Ева Шелли
    Биостатистик

Прошедшие интенсивы

2026 год
Интенсив проходил с 24 февраля по 28 апреля 2026 года в онлайн-формате
Программа интенсива

Участники:
  1. Авизова Зейнеп | НАО «Западно-Казахстанский медицинский университет им.М.Оспанова»
  2. Аксенова Мария | АО Генериум
  3. Бердибеков Бектур | ФГБУ НМИЦ ССХ им. А.Н. Бакулева
  4. Бердинских Евгений | X7 Research
  5. Власенок Мария | Сколтех
  6. Волков Дмитрий | ФГБОУ ВО СГМУ МЗ РФ г. Архангельск
  7. Воробьев Анатолий | Р-фарм
  8. Гладков Григорий | Институт сельскохозяйственной микробиологии
  9. Горбунова Ирина | Европейский университет в Санкт-Петербурге
  10. Гордеев Алексей | ФГБУ НМИЦ им. В.А. Алмазова
  11. Гринберг Михаил | Mbayes / СПбГУ
  12. Гурия Мария | АО ГЕНЕРИУМ
  13. Гущина Светлана | АО «НПО Дом Фармации»
  14. Деркачев Иван | Герофарм
  15. Дерябин Павел | ИНЦ РАН
  16. Дорохин Александр | АО БИННОФАРМ
  17. Драгунов Дмитрий | РНИМУ им. Н.И. Пирогова
  18. Журавлева Светлана | ИВНД и НФ РАН
  19. Завалишин Арсений | TuneCT CRO
  20. Иванова Екатерина | Ифарма
  21. Игнатьев Семен | ФБУН «ФНЦГ им. Ф. Ф. Эрисмана» Роспотребнадзора
  22. Иконникова Анна | ИМБ РАН
  23. Каплина Александра | НМИЦ им. В. А. Алмазова, НИЛ физиологии и патологии новорожденных, ИТМО
  24. Касьянова Мария | ЛАБМГМУ
  25. Корсакова Наталья | ФГБУ РосНИИГТ ФМБА России
  26. Кузина Екатерина | НИЯУ МИФИ
  27. Лизунова Наталья | ФГАУ НМИЦ здоровья детей
  28. Линд Катерина | Уральский Федеральный Университет
  29. Литвинчук Дмитрий | Учреждение образования Белорусский государственный медицинский университет
  30. Малыхина Инна | ООО «ЛАБМГМУ»
  31. Матросов Сергей | X5 Retail Group
  32. Мухортова Полина | ФГБУ ЦЭККМП Минздрава России
  33. Никольская Екатерина | Astrazeneca
  34. Нуриева Ильнара | APTOS LLC, Statandocs
  35. Петкова Анна | Р-фарм
  36. Петренко Екатерина | Technion
  37. Плетенев Илья |ФГБУ ЦСП ФМБА России
  38. Сапрыгин Александр | НИИНМ
  39. Сотников Богдан | ООО Геноаналитика
  40. Станин Владислав | Санкт-Петербургский политехничсекий университет Петра Великого
  41. Туканов Данил | ИИФ УрО РАН / ГАУЗ СО ЦГКБ №24
  42. Фам Тхи Хонг Зунг | КРКА ФАРМА
  43. Царегородцев Сергей | ФГБОУ ВО Российский университет медицины Минздрава России
  44. Черкасов Никита | ФГБНУ НЦПЗ, НИУ ВШЭ
  45. Шевелева Елизавета | Лаборатория иммунной инженерии, Сеченовский университет
  46. Шелудченко Максим | Health& Nutrition (ex-Danone)
2025 год
Интенсив проходил с 5 по 30 апреля 2025 года в онлайн-формате
Программа интенсива

Участники:
  1. Багаева Наталья | ООО "ЦФА"
  2. Гаранина Ирина | Parexel
  3. Гурия Мария | МФТИ
  4. Денисова Елена | МГУ
  5. Деркачев Иван | Герофарм
  6. Дерябин Павел | Институт цитологии РАН
  7. Дроков Михаил | ФГБУ "НМИЦ гематологии"
  8. Ершов Даниил | НМИЦ им. В.А.Алмазова
  9. Ильина Ольга | UKJ
  10. Иманалиев Медер | Charité – Universitätsmedizin Berlin
  11. Календр Роман | Генериум
  12. Катунинкс Николай | Московский центр инновационных технологий в здравоохранении
  13. Каштанов Максим
  14. Красько Ольга | Академия Наук Беларуси
  15. Курпе Станислав | BostonGene
  16. Лазарева Анастасия | НИИ СБМ
  17. Лазарев Андрей | БИОКАД / СПбГУТ им. проф. Бонч-Бруевича
  18. Лакман Ирина | Уфимский университет науки и технологий
  19. Левченко Диана | РАУ, BostonGene, ЕрФИ
  20. Потамошнева Анастасия | Georg-August Universität Göttingen
  21. Потанина Ольга | Смуз Драг Девелопмент
  22. Селезнева Алиса | БИОКАД
  23. Семенов Савва | МФТИ
  24. Смирнов Антон | РНИМУ им. Н.И. Пирогова
  25. Соколов Александр | Система-Биотех
  26. Тарасов Олег | Независимый исследователь и преподаватель
  27. Тыщук Константин | BIOCAD
  28. Уварова Виктория | ФНЦИРИП им. М.П. Чумакова РАН
  29. Химич Екатерина | РТУ МИРЭА, Институт тонких химических технологий имени М.В. Ломоносова
  30. Цурикова Надежда | ООО ПЛЮС
  31. Шальнова Мария | Окский заповедник
2024 год
Интенсив проходил с 6 по 27 апреля 2024 года в онлайн-формате
Программа интенсива

Участники:
  1. Белоусов Дмитрий | BostonGene
  2. Бондарев Станислав | СПбГУ
  3. Бочкарева Мария | R&D ГЕРОФАРМ
  4. Бурлов Никита | Городская больница
  5. Буян Андрей | Институт Белка РАН
  6. Валиев Иван | BostonGene LLC
  7. Волков Никита | ПСПбГМУ им. акад. Павлова
  8. Гладышев Никита | СЗГМУ им. Мечникова
  9. Грешнова Александра | Max Planck Institute for Evolutionary Biology
  10. Дроздова Полина | Иркутский государственный университет
  11. Лебедев Иван | СПбГУ
  12. Линд Катерина | АНО ВО Университет «Сириус»
  13. Лихолетова Дарья | Институт биоинформатики
  14. Логвин Федор | SCAMT ITMO / Parexel
  15. Лукашевич Надежда | BostonGene
  16. Матвиенко Юлия | ФГБУ "НМИЦ им. В.А. Алмазова"
  17. Попов Александр | ИНЭОС РАН
  18. Романько Александр | НМИЦ онкологии им Н.Н. Петрова
  19. Селезнева Алиса | Герофарм
  20. Скрябина Александра | ФИЦКИА УроРАН
  21. Смирнов Виктор | BostonGene
  22. Сотников Богдан | ООО Геноаналитика
  23. Суворова Юлия | Биотек Кампус / ФИЦ Биотехнологии РАН
  24. Трифонова Юлия | University of Salzburg
  25. Филатова Анастасия | ФГБУ "НМИЦК им. ак. Е.И. Чазова" Минздрава России
  26. Филимонова Ирина | ФГАУ «НМИЦ здоровья детей» Минздрава России
  27. Фофанова Елизавета | ИБР РАН
  28. Хрулев Алексей| ООО "ЭйМИ"
  29. Хуторной Иван | МГУ им. Ломоносова
  30. Чугаева Валерия | Weizmann Institute of Science, Israel
  31. Шагам Лев | Hadassah Medical Center

Отзывы

Контакты

Институт биоинформатики
Cанкт-Петербург, ул. Кантемировская 2А,
Бизнес-центр «Таймс»

Занятия онлайн на платформе Zoom

Вопросы – biostat@bioinf.me
© Bioinformatics Institute
Об институте
направления
Мы в сети