выпускники 2025/26

Программа биостатистики Программа биоинформатики

Все выпускники этого направления прослушали курсы:

Дискретная математика
Статистика и анализ данных в R
Основы работы в Linux
Программирование на Python
Введение в машинное обучение
Практикум по анализу данных NGS

Также во время обучения им были доступны предметы по выбору:

Молекулярная филогенетика
Молекулярная эволюция
Алгоритмы в биоинформатике

Обучение в 2024-2025 годах проходило в онлайн формате.

Обязательной частью обучения было выполнение научно-исследовательского проекта в весеннем семестре.

Акиньшина Aлёна

Я окончила Университет Саутгемптона (бакалавр биологии). Работала почти 5 лет в области молекулярно-генетической диагностики, разрабатывала тест-системы и обрабатывала данные NGS. Среди моих научных интересов: эволюционная генетика, эпигенетические часы, а также персонализированная медицина, в том числе орфанных заболеваний. Люблю природу и музыку, коллекционирую винил.

Проект: Анализ консервативных геномных регионов у злаков (Poaceae)
Руководитель: Петр Журбенко
____________________________________________________________________________________________________________________

Ануров Артемий

ФГБУ "ЦСП" ФМБА, ИМБ РАН

Аспирант ИМБ РАН, аналитик в ЦСП ФМБА, изучаю Метаболомики бактерий.

Проект: Различия в составе микробиома у вегетарианцев и невегетарианцев: изучение путей деградации сульфохиновозы
Руководитель: Анна Рыбина, Сколтех
____________________________________________________________________________________________________________________

Афанасьева Валерия

ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И. М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет)

Учусь на педиатрическом факультете ПМГМУ им. Сеченова, также обучалась на Цифровой кафедре Сеченова. Со школы считаю биоинформатику интереснейшей областью, находящейся на стыке биолого-технических наук.

Проект: Углубление знаний об амфиподах: обновление приложения speCOIdent для анализа результатов штрихкодирования ДНК
Руководитель: Полина Дроздова
____________________________________________________________________________________________________________________

Басова Виктория

СЗГМУ им. И.И.Мечникова

Окончила СЗГМУ им. И. И. Мечникова. Научные интересы: биоинформатика, эпидемиология, молекулярная биология.

Проект: Исследование тканеспецифичных свойств адаптивного иммунитета по данным РНК-секвенирования
Руководители: Даниил Луппов, Елизавета Власова, Михаил Шугай
____________________________________________________________________________________________________________________

Беляков Матвей

ФГБОУ ВО СПХФУ

Студент СПХФУ. Интересуюсь ML и его применением в проектировании структуры белков и изучении их физических и химических свойств. Научные интересы: биоинформатика, математическое моделирование. Хобби: хайкинг, теннис, гитара, алгоритмические задачи.

Проект: Оптимизация представлений последовательностей T-клеточного рецептора и соответствующего антигена с использованием нейронных сетей
Руководители: Михаил Шугай, Елизавета Власова
____________________________________________________________________________________________________________________

Боровикова София

ИБГ РАН

Младший научный сотрудник в группе клеточных и генных технологий в Институте биологии гена РАН. Наша лаборатория занимается разработкой клеточной терапии ВИЧ-инфекции на основе CRISPR/Cas9. На данный момент я работаю над проектом по поиску новых защитных пептидов-ингибиторов слияния ВИЧ. Научные интересы: редактирование генома, ингибиторы проникновения ВИЧ.

Проект: Поиск новых иммунных систем в метагеномах микробных сообществ
Руководители: Оксана Котовская, Полина Горшенина
____________________________________________________________________________________________________________________

Вашунина Дарья

Яндекс

Выпускница Биофака МГУ, после окончания университета работаю в Яндексе с перерывом на 3 года жизни в Саудовской Аравии, где я снова оказалась в лаборатории в качестве Research Assistant в Red Sea Research Center (KAUST). Там я заинтересовалась анализом NGS данных, популяционной биологией и филогенетикой, и теперь мечтаю выйти из айти и вернуться в науку.

Проект: Сравнение паттернов вариаций генома у современных и древних людей
Руководитель: Юрий Барбитов
____________________________________________________________________________________________________________________

Вишняков Кирилл

ФГБУ "ВНИИКР"

Закончил магистратуру по направлению «Биотехнология» в РГАУ-МСХА им. Тимирязева. В настоящее время работаю в отделе инвазивных видов растений ФГБУ «ВНИИКР», где занимаюсь разработкой молекулярно-генетических методов для идентификации карантинных видов растений. Бакалавриат заканчивал по направлению «Садоводство» там же, с темой диплома «Изучением гена, кодирующего центромер-специфичный гистон H3 (CENH3) у Allium cepa». Есть интерес к селекции растений и в целом их генетике. Занимаюсь физкультурой, регулярный донор крови.

Проект: Анализ консервативных геномных регионов у злаков (Poaceae)
Руководитель: Петр Журбенко
____________________________________________________________________________________________________________________

Дементьева Елена

Выпускница РХТУ им. Д.И. Менделеева по специальности биотехнология. В настоящее время участвую в программе Аграрного университета Грузии, направленной на улучшение методов культивирования базидиальных грибов, пригодных для биоконверсии лигноцеллюлозы и ремедиации почв. Ранее работала в Центре стратегического планирования ФМБА России, Nearmedic и Evrogen, где занималась разработкой продуктов для молекулярной диагностики.

