Текущее место работы: NIH

Выпускник магистратуры СПбАУ по направлению "Алгоритмическая биоинформатика" и Института биоинформатики 2014 года. Степень бакалавра получил в ИТМО по специальности "Прикладная математика и информатика" (кафедра Высшей Математики). Участник проектов "Sibelia" и "Ragout", занимался разработкой метода финиширования геномов с использованием нескольких референсов. В данный момент продолжает обучение биоинформатике в аспирантуре Калифорнийского Университета Сан Диего (UCSD) под руководством Павла Певзнера. Интересы - сравнительная геномика, сборка генома, протеомика.

Проект осеннего семестра:
Sibelia
Руководитель - Илья Минкин (PSU)

Проект весеннего семестра:
Data processing after immunoglobuline libraries sequencing
Руководