Программа предназначена для людей с техническим и математическим образованием, которые хотят погрузиться в мир биоинформатики. Особое внимание уделяется алгоритмическим подходам и основам молекулярной биологии для понимания актуальных проблем. Программа познакомит слушателей с современными методами анализа данных NGS и направлениями биоинформатических исследований
Формат
Онлайн занятия суббота c 16 до 19:30 МСК, вторник и четверг с 19 до 21 МСК с 28 сентября по 14 декабря. Лекции, семинары, мини-проект.
Стоимость
Для физических лиц – 29 000 руб Для юридических лиц – 35 000 руб
При успешном окончании выдаётся удостоверение о повышении квалификации Института биоинформатики
Чему вы научитесь:
«Алгоритмическая биоинформатика 2.0» – программа для студентов и выпускников математических, физических и технических специальностей, которые хотят начать свое знакомство с биоинформатикой.
По окончании вы:
узнаете основы молекулярной биологии;
получите опыт реализации реальных биоинформатических алгоритмов;
познакомитесь с пайплайнами и методами статистического анализа для обработки биологических данных;
примените в проекте полученные знания и навыки.
Учебная программа включает в себя:
Молекулярная биология
Строение генов и геномов, матричные процессы, регуляция экспрессии генов, обмен веществ и жизненный цикл клетки, генетическая изменчивость, базовая иммунология, наследственные болезни человека и онкогенетика
Алгоритмы в биоинформатике
Технологии секвенирования и форматы данных, выравнивание геномных последовательностей, алгоритмы геномной сборки, анализ вторичной структуры РНК, метагеномика, филогенетика, марковские модели
Работа в командной строке
ssh, awk, grep, zcat, sed, построение пайплайнов и snakemake, базовая работа с геномными утилитами: bwa, samtools, bedtools.
Введение в статистику
Независимые события, полная и условная вероятность, распределения случайных величин, центральная предельная теорема, теорема Байеса, тестирование гипотез, p-value, ошибки первого и второго рода, тест хи-квадрат, t-тест, корреляция и каузация
Гостевые лекции
Обзорные лекции от ученых по разным направлениям биоинформатики. Лекции поcвященные карьере, навыкам и компетенциям современного биоинформатика.
Проект
Воспроизведение результатов опубликованных статей, реанализ данных и написание тезисов под руководством опытных наставников.
Стоимость обучения
29 000 рублей – для физических лиц
35 000 рублей – для юридических лиц
По результатам конкурсного отбора, студенты (бакалавры и магистранты) и аспиранты очной формы обучения в вузах могут претендовать на грант, частично покрывающий стоимость обучения
Выпускникам программ переподготовки и повышения квалификации Института биоинформатики предоставляется скидка 10%
Поступление и обучение
Зачем вам эта программа
Биоинформатика – динамично развивающаяся область. Программа даст Вам возможность расширить область знаний и применений своих навыков. Программа предназначена для специалистов, планирующих как научную карьеру, так и работу в индустрии.
Также на тестировании и занятиях потребуются знание математики, алгоритмов и программирования на уровне первых курсов технических специальностей в ВУЗах.
Грант
Для того, чтобы претендовать на грант, участнику необходимо написать мотивационное письмо во время заполнения заявки на поступление. На получение гранта могут претендовать только студенты очной формы обучения (бакалавры, магистранты, аспиранты) в вузах. Гранты распределяются по окончании отбора в виде скидки на обучение.
Обучение
28 сентября – 30 ноября: онлайн занятия по субботам c 16:00 до 19:30 МСК, вторникам и четвергам с 19:00 до 21:00 МСК
1 декабря – 14 декабря: работа над групповым проектом под руководством наставников
Wellcome Sanger institute, Human Genetics Informatics
Командная строка
Артем Косьмин
Институт биоинформатики
Молекулярная биология
Александра Ливанова
Human Technopole, Milan, Italy
Молекулярная биология
Владимир Пирогов
École Supérieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris
Введение в статистику
Часто задаваемы вопросы
Обязательно ли иметь техническое (математическое или программистское) образование?
Нет. Это программа повышения квалификации, поэтому если у вас есть желание учиться новому и в дальнейшем связать свою жизнь с биоинформатикой – вам подойдет эта программа! Но, безусловно, знания в области математики и алгоритмов будут нужны в процессе обучения!
Нет. Это программа повышения квалификации, поэтому если у вас есть желание учиться новому и в дальнейшем связать свою жизнь с биоинформатикой – вам подойдет эта программа! Но понимание основ биологии на уровне старших классов школы будут необходимы для успешного прохождения тестирования и обучения!
У меня есть биологическое/медицинское образование. Подойдет ли мне эта программа?
Программа в первую очередь нацелена на людей с техническим бэкграундом, поэтому треть лекций посвящены введению в молекулярную биологию, а в лекциях по алгоритмам не уделяется время основам высшей математики. Если вы оцениваете свои знания молекулярной биологии как начальные и при этом умеете программировать, то вы можете подавать заявку на программу.
Однако если ваша цель – научиться проводить анализ биологических данных, советуем обратить внимание на интенсивы Института биоинформатики.
Вы рекомендуете онлайн-курсы на Stepik, обязательно ли их проходить?
Нет, прохождение этих курсов не требуется для поступления, но они могут помочь подготовиться к тестированию (обязательному этапу поступления).
Что будет на тестировании и как к нему подготовиться, известен ли проходной балл?
Тестирование состоит из контрольных вопросов (с одним или несколькими вариантами ответов) по молекулярной биологии, небольших задач по дискретной математике, комбинаторике и теории вероятностей, а также трех задач на реализацию алгоритмов на любом языке программирования. Для подготовки мы рекомендуем вам пройти вышеупомянутые курсы на Stepik.
Проходной балл рассчитывается каждый год заново на основе результатов тестирования абитуриентов.
Как и когда можно будет узнать результаты тестирования?
Результаты будут отправлены каждому абитуриенту на почту, указанную в анкете, до 15 августа включительно.
Что будет на собеседовании?
Собеседование длится 20 минут.
Абитуриенты общаются с комиссией, отвечают на вопросы по знаниям и навыкам, а также рассказывают о своей мотивации обучаться на программе. На результаты собеседования также влияют ответы из анкеты и соответствие программы и ожиданий поступающего.
Как и когда можно будет узнать итоговые результаты отбора?
Результаты будут отправлены каждому приглашенному на этап собеседований абитуриенту на почту, указанную в анкете, до 9 сентября включительно.
Можно ли получить налоговый вычет за оплату программы?
Да, можно получить 13% от стоимости программы. Для этого нужно будет предоставить чек об оплате, оферту и образовательную лицензию.
Контакты
Институт биоинформатики Cанкт-Петербург, ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»