Проект: Анализ консервативных геномных регионов у злаков (Poaceae)
Руководитель: Петр Журбенко
____________________________________________________________________________________________________________________

Зайцева Юлия

ИБГ РАН

Закончила кафедру биохимии Биологического факультета МГУ, ранее занималась исследованием in vitro и in vivo свойств белков Аргонавтов, вовлеченных в защитные системы прокариот. Научные интересы: инструменты редактирования генома, иммунные системы прокариот, изучение белок-белковых взаимодействий. В свободное время занимаюсь рисованием.

Проект: Исследование траекторий омоложения в эмбриогенезе и клеточном репрограммировании с использованием сигнатур старения
Руководитель: Евгений Ефимов
____________________________________________________________________________________________________________________

Иштуганова Валерия

СПбГУ

Выпускница кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ. Моя научная деятельность связана с получением рекомбинантных белков с помощью микроорганизмов и оптимизацией условий культивирования. Также я работаю над проектом по созданию вакцин на основе рекомбинантных ДНК. Научные интересы включают изучение регуляции экспрессии генов, молекулярное моделирование и машинное обучение. Люблю путешествовать и читать художественную литературу.

Проект: Разработка алгоритма поиска мишеней eRNAi по данным мультиомиксного анализа
Руководители: Даниил Смутин, Леонид Адонин
____________________________________________________________________________________________________________________

Калинина Анна

Выпускница ФФМ МГУ и магистратуры Сколтеха. Все еще в поисках себя... у биолога нет цели, только путь.

Проект: Исследование траекторий омоложения в эмбриогенезе и клеточном репрограммировании с использованием сигнатур старения
Руководитель: Евгений Ефимов
____________________________________________________________________________________________________________________

Калитина Полина

ИБГ РАН

Успела поработать на проектах разных направлений - занималась созданием клеточных моделей в бакалавриате и магистратуре. Делала индуцируемую систему дегрона субъединицы когезина RAD21 и модель хромосомной транслокации генов AFDN и KMT2A в клетках человека.

Проект: Инвертоны как источник программируемой изменчивости в иммунных системах бактерий
Руководитель: Оксана Котовская
____________________________________________________________________________________________________________________

Карицкая Полина

НГУ

В этом году закончила ФЕН НГУ, кафедру молекулярной биологии и биотехнологии. Работала в ИХБФМ СО РАН и изучала гены, ассоциированные с развитием глиобластомы человека, и создавала клеточные линии, экспрессирующие систему нокдауна на основе CRISPR/CasRx. Работала в студенческом стартапе на должности биоинформатика и занималась предсказанием наилучшего варианта терапии для пациентов. Сейчас поступила на магистерскую программу на ФИТ НГУ. Исследую сложные структурные перестройки (хромотрипсис и хромоплексия). Область интересов - биоинформатика, онкогенетика, транскриптомика, анализ данных и машинное обучение в биологии. Очень люблю лошадей и в свободное время занимаюсь конным спортом :)

Проект: Single-cell анализ общих и специфичных для ткани происхождения транскрипционных программ при различных типах рака
Руководитель: Андрей Юрченко
____________________________________________________________________________________________________________________

Качановский Марк

Сколтех (Skoltech)

Выпускник лечебного факультета и ординатуры по неврологии Сеченовского университета. Аспирант Сколтеха. Занимаюсь изучением когнитивных нарушений (деменции) и поиском маркеров нейродегенеративных заболеваний. Увлечение: литература, спорт, интеллектуальные игры.

Проект: Транскриптомный анализ регенерации нервной системы Alitta virens
____________________________________________________________________________________________________________________

Кичигина Наталья

ФГБНУ ВНИИСХМ

Выпускница бакалавриата по направлению «Почвоведение» и магистратуры «Экология. Биоразнообразие и охрана природы» СПБГУ. С 2014 года работаю во ВНИИСХМ, с 2019 года занимаюсь изучением арбускулярно-микоризных грибов. Научные интересы: арбускулярная микориза у гороха посевного и других растений; абиотические стрессы (загрязнение почвы нефтепродуктами и тяжёлыми металлами) и их влияние на микроорганизмы и растения.В свободное время провожу МК по полимерной глине, а также участвую в творческих фестивалях. Увлечения: лепка из полимерной глины, декор предметов, флористика.

Проект: Характеристика ABC АТФаз, связанных с иммунной функцией у прокариот.
____________________________________________________________________________________________________________________

Кожевникова Елена

ИМКБ СО РАН

Закончила Новосибирский Государственный Университет. Работаю в Институте молекулярной и клеточной биологии (Новосибирск), изучаю роль метаболизма в регуляции клеточных и системных процессов.

Проект: Изучение иерархии регуляции генов при болезни Крона с использованием байесовских сетей
Руководитель: Максим Стручалин
____________________________________________________________________________________________________________________

Козлова Полина

СИБГМУ, ЦНИЛ

Выпускница Биологического института ТГУ, лаборант-исследователь СибГМУ. Исследую механизмы метастазирования опухолей с помощью геномного редактирования раковых клеток. Люблю настольные игры, приключенческую литературу и животных.

Проект: Решение задач классификации на эмбеддинговых представлениях геномных данных
Руководитель: Никита Сапожников
____________________________________________________________________________________________________________________

Комолов Александр

НИЦ "Курчатовский институт"

Работаю в НИЦ "Курчатовский институт". Область интересов - биотехнология. Занимаюсь разработкой технологии получения рекомбинантных белков в E.coli в форме активных телец включения.

Проект: Оптимизация представлений последовательностей T-клеточного рецептора и соответствующего антигена с использованием нейронных сетей
Руководители: Михаил Шугай, Елизавета Власова
____________________________________________________________________________________________________________________

Кравченко Мария

СПбГУ

Проект: Разработка алгоритма поиска мишеней eRNAi по данным мультиомиксного анализа
Руководители: Даниил Смутин, Леонид Адонин

____________________________________________________________________________________________________________________

Кудашева Эвелина

Первый МГМУ им. И.М. Сеченова

Студентка факультета биоинженерии и биоинформатики ПМГМУ. Сейчас работаю над проектом в области старения межклеточного матрикса. Занимаюсь и мокрой частью, и анализом дифференциальной экспрессии генов.

Проект: Исследование траекторий омоложения в эмбриогенезе и клеточном репрограммировании с использованием сигнатур старения
Руководитель: Евгений Ефимов
____________________________________________________________________________________________________________________

Кузнецова Антонина

Сколтех

Выпускница РНИМУ им. Н.И. Пирогова, работала в МГНЦ им. Н.П. Бочкова с подходами к коррекции сплайсинга. Сейчас в аспирантуре Сколтеха работаю над изучением механизмов непродуктивного сплайсинга в раке.

Проект: Эволюция паралогов CLK и роль непродуктивного сплайсинга в них
Руководители: Дмитрий Скворцов, Дмитрий Первушин
____________________________________________________________________________________________________________________

Куленич Виктория

ФГБОУ ВО СибГМУ Минздрава России

Выпускница СибГМУ (медицинская кибернетика). Работаю в НОЛ "Живая лаборатория популяционных исследований" СибГМУ, занимаюсь анализом данных различных исследований. Научные интересы - метагеномика, эпигенетика, анализ данных, машинное обучение, структурная биоинформатика. Увлечения - музыка, спорт, языки.

Проект: Влияние белков группы Polycomb на экспрессию генов
Руководитель: Никита Ваулин
____________________________________________________________________________________________________________________

Куликов Егор

ФНЦ «ВНИТИП»

Заведующий лаборатории прикладной генетики ФНЦ "ВНИТИП". Занимаюсь исследованиями развития репродуктивной системы птиц, веду работу по внедрению геномной селекции на отечественных кроссах кур мясного и яичного направления продуктивности.

Проект: Роль хроматин-ремоделирующего фактора CHD1 в регуляции дозовой компенсации у дрозофилы
Руководитель: Александр Конев
____________________________________________________________________________________________________________________

Лебедева Екатерина

ФГБУ ГНЦ “Институт иммунологии” ФМБА России

Кандидат биологических наук и старший научный сотрудник отдела иммунной биотехнологии в ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА. Специализируюсь в области молекулярной и клеточной иммунологии и иммуноонкологии. В настоящее время занимаюсь поиском подходов к персонализированному лечению злокачественных опухолей на основе системного анализа опухоли методами иммунологии, генетики, цитологии и экспериментальной биологии.

Проект: Диагностические сигнатуры миелоидных клеток периферической крови при аутоиммунных болезнях
Руководитель: Александр Зайцев
____________________________________________________________________________________________________________________

Ли Артур

ИБР РАН

Окончил Сеченовку по специальности " Медицинская биохимия", вместо клинической практики выбрал фундаментальную науку и почти не жалею об этом. Поступил в аспирантуру, изучал молекулярно-генетические механизмы развития атеросклероза, ушел из аспирантуры, пришел на соискательство в ИБР РАН, занимаюсь разработкой терапевтических препаратов на основе рекомбинантных белков. Слушаю Taylor Swift. Пишу посты для "Биомолекулы".

Проект: Идентификация транскриптомных маркеров ответа на анти-TNFα терапию при воспалительных заболеваниях кишечника
Руководитель: Мария Салютина

____________________________________________________________________________________________________________________

Макеева Арина

ФБМФ МФТИ

Выпускница кафедры физиологии растений биофака МГУ. Работаю в лаборатории системного анализа белков и пептидов ИБХ РАН, в данный момент моей областью интереса является изучение сигнальных пептидов, вовлеченных в иммунный ответ и взаимодействия с ризосферными организмами.

Проект: Поиск геномных вариаций в геномах Fusarium oxysporum и Linum usitatissimum
Руководители: Анастасия Самсонова , Александр Канапин, Владислав Станин

____________________________________________________________________________________________________________________

Малышева Полина

СПбГУ

Студент 4 курса Биологического факультета СПбГУ. Занимаюсь изучением CRISPR-Cas систем и их применением в биотехнологии. Научные интересы: молекулярная биология, защитные системы прокариот, протеомика. Люблю творог, слушать разные парфюмы и ходить на выставки.

Проект: Исследование комбинированных сигналов отбора в геноме человека
Руководители: Юрий Барбитов

____________________________________________________________________________________________________________________

Михайлова Александра

ВИР

Выпускница Института Химии (бакалавриат, магистратура) и Биологического факультета (аспирантура) СПбГУ. На данный момент являюсь научным сотрудником лаборатории постгеномных исследований в ВИРе, где занимаюсь исследованием структурно-функциональной организации регуляторных генов MBW, контролирующих биосинтез фенольных пигментов в окрашенном волокне хлопчатника, а также созданием линий свеклы столовой с повышенным содержанием беталаиновых пигментов в мякоти с помощью подходов геномного редактирования. Научные интересы: молекулярная биология, генетика растений. В свободное время музицирую, практикую йогу и катаюсь на беговых лыжах.

Проект: Роль хроматин-ремоделирующего фактора CHD1 в регуляции дозовой компенсации у дрозофилы
Руководитель: Александр Конев

____________________________________________________________________________________________________________________

Мурадова Гюльгаз

РМАНПО

Выпускница РМАНПО кафедры медицинской генетики, клинический генетик. Работаю аналитиков данных NGS. Интересуют моногенные заболевания, механизм их наследования, устройство генома.

Проект: gbtools: хэширование генетических сигнатур в данных WES и WGS
Руководитель: Федор Коновалов

____________________________________________________________________________________________________________________

Назарова Алина

МГУ им. М.В. Ломоносова

Студентка МГУ имени М.В. Ломоносова магистерской программы "Структурная биология и биотехнология". Темы научных интересов: структурная биология, строение хроматина, эпигеномика, транскрипция, а также механизмы работы системы CRISPR/Cas на нуклеосомном субстрате. Люблю готовить, путешествовать по России и фотографировать.

Проект: Влияние белков группы Polycomb на экспрессию генов
Руководитель: Никита Ваулин

____________________________________________________________________________________________________________________

Осипов Алексей

ИТМО

Закончил ЯрГУ им. П.Г. Демидова по специальности биология. Обучаюсь в магистратуре университета ИТМО на международной программе "Молекулярная биология и биотехнология". Занимался разработкой бинарных дезоксирибозимов для обнаружения метилирования, в данный момент приступаю к научной работе в лаборатории Экспериментальной онкологии. Научные интересы: молекулярная онкология, синтетическая летальность, генетическая инженерия. Хобби: научпоп, гитара, путешествия, философия, история, языки. Учу Deutsch.

____________________________________________________________________________________________________________________

Павленова Кристина

АО «Биокад»

Закончила магистратуру на кафедре молекулярной биофизики и физики полимеров физфака СПбГУ в 2018 году. Занималась изучением взаимодействия металлокомплексов с молекулой ДНК. С 2020 года работаю в биотехнологической компании в департаменте фармацевтической разработки белковых препаратов.

Проект: Углубление знаний об амфиподах: обновление приложения speCOIdent для анализа результатов штрихкодирования ДНК
Руководитель: Полина Дроздова
____________________________________________________________________________________________________________________

Пацкан Иван

ТГУ

Аспирант 1 курса НИ ТГУ по направлению "Генетика", научную работу выполняю на базе Лаборатории молекулярной терапии рака НИИ Онкологии Томского НИМЦ. Занимаюсь изучением межклеточных взаимодействий опухолевого микроокружения и клеток опухоли, пространственной организации и гетерогенности рака молочной железы методом пространственной транскриптомики. Планирую развиваться и в других методах транскриптомики (bulk RNA-seq, scRNA-seq) и применять их в рамках своей научной деятельности. Научные интересы: фундаментальная онкология, опухолевое микроокружение, иммунотерапия.

Проект: Single-cell анализ общих и специфичных для ткани происхождения транскрипционных программ при различных типах рака
Руководитель: Андрей Юрченко
____________________________________________________________________________________________________________________

Полузеров Савелий

СПбГУ

Учусь и работаю на кафедре зоологии беспозвоночных СПбГУ. Занимаюсь филогенией, систематикой и ультраструктурой центрохелидных солнечников и других амебоидных протистов. Научные интересы: зоология беспозвоночных, протистология, молекулярная филогения, ультраструктура, симбиозы центрохелид и хлорелл.

Проект: Поиск внутриклеточных (гипер)паразитов в геномах и транскриптомах членистоногих, аннелид и их полостных паразитов в открытых базах данных
Руководители: Елена Насонова, Михаил Райко

____________________________________________________________________________________________________________________

Пономарева Анна

Сколтех

Аспирант Сколтеха 1 года. Основная научная область - биоинформатика и биостатистика. Занимаюсь анализом омиксных данных (ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq). Мои научные проекты посвящены изучению SIRT6 - одного из генов, регулирующих старение организма. В свободное время активно занимаюсь спортом и танцами.

Проект: Исследование траекторий омоложения в эмбриогенезе и клеточном репрограммировании с использованием сигнатур старения
Руководитель: Евгений Ефимов

____________________________________________________________________________________________________________________

Пыркин Владислав

Биопрактика

Выпускник аспирантуры биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова. Работаю микробиологом-исследователем в компании ООО "Биопрактика". Сфера научных интересов: микробная экология, углеводородокисляющие микроорганизмы, метанотрофные бактерии, биотехнология, микробный белок. Хобби: путешествия, туризм, велосипед.

Проект: Различия в составе микробиома у вегетарианцев и невегетарианцев: изучение путей деградации сульфохиновозы
Руководитель: Анна Рыбина

____________________________________________________________________________________________________________________

Рахимов Булат

НИУ ВШЭ

Выпускник Санкт-Петербургского Технологического института по направлению "Биотехнология". На данный момент студент 1-го курса магистратуры факультета компьютерных наук НИУ ВШЭ. Занимаюсь исследованием 3D структуры хроматина с помощью методов машинного обучения. Научные интересы: 3D организация хроматина, машинное обучение.

Проект: Роль вторичных структур ДНК в нейронспецифической регуляции Polycomb-репрессивным комплексом
Руководители: Мария Попцова, Екатерина Храмеева

____________________________________________________________________________________________________________________

Решетникова Галина

СПбГУ

Выпускница кафедры генетики и биотехнологий биологического факультета СПбГУ. Занимаюсь изучением генов биосинтеза антоцианов у злаковых. Научные интересы: генетика растений, молекулярная биология, селекция.

____________________________________________________________________________________________________________________

Рязанцев Дмитрий

ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М.Лопухина ФМБА России

Закончил биохимию РНИМУ им. Пирогова. Научные интересы: молекулярная биология, биоинформатика, иммуноонкология, использование омиксных подходов в медицине, машинное обучение, биология старения. Увлекаюсь анимацией и современным искусством.

Проект: Исследование тканеспецифичных свойств адаптивного иммунитета по данным РНК-секвенирования
Руководители: Даниил Луппов, Елизавета Власова, Михаил Шугай

____________________________________________________________________________________________________________________

Самусик Вероника

____________________________________________________________________________________________________________________

Степанова Валерия

ИБХ РАН

Выпускница Сеченовского университета. К.б.н. Работаю в ИБХ РАН/Центре Димы Рогачева. Научные интересы - иммунология, генная терапия, нейробиология, онкогематология, CAR-T терапия. Изучаю и разрабатываю новые подходы в области адоптивной иммунотерапии

Проект: Single-cell анализ общих и специфичных для ткани происхождения транскрипционных программ при различных типах рака
Руководитель: Андрей Юрченко
____________________________________________________________________________________________________________________

Финк Максим

СПбГУ

Магистрант СПбГУ. Занимаюсь разработкой клеточно-инженерных конструкций в Институте цитологии РАН.

Проект: Разработка фреймворка для анализа одноклеточных данных Hi-C
Руководитель: Никита Ваулин
____________________________________________________________________________________________________________________

Цымбалова Евгения

ФГБНУ "ИЭМ"

Окончила Санкт-Петербургский педиатрический медицинский университет по специальность Медицинская биофизика. На данный момент учусь в аспирантуре в Институте экспериментальной медицины и работаю в лаборатории нейрофизиологии интегративных функций мозга. Область научных интересов: этиология и патогенез рассеянного склероза, метаболизм фолатов, эпигенетика.

Проект: Исследование траекторий омоложения в эмбриогенезе и клеточном репрограммировании с использованием сигнатур старения
Руководитель: Евгений Ефимов

____________________________________________________________________________________________________________________

Чичерин Иван

МГУ

Научный сотрудник кафедры молекулярной биологии биологического факультета МГУ имени М.В. Ломоносова. Обладатель ученой степени PhD университета Страсбурга по специальности "Науки о жизни". Мои научные исследования посвящены изучению факторов и механизмов биосинтеза белка в митохондриях. Кроме того, в область моих научных интересов и компетенций входит редактирование геномов по технологии CRISPR/Cas, создание генетических конструкций, получение штаммов-продуцентов белков, гетерологическая экспрессия и очистка белков.

Проект: Влияние белков группы Polycomb на экспрессию генов
Руководитель: Никита Ваулин

____________________________________________________________________________________________________________________

Чутко Алексей

СПбГУ

Студент 2-го курса магистратуры СПбГУ по программе Биоинформатика. Выполняю научную работу в ПСПбГМУ им. Павлова, посвященную виртуальному скринингу ингибиторов ферментов, участвующих в восстановлении повреждений ДНК. Интересы: белковая инженерия, онкогенетика, машинное обучение. В свободное время осваиваю электрогитару.

Проект: Решение задач классификации на эмбеддинговых представлениях геномных данных
Руководитель: Никита Сапожников
____________________________________________________________________________________________________________________

Шипунова Анастасия

СПбГУ

Выпускница бакалавриата кафедры генетики и биотехнологии биологического факультета СПбГУ. Мои научные интересы сложно свести к нескольким, основным направлением научной деятельности является изучение регуляции матричных процессов и молекулярных механизмов первичных повреждений генетического материала. Участвую в проекте, посвященном изучению регуляции активности мутаторных цитозиндезаминаз.

Проект: Геномные профили мутаций в дрожжевом штамме hst3Δ hst4Δ: роль AID/APOBEC-индуцированного мутагенеза
Руководители: Анна Жук, Елена Степченкова
____________________________________________________________________________________________________________________

Щеглова Екатерина

МФТИ

Аспирантка кафедры биофизики МФТИ. Занимаюсь изучением систем чувства кворума морских бактерий, созданием на их основе экспрессионных векторов и биосенсоров.

Проект: Идентификация транскриптомных маркеров ответа на анти-TNFα терапию при воспалительных заболеваниях кишечника
Руководитель: Мария Салютина
____________________________________________________________________________________________________________________

Юдин Данил

СПбГУ

Выпускник кафедры биохимии СПбГУ. В данный момент занимаюсь изучением влияния противоионов на биологические и физико-химические свойства антимикробных пептидов.

Проект: Исследование гистоновых хвостов в нуклеосомной частице с помощью МД-моделирования и ЯМР-спектроскопии
Руководители: Николай Скрынников, Ольга Лебеденко
____________________________________________________________________________________________________________________

Все выпускники этого направления прослушали курсы:

Теория вероятностей и биостатистика
Методология доказательной медицины
Основы регуляторики
Специфика медицинских данных
Анализ биоэквивалентности
Многофакторный анализ
Управление данными
Визуализация биомедицинских данных
Автоматизация обработки данных
Машинное обучение в медицине
Методы расчёта выборки
Практикум по индустриальной биостатистике
Специальные разделы биостатистики

Обучение в 2024-2025 годах проходило в онлайн формате.

Обязательной частью обучения было выполнение научно-исследовательского проекта.

Андрейченко Анна

ООО "К-Скай"

Руководитель направления искусственного интеллекта в медтех компании, PhD в области клинической магнитно-резонансной томографии.

Белоусов Дмитрий

Выпускник Института Фармации Первого МГМУ им. И.М. Сеченова. Мой карьерный путь начинался с работы клиническом аналитиком, в ходе которой я занимался поиском биомаркеров, анализом гайдлайнов и лейблов препаратов. В настоящее время я работаю биоинформатиком и занимаюсь анализом и интерпретацией данных NGS, bulk / single-cells RNAseq, мультиплексной иммунофлуоресценции. На досуге очень люблю читать или смотреть что-нибудь об истории средневековья и эпохи ренессанса, а еще я очень люблю учить языки.

