Выпускники

2019/20 год обучения
Биоинформатика для биологов
Все выпускники этого направления прослушали курсы:
- Дискретная математика
- Программирование на Python
- Программирование на R
- Статистика
- Семинар по биоинформатике
- Практикум по биоинформатике
- Молекулярная филогенетика
- Анализ данных NGS
- Введение в машинное обучение

Обязательной частью обучения было выполнение научно-исследовательских проектов в каждом семестре. Летняя стажировка проводилась по желанию.

Алексеев Дмитрий
СПбГУ, кафедра цитологии и гистологии
Выполняет работу в лаборатории защитных механизмов клетки Института цитологии. Исследование посвящено дифференциальной экспрессии маркеров ЕМТ при метастазировании раковых клеток. Научные интересы: молекулярная биология, цитология, сравнительные транскриптомные исследования.

Гурина Алёна
ВИР, отдел генетических ресурсов картофеля
Работаю в ВИРе, курирую коллекцию примитивных культурных видов картофеля, в аспирантуре планирую заниматься их систематикой. Научные интересы: ботаника, генетика растений, геоботаника, статистика. Другие интересы: математика, программирование, вязание.

Догонашева Олеся
СПбАУ РАН
Текущее место работы: Ecole Normale Superior

Научный сотрудник лаборатории нанобиотехнологий. Основные направления исследований: хемоинформатика, разработка подходов автоматизированного поиска путей химических реакций, математическое моделирование биологических систем, применение методов машинного обучения к параметрам молекулярной динамики.

Долгих Александра
СПбГУ, кафедра Генетики и Биотехнологии
Участвую в проекте, целью которого является изучение молекулярных аспектов развития бобово-ризобиального симбиоза, в том числе элементов фитогормональной регуляции. Научные интересы: молекулярная биология, физиология растений, регуляция экспрессии генов, белок-белковые взаимодействия.

Киркилевич Анна
СПбГУ, кафедра зоологии беспозвоночных
Научные интересы: системная биология, анализ данных, машинное обучение. В свободное время слушаю курсы на Stepic и Coursera.

Мамаева Мария
СПХФУ
Текущее место работы: Fortrea

В настоящее время работаю над выпускной квалификационной работой на кафедре Технологии лекарственных форм СПХФУ. Работа посвящена разработке составов филаментов, получаемых методом экструзии горячего расплава, для 3D-печати лекарственных форм. Сфера научных интересов: персонализированная медицина, drug design.

Масликова Татьяна
СПбГУ/ ВНИИСХМ
Выпускница биологического факультета СПбГУ. Научная работа посвящена растительно-микробным взаимодействиям, в частности определению генетических детерминант специфичности симбиотических взаимодействий некоторых линий гороха посевного (Pisum sativum L.) с совместимыми штаммами Rhizobium leguminosarum. В сферу научных интересов входит молекулярная биология, микробиология, медицина, биотехнология, биоинформатика, data science. Увлечения: классическая музыка, програмирование, видеоигры.

Меженская Дарья
Институт Экспериментальной Медицины
Младший научный сотрудник лаборатории иммунологии и профилактики вирусных инфекций (ФГБНУ «ИЭМ»). Выполняет исследовательскую работу, посвященную созданию универсальной гриппозной вакцины на основе консервативных участков генома вируса гриппа. Основное образование: Санкт-Петербургский Государственный Политехнический университет Петра Великого (Кафедра Биофизики). Научные интересы: молекулярная биология, эволюционная биология.

Мураева Ольга
СПбГУ, кафедра зоологии беспозвоночных
Текущее место работы: EPAM Systems

Выпускница кафедры Зоологии Беспозвоночных СПбГУ. В магистратуре занималась протеомным анализом адаптации моллюсков к осмотическому стрессу.

Озерова Юлия
Parseq Lab
Текущее место работы: Leipzig University

Выпускница факультета химической и биотехнологии СПбГТИ (ТУ), кафедры молекулярной биотехнологии. На данный момент являюсь специалистом в области разработки наборов для лабораторной диагностики (в основном, методами qPCR и LAMP). Научные интересы: биотехнология, моделирование биологический процессов in silico, нейродегенерация, эпигенетика. Увлекаюсь музыкой и котиками.

Окорокова Лариса
СПбГУ, кафедра общей физиологии
Текущее место работы: University Cote d'Azur

Работаю на кафедре Общей физиологии СПбГУ и занимаюсь изучением клаудинов - белков плотных контактов, которые определяют барьерные свойства эпителиальных тканей. Научные интересы - молекулярная биология и внутриклеточная сигнализация. В свободное время стараюсь интересно рассказывать о биологии и науке детям и путешествовать.

Петросян Степан
СПХФУ
Текущее место работы: Semrush

Студент 4 курса СПХФУ, факультет промышленной технологии лекарств. Имею опыт сотрудничества с контрактной исследовательской организацией, занимающейся сопровождением клинических исследований, в качестве ассистента отдела управления данными. В задачи входил контроль качества полученных данных, их статистическая обработка.

Поденкова Ульяна
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Выпускница кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ. Научные интересы: молекулярная биология, психогенетика, генетика старения, биология стволовых клеток, канцерогенез, эпигенетика. Увлечения: иностранные языки (французский, английский), фестивальное кино.

Поздняков Данила
СПбГУ, кафедра биохимии
В текущем научном проекте мы исследуем роль транскрипционного фактора Zeb1 в развитии рака молочной железы. Научные интересы: молекулярная биология, поиск молекулярных мишеней для терапии онкологических заболеваний.

Потапенко Евгений
СПбПУ, кафедра генетики и биотехнологии
Текущее место работы: Haifa University

Студент-магистр СПБГУ кафедры генетики, работаю в лаборатории молекулярной биологии стволовых клеток Института Цитологии РАН. Тема моей научной исследовательской работы: "Исследование роли поли(Ц)-связывающих белков в регуляции транскрипции гена Oct4." Научные интересы: регуляция транскрипции, эпигенетика, генная инженерия, биотехнология. Хобби: жонглирование, катание на моноцикле, роликах, велосипеде.

Сказина Мария
СПбГУ, кафедра прикладной экологии
Научный сотрудник кафедры Прикладной экологии. Научные интересы: гибридизация и интрогрессия у морских беспозвоночных, нарушение наследования митохондриальной ДНК у мидий, инфекционная неоплазия двустворчатых моллюсков.

Толмачев Михаил
НМИЦ ПН им. В.М. Бехтерева
Текущее место работы: EPAM Systems

Выпускник медико-биологического факультета по направлению подготовки медицинская биохимия. Выполнил дипломный проект посвященный созданию персонифицированной фармакогенетической панели подбора антипсихотической терапии. В данный момент выполняю кандидатскую работу по этой теме, работаю над трансляцией современных биологических знаний в клиническую практику в отделении молекулярно-генетической диагностики.

Ушаков Михаил
СПбГТИ(ТУ), кафедра молекулярной биотехнологии
Текущее место работы: Сербалаб

Заканчиваю бакалавриат СПбГТИ. Дипломную работу, посвященную генетическому маркированию гриба-продуцента, выполняю в ВИЗР. Научные интересы: молекулярная биология, генная инженерия, эволюционная биология. Интересы: программирование, комп. игры, музыка и понемногу всего остального.

Царев Александр
СПбГУ, кафедра биохимии
Текущее место работы: Vienna BioCenter

Выпускник кафедры Биохимии СПбГУ . Научная работа посвящена вычислительной химии реакций гликирования белков и структурной биоинформатике. Также занимаюсь процессингом протеомных и метаболомных данных растений. Научный интересы: посттрансляционные модификации, взимодействия белок-лиганд, молекулярная динамика, системная биология. Увлечения: французкий и немецкие языки, программирование.

Цыба Дарья
ПСПбГМУ им. И.П. Павлова
Текущее место работы: Герофарм

Студентка 4-го курса ПСПбГМУ им. И.П. Павлова, научная работа посвящена оценке эффективности инфузий донорских лимфоцитов в терапии миело- и лимфопролиферативных заболеваний. Научные интересы: онкогематология, патологическая анатомия, молекулярная биология, эпигенетика. В свободное время занимаюсь спортом, преподаю биологию школьникам и учу немецкий язык.

Яковлева Юлия
СПбГУ, кафедра цитологии и гистологии
Текущее место работы: EPAM Systems

Студентка биологического факультета СПбГУ. Бакалаврская работа связана с описанием нового вида микроспоридии из инфузории Paramecium primaurelia. В магистратуре ведется работа с геномными данными этой паразито-хозяинной системы. Научные интересы: паразитология, протистология, геномы паразитических организмов, сравнительная геномика.
Алгоритмическая биоинформатика
Все выпускники этого направления прослушали курсы:
- Алгоритмы в биоинформатике
- Молекулярная биология
- Статистика
- Семинар по биоинформатике
- Практикум по биоинформатике
- Молекулярная эволюция и филогенетика
- Анализ данных NGS

Обязательной частью обучения было выполнение научно-исследовательских проектов в каждом семестре. Летняя стажировка проводилась по желанию.

Веселова Влада
СПбГУ
Студентка математико-механического факультета СПбГУ. Научные интересы: теория вероятностей, data science, применение алгоритмов машинного обучения в области биоинфорфматики. Также интересуюсь физиологией и зоологией, в частности герпетологией, в свободное время слушаю курсы на Stepik и програмирую на Python.

Жукова Наталия
СПбГУ, кафедра исследования операций
Текущее место работы: Фоксфорд


Студент 2 курса математико-механического факультета СПбГУ. Занималась изучением языков C, Java, Python, PHP, Javascript, MySQL. Интересовалась криптографией и применением марковских цепей к финансовым задачам. На данный момент интересует разработка, реализация и оптимизация различных алгоритмов.

Забелкин Алексей
Университет ИТМО, кафедра компьютерных технологий
Текущее место работы: Oxford Nanopore

Работаю в лаборатории "Компьютерные технологии" при Университете ИТМО и обучаюсь в магистратуре. Занимаюсь анализом геномных перестроек, произошедших в ходе эволюции, с использованием случайных графов и реальных данных об устройстве ДНК.

Калтович Артём
БГУИР, кафедра программного обеспечения информационных технологий
Выпускник Белорусского Государственного Университета Информатики и Радиоэлектроники.

Кутленков Дмитрий
СПбГУ, кафедра системного программирования
Студент 3 курса СПбГУ по направлению "Программная инженерия", выпускник Санкт-Петербургской классической гимназии №610. Научные интересы: Data Science, машинное обучение. Люблю расширять свой кругозор и иметь мнение на любой счет. Среди увлечений прохождение курсов на Stepik, книги и манга.

Панков Викентий
СПбГУ, кафедра системного программирования
Магистр математико-механического факультета СПбГУ, программист C#. Текущий научный проект: реконструкция изображения в УЗИ-томографии с множеством датчиков. Научные интересы: биоинформатика, применение IT в медицине. В свободное время увлекаюсь игрой на пианино, классической музыкой.

Сметанин Александр
Университет ИТМО, кафедра высшей математики
Текущее место работы: Grid Dynamics

Студент 1 курса магистратуры университета ИТМО. Интересуюсь анализом данных, теорией вероятности и теорией чисел. Работаю Python разработчиком в Epam.

Харламов Владислав
СПбГУ, кафедра статистического моделирования
Текущее место работы: ВКонтакте

Студент 2 курса математика-механического факультета СПбГУ по направлению прикладной математики и информатики. Занимался обработкой естественного языка на R в качестве курсовой работы в университете, а именно классификацией авторов XVII-XIX веков. Научные интересы: Статистические методы прогнозирования, машинное обучение в области биоинформатики и обработки естественного языка, теория вероятностей, теории оптимизации .

Чангалиди Антон
Университет ИТМО, кафедра вычислительной техники
Текущее место работы: Институт биоинформатики

Студент второго курса бакалавриата ИТМО по направлению программная инженерия. Научные интересы: молекулярная биология, когнитивные науки, computer science. Пишу на Java, Python. Изучаю китайский язык, обожаю баскетбол и плавание. Github: https://github.com/TohaRhymes
Биоинформатика для биологов

Алексеева Лолита
МГУ, кафедра биологии почв
Текущее место работы: BostonGene

Студентка 2-го курса магистратуры биологического факультета МГУ. Выполняет научную работу в лаборатории молекулярной диагностики ФИЦ Биотехнологии, где изучает магнитотактические бактерии.
Научные интересы: эволюционная генетика, биоинформатика и нейрофизиология.