Бердинских Евгений

НТУ «Сириус»

Выпускник Института химии СПбГУ с опытом работы в биофармацевтике. В НТУ Сириус занимаюсь обработкой масс-спектрометрических данных и статистическим анализом. Научный интерес — развитие в области прецизионной медицины. В свободное время совершенствую навыки работы с R, увлекаюсь спортом и путешествиями.

Божко Алина

НГУ

Выпускница Новосибирского государственного университета института медицины и психологии Зельмана специальности "Лечебное дело". Врач-ординатор по специальности "Эндокринология". Проект: Ремиссия сахарного диабета 2 типа у пациентов с СД2 и морбидным ожирением после бариатрических операций.

Вехова Ксения

Сеченовский Университет

Студентка 5 курса направления "Врач-исследователь", специальность "Лечебное дело" Первого МГМУ им. И.М. Сеченова. Являюсь исполнителем в исследовании по выявлению ранних предикторов сердечно-сосудистых заболеваний и ассоциированных состояний по данным 40-летнего наблюдения за лицами мужского пола (результаты проспективного и комплексного одномоментного исследований)". Научные интересы: нейробиология, неврология, клиническая фармакология.

Гаранина Ирина

МГУ

Биостатистик с бэкграундом в биоинформатике, выпускница факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ. Работаю в CRO с клиническими исследованиями в области онкологии и гематологии.

Гладышев Никита

НИИ МЧ им. А.П. Авцына

Я являюсь аспирантом первого года обучения в Научно-исследовательском институте морфологии человека по специальности «Клеточная биология». Моя исследовательская деятельность сосредоточена на изучении междифферонных взаимодействий в периферическом нерве. Кроме того, я работаю над полногеномным поиском ассоциаций у прокариот и эукариот.

Деркачев Иван

НИИ кардиологии ТНИМЦ

Специалитет СибГМУ (медицинская биофизика), аспирантура (медицинские науки - патологическая физиология). На момент обучения в Институте биоинформатики - младший научный сотрудник НИИ кардиологии ТНИМЦ. Занимаюсь изучением молекулярных механизмов кардиопротекторного эффекта адаптации к хронической гипоксии при метаболическом синдроме и без него.

Зайцев Никита

АО «БИОКАД»

Более трех лет работаю в клинических исследованиях в роли CRA (онкология, ревматология, здоровые добровольцы (I фаза). Интересуюсь обработкой и анализом данных, полученных в ходе клинических исследований, а именно биостатистикой.

Зайцева Виктория

Работаю аналитиком в области Health Technology Assessment (клинико-экономическая оценка лекарств). Училась на ФФМ МГУ и Health Policy LSE.

Зенкова Арина

ФСН

Магистр по специальности "Биотехнология" (СПХФУ). В настоящее время работаю в фарм компании и разрабатываю методики для оценки специфической активности антител с использованием клеточных тестов. В прошлом работала в области генной инженерии. Интересуюсь иммунологией, онкологией и data science.

Золотиков Устин

Первый МГМУ им. И. М. Сеченова

Студент 5 курса "Медицинской биохимии" в Сеченовском университете. Интересуюсь всем, что связано с молекулярной биологией и, особенно, генетикой. На данный момент работаю в Курчатовском Геномной центре, выполняя функциональный и таксономический анализ данных секвенирования.

Иманалиев Медер

СФУ, Charité

Выпускник Charité по магистерской программе "Molecular Medicine". Дипломная работа была посвящена выявлению сенсибилизаторов и драйверов резистентности при ингибировании KRASG12C в протоковой аденокарциноме поджелудочной железы при помощи CRISPR/Cas9 скринов и их последующего анализа через MAGeCKFlute. Обнаружил 3 потенциальных терапевтических таргета, успешно защитился в 2023 году. Интересуюсь автоматизацией процессов, биостатистикой, Machine learning, ИИ и мемами.

Исаева Анастасия

МФТИ

Аспирантка МФТИ по направлению биотехнология. Занимаюсь исследованием онколитических вирусов, работаю в области мокрой биологии и обрабатываю результаты в R. Мой научный проект: "Разработка рекомбинантного онколитического вируса миксомы для иммунотерапии солидных опухолей". Научные интересы: онкология, иммунология, биостатистика, молекулярный докинг. Хобби: вязание крючком и спицами, походы, гитара.

Касьянова Мария

МГУ

Учусь на 6 курсе факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ. Принимаю участие проекте по изучению клеточных белков, ассоциированных с начальными стадиями жизненного цикла ВИЧ-1.

Козырева Марина

Биокад

Выпускница биотехнологии СПХФУ. Сейчас работаю в Биокаде в группе технологов.

Кравец Андрей

МФТИ

Выпускник Магистратуры ПМФ МФТИ - 2023. Более 4 лет работаю биоинформатиком, являюсь менеджером R&D биоинформатической команды. Основное направление работы: анализ NGS данных солидных опухолей в контексте поиска новых биомаркеров ответа на различные терапии. Дополнительно, занимаюсь технической инфраструктурой биоинформатике: создание баз данных, написание кода обработки экспрессионных и мутационных данных.

Ласкина Наталья

Зоологический музей МГУ

Выпускница кафедры зоологии позвоночных биофака МГУ. Много лет работала в международном проекте «Мониторинг численности и изучение экологии сивуча в водах Дальнего Востока России», на о. Медный (Командорские острова). Работаю над диссертацией по теме "Стратегии материнского поведения и отношения мать-детеныш у сивуча (Eumetopias jubatus)". Опытный лектор-экскурсовод. Интересы: зоология, этология, морские млекопитающие, биоинформатика, биостатистика, молекулярная биология. Хобби: путешествия, книги, музыка.