Биба Дмитрий
МГУ, кафедра эволюции
Студент 4-го курса бакалавриата биологического факультета МГУ. Выполняет дипломную работу в лаборатории эволюционной геномики, посвященную поиску сдвигов рамок считывания в белок-кодирующих генах.
Интересы: эволюционная биология, теория игр, популяционная генетика и геномика, математика, программирование.

Волкова Мария
ПМГМУ им. И. М.Сеченова, кафедра биотехнологий
Студентка 4-го курса специалитета «Биоинженерия и Биоинформатика» Сеченовского Университета. Интересуется программированием и возможностями применения математических моделей для решения задач связанных с эволюцией.
Интересы: путешествия, игра на музыкальных инструментах и фотография.

Глушкевич Анна
МГУ, кафедра физиологии растений
Студентка 1-го курса магистратуры МГУ. Закончила кафедру геоботаники и экологии растений СПбГУ. Научная работа была посвящена географической и экологической изменчивости метаболома печеночников.
Научные интересы: метаболомика, симбиотические взаимодействия, экологическая физиология.

Гончар Анастасия
МГУ, кафедра биохимии
Студентка 1-го курса магистратуры биологического факультета МГУ. Научные интересы: молекулярная биология, биохимия и генетика. Другие интересы: изучение иностранных языков, поэзия.

Карпова Наталия
НИИОПП
Закончила биотехнологический факультет МГУ по направлению «Молекулярная Биотехнология». Работает младшим научным сотрудником в лаборатории регуляции репаративных процессов.
Научные интересы: эпигенетика, диагностика полигенных заболеваний, психопатологии, исследование митохондрий.

Куреев Николай
РГАУ-МСХА им. К. А. Тимирязева, кафедра биотехнологий
Текущее место работы: TU Dresden

Студент 4-го курса бакалавриата РГАУ-МСХА им. К. А. Тимирязева. Занимается созданием тест-системы на основе ПЦР для выявления заболеваний тейлериозом. Научные интересы: биотехнология, биоинформатика, молекулярная биология, data science. Увлекается астрономией, историей и иностранными языками.

Лобода Анна
МФТИ, кафедра молекулярной и клеточной биологии
Аспирантка 1-го года обучения ФБМФ МФТИ. Выпускница химического факультета МГУ. Научная работа посвящена ингибированию p53-cигналинга в клетках для увеличения эффективности редактирования генома с помощью CRISPR Cas9. В свободное время занимается спортом и поингом, любит путешествовать.

Мазур Ольга
СПбГУ / BostonGene
Текущее место работы: EPAM Systems

Аспирантка 1-го года обучения в СПбГУ по направлению «Клеточная и молекулярная биология», выпускница Южно-Уральского государственного медицинского университета по направлению «лечебное дело». В настоящее время работает младшим аналитиком клинических исследований в BostonGene.

Охтиенко Анастасия
МГУ, кафедра молекулярной биологии
Текущее место работы: The Technical University of Munich

Студентка 3-го курса бакалавриата МГУ. Работает в Лаборатории клеточной микробиологии НИИ им. Н. Гамалеи, основная тема исследований — сепсис различной этиологии.
Научные интересы: молекулярная биология, вирусология, иммунология, генетика.

Рапота Диана
МГУ, кафедра биохимии
Студентка 3-го курса бакалавриата МГУ. Интересуется биотехнологией, генной инженерией и возможностью их применения в медицине. Кроме этого, изучает программирование на С++ и осваивает игру на укулеле.

Сарана Юлия
Сколтех, центр «Науки о жизни».
Аспирантка 1-го года в центре «Науки о жизни» Сколтеха. Выполняет проект, посвященный сравнительному анализу микробиомов тлей. Научные интересы: системная биология, анализ микробиомов, биомедицина.

Селезнева Елизавета
МГУ, кафедра биохимии
Студентка 1-го курс магистратуры биологического факультета МГУ. Текущий проект посвящен исследованию натрийуретических пептидов как маркеров ранней диагностики и эндопептидазы неприлизина как терапевтической мишени сердечной недостаточности.
Научные интересы: внутриклеточная сигнализация, иммунология, нейродегенеративные заболевания

Уразбахтин Шамиль
МГУ, кафедра вирусологии
Текущее место работы: Max-Planck-Institut für Biochemie

Студент 2-го курса магистратуры МГУ. Научная деятельность посвящена поиску соматических и de novo инсерций ретроэлементов в человеческом геноме.
Научные интересы: молекулярная биология, вирусология, эволюционная биология. Увлечения: прогрессивный рок, научная фантастика, настольные игры.

Яковлева Екатерина
МГУ, кафедра биологической эволюции
Выпускница магистратуры биологического факультета МГУ. Изучает эволюцию параметров жизненного цикла дрозофил в ходе адаптации к неблагоприятным условиям среды. Научные интересы: эволюционная биология, геронтология, математическое моделирование.

Янушкевич Сергей
МГУ, кафедра биохимии
Студент 3-го курса бакалавриата биофака МГУ. Научные интересы: молекулярная генетика, биология развития, иммунология. Обучался год в Польше на факультете биотехнологии Вроцлавского Университета, где изучал механизмы регуляции транспорта белков в хлоропласты у Arabidopsis thaliana.
Алгоритмическая биоинформатика

Глубоков Дмитрий
МИРЭА, кафедра информационных технологий в управлении
Студент 4-го курса МИРЭА. Интересуется использованием биоинформатики и вычислительной биологии в исследованиях старения. Изучает биомаркеры старения (метилирование ДНК, укорочение теломер и т.д.) с использованием глубинного обучения.

Ковалев Александр
МГУ, кафедра математического моделирования и информатики
Студент 4-го курса физического факультета МГУ. Занимается анализом мозговых сигналов (EEG, ECoG) с использованием методов машинного обучения. Работа ведется совместно с центром биоэлектрических интерфейсов в ВШЭ.

Кравец Андрей
МФТИ, факультет молекулярной и химической физики
Студент 4-го курса факультета молекулярной и химической физики МФТИ. Научные интересы: анализ данных, машинное обучение и их применение в биологии.

Машкова Ольга
МГУ, кафедра теории функций и функционального анализа
Текущее место работы: King Abdullah University of Science and Technology (KAUST)

Студентка 3-го курса механико-математического факультета МГУ. Программирует на C, C++, Python3.
Научные интересы: молекулярная биология, машинное обучение, data science. Изучает немецкий язык. В свободное время читает и слушает классическую музыку.

Недильченко Ольга
МГТУ, Яндекс
Окончила кафедру «Компьютерные системы и сети» в МГТУ. Интересуется Data Science, программирует на Python и C++. Сейчас занимает должность аналитика-разработчика в Yandex. Верит, что за биотехнологиями будущее.

Овсянникова Александра
МИФИ, кафедра финансового мониторинга
Студентка 6-го курса Института интеллектуальных кибернетических систем МИФИ. Программист-исследователь в Mail.ru, занимается машинным обучением, пишет код на Python. В ВУЗе разрабатывает модели для выявления мошенничества в финансовой сфере. Интересуется биоинформатикой, финансами и статистикой.

Пахалко Илья
ВШЭ, факультет компьютерных наук
Студент 2-го курса факультета компьютерных наук ВШЭ, ОП «Прикладная математика и информатика».

Попова Аделия
МГУ, кафедра математического анализа
Студентка 5-го курса механико-математического факультета МГУ. Научная работа посвящена статистическому анализу геномных последовательностей. В свободное время преподает математику школьникам, смотрит научно-популярные видео, занимается фортепиано и путешествует.

Синяков Артем
МГТУ, кафедра информатики и управления
Выпускник МГТУ по специальности «Компьютерная безопасность». Математик, программист, гейм-дизайнер, полимат.

Файзуллина Камилла
ВШЭ, факультет МИЭМ
Студентка 4-го курса факультета МИЭМ ВШЭ, направление — «Прикладная математика». Научные интересы: математическое моделирование в науках о жизни, анализ данных.

Хамитов Денис
МГУ, кафедра биофизики
Студент 4-го курса физического факультета МГУ. Интересуется иммунологией, выполняет работу по моделированию процессов клеточной сигнализации. Ранее занимался фармакоцитами в биофизической лаборатории ДГОИ им. Д. Рогачёва.