Марочкина Елена

Я — фармацевт с высшим образованием из России. Работаю в клинических исследованиях уже 5 лет на позиции медицинского писателя. Сейчас живу и учусь в Чехии на факультете информационных технологий и мечтаю стать биостатистиком. В свободное время занимаюсь йогой и плаванием, играю на пианино и просто обожаю собак!

Намиот Евгения

Сеченовский Университет

Интересуюсь генетикой глиобластом, нейродегенеративными заболеваниями и динозаврами.

Потамошнева Анастасия

Выпускница лечебного факультета РНИМУ им. Н.И.Пирогова. В настоящий момент учусь в магистратуре Cardiovascular Science в университете Гёттингена. Область интересов: кардиология, биостатистика, клинические исследования.

Ракин Александр

ВмедА им. С.М. Кирова

Смирнов Сергей

SOLOPHARM

Выпускник кафедры биотехнологии ФПТЛ СПХФУ. В бакалавриате занимался разработкой программы для оптимизации сорбционных процессов. В магистратуре занимался получением характеристики фрагмента белка фибриллы аденовируса. На данный момент работаю биоаналитиком в клеточной лаборатории. Научные интересы: биоаналитика, клеточные тесты, квалификация и валидация in vitro анализа. Хобби: кино.

Тихоненко Антон

ОмГУ им. Достоевского

Прикладной математик в медицине. Получил математическое и медицинское образование, работал как в IT, так и в практическом здравоохранении. Сейчас совмещаю эти две сферы, изучаю биостатистику для улучшения диагностики и лечения. Планирую сосредоточиться на разработке методов анализа медицинских данных и доказательной медицины.

Уварова Виктория

ФНЦИРИП им. М.П. Чумакова РАН (Институт полиомиелита)

В 2022 году получила степень к.х.н. по специальности «Биотехнология» на химическом факультете МГУ. Работала над созданием системы доставки на основе магнитных наночастиц для повышения эффективности РНК-терапии. Сейчас я — с.н.с. в лаборатории противовирусных лекарственных средств, где занимаюсь мишень-ориентированным и фенотипическим скринингом малых молекул для поиска ингибиторов репродукции РНК-содержащих вирусов. Также разрабатываю программу экспериментов, которая поможет выявить молекулы с потенциалом для доклинических и клинических исследований. Люблю, чтоб было красиво, четко и автоматизировать процессы. Поэтому сейчас активно интересуюсь продвинутой статобработкой и визуализацией экспериментальных данных, а также микроскопией и высокопроизводительным анализом изображений.

Юрлова Елена

Биокад

Выпускница биологического факультета СПбГУ со специализацией в области биохимии и молекулярной биологии. С 2013 года работаю в компании Биокад, с 2016 года занимаюсь ранней разработкой генотерапевтических препаратов, некоторые из наших разработок в настоящий момент на стадии КИ. Профессиональная экспертиза: получение и характеризация белков и вирусных векторов, хроматография, in vivo исследования. Научные интересы: клинические исследования, анализ данных, программирование.

Все выпускники этого направления прослушали курсы:

Алгоритмы в биоинформатике
Молекулярная биология
Командная строка Linux
Введение в статистику

Обучение в 2024 году проходило в онлайн формате.

Обязательной частью обучения было выполнение научно-исследовательского проекта.

Васильева Александра

НИУ МЭИ

Окончила университет по специальности "Прикладная математика и информатика". Сейчас очень интересует биоинформатика, хотела бы развиваться в этой области. Хобби: языки, рисование.

Проект: QIIME 2 to perform an analysis of human microbiome samples from two individuals at four body sites at five timepoints
Руководитель: Геннадий Захаров
____________________________________________________________________________________________________________________

Воробьева Елизавета

ФНКЦ ФХМ, МГУ

Аспирантка 2-го года обучения Физфака МГУ, тема диссертации «ЭПР бактериальных молекулярных комплексов». Работаю в лаборатории молекулярной патофизиологии в ФНКЦ ФХМ, где занимаюсь статистическим анализом метаболомных и липидомных данных в рамках проекта по ВЗК.

Проект: Intragenic DNA inversions expand bacterial coding capacity
Руководитель: Ольга Бочкарева
____________________________________________________________________________________________________________________

Геворков Иван

ФКН ВШЭ

Fullstack разработчик, студент программы "Анализ данных в биологии и медицине" ВШЭ. Интересуюсь персонализированной медициной.

Проект: Evaluation of taxonomic classification and profiling methods for long-read shotgun metagenomic sequencing datasets
Руководитель: Михаил Райко
____________________________________________________________________________________________________________________

Громова Наталья

Самозанятый аналитик по построению эконометрических моделей. Основные задачи заключались в оценке эффективности рекламы, выборе наиболее эффективных медиаканалов и планировании бюджета, определении целевой аудитории. В настоящее время решила применять свои знания статистики для решения биологических задач. Интересы: генетика растений, молекулярная биология, селекция.

Проект: DeepSTABp: A Deep Learning Approach for the Prediction of Thermal Protein Stability
Руководитель: Александр Гавриленко
____________________________________________________________________________________________________________________

Дубова Влада

Закончила бакалавриат СПбГЭТУ «ЛЭТИ» по направлению "Информационные системы и технологии". Во время обучения в ВУЗе работала над ML проектами в лаборатории Анализа больших данных. Интересуюсь анализом данных, машинным обучением.

Проект: Inference of human population history from individual whole-genome sequences
Руководитель: Юрий Барбитов
____________________________________________________________________________________________________________________

Захарова Дарья

ИТМО

Окончила университет ИТМО (факультет безопасности информационных технологий). Сейчас интересуюсь биоинформатикой.

Проект: DeepSTABp: A Deep Learning Approach for the Prediction of Thermal Protein Stability
Руководители: Александр Гавриленко
____________________________________________________________________________________________________________________

Зеленский Дмитрий

ХГТУ

Проект: Comparison between transcriptomic responses to short-term stress exposures of a common Holarctic and endemic Lake Baikal amphipods
Руководители: Полина Дроздова
____________________________________________________________________________________________________________________

Ильиных Виктория

Умскул

Выпускница КФУ по направлению «Математика и компьютерные науки».

Проект: DeepSTABp: A Deep Learning Approach for the Prediction of Thermal Protein Stability
Руководители: Александр Гавриленко
____________________________________________________________________________________________________________________

Клименко Полина

Закончила бакалавриат по программе «Математика, алгоритмы и анализ данных» на факультете МКН СПбГУ. Сейчас я учусь в магистратуре в Израиле в Университете Райхмана на программе «Machine Learning and Data Science». Также я работаю разработчиком компьютерного зрения.

Проект: Inference of human population history from individual whole-genome sequences
Руководитель: Юрий Барбитов
____________________________________________________________________________________________________________________

Кокорин Артем

Выпускник Казанского федерального университета: бакалавриат - химия, магистратура - хемоинформатика. Сейчас учусь в аспирантуре, где занимаюсь решением задач физики/химии (в частности - ускорением расчетов молекулярной динамики) с помощью машинного обучения. Интересуюсь хемо- и биоинформатикой.

Проект: QIIME 2 to perform an analysis of human microbiome samples from two individuals at four body sites at five timepoints
Руководители: Геннадий Захаров
____________________________________________________________________________________________________________________

Куксёнок Илья

МойОфис

Выпускник ЯрГУ (2017), окончил теоретическую физику и прикладную математику, на текущий момент решил позаниматься чем-то новым и интересным для себя.

Проект: QIIME 2 to perform an analysis of human microbiome samples from two individuals at four body sites at five timepoints
Руководители: Геннадий Захаров
____________________________________________________________________________________________________________________

Лексина Екатерина

Студентка первого курса Уорикского Университета по направлению Математика. Интересуюсь молекулярной биологией, замедлением старения и предотвращением возрастных заболеваний. Люблю гулять, слушать подкасты по философии и читать.

Проект: Comparison between transcriptomic responses to short-term stress exposures of a common Holarctic and endemic Lake Baikal amphipods
Руководители: Полина Дроздова
____________________________________________________________________________________________________________________

Мартынов Александр

ООО Ред Софт

Закончил факультет информатики МГУПИ. Интересует биоинформатика, метагеномика, анализ NGS данных.

Проект: Inference of human population history from individual whole-genome sequences
Руководитель: Юрий Барбитов
____________________________________________________________________________________________________________________

Милосердова Любовь

СПбГУ

Выпускница математико-механического факультета СПбГУ по программе "Программная инженерия".

Проект: Inference of human population history from individual whole-genome sequences
Руководитель: Юрий Барбитов
____________________________________________________________________________________________________________________

Михайловская Наталья

НИУ ВШЭ

Учусь в НИУ ВШЭ по направлению прикладная математика и информатика, интересуюсь биоинформатикой и вычислительной биологией, приложением ML в естественных науках. Люблю скалолазание, джемить и заваривать чай.

Проект: Intragenic DNA inversions expand bacterial coding capacity
Руководители: Ольга Бочкарева
____________________________________________________________________________________________________________________

Мурашкина Наталья

НИУ ВШЭ

CS @ Питерская Вышка '21, живу в Лондоне. Нежно люблю препать прогу и математику младшим курсам и школьникам. Делаю апку для изучения корейского алфавита. Люблю научпоп, C++, хайкинг. Всегда рада знакомиться и коллаборироваться! Со всеми, и особенно с биологами ;)

Проект: Evaluation of taxonomic classification and profiling methods for long-read shotgun metagenomic sequencing datasets
Руководитель: Михаил Райко
____________________________________________________________________________________________________________________

Нурсафин Салават

Самарский университет

Студент 4-го курса Самарского университета. Провожу научное исследование в сфере распределенных вычислительных систем. Разрабатываю фулстек приложения, а также интересуюсь робототехникой.

Проект: HIFIBLENDER for genome assembly
Руководители: Даниил Зилов
____________________________________________________________________________________________________________________

Паксеваткин Алексей

ООО «Озон Технологии»

Закончил МГТУ на программиста, работаю в Озоне :)

Проект: Comparison between transcriptomic responses to short-term stress exposures of a common Holarctic and endemic Lake Baikal amphipods
Руководители: Полина Дроздова
____________________________________________________________________________________________________________________

Шараева Кристина

Quantori / Университет ИТМО

Дата инженер в компании Quantori. В рамках работы создаю для фарм компаний DWH, ETL-пайплайны для его заполнения и Django приложения для работы с данными в AWS инфраструктуре. Окончила бакалавриат ИТМО по направлению "Программирование и Интернет-Технологии" и Магистратуру по направлению "Нейротехнологии и Программная Инженерия". Занимаюсь преподаванием Python, Linux, Airflow для детей и студентов, участник Менторской программы Университета ИТМО и программы Astronomer Champion Programs For Apache Airflow. В свободное время занимаюсь резьбой по дереву, читаю книги, учу немецкий и японский, играю в волейбол и провожу время со своей прекрасной кошкой Ежевикой.

Проект: HIFIBLENDER for genome assembly
Руководители: Даниил Зилов
____________________________________________________________________________________________________________________

Выпускники

Команда Института биоинформатики

CONTACTS

Контакты

Санкт-Петербург
ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс», 4 этаж, офис 420

По всем вопросам:
info@bioinf.me

Об институте

направления

Мы в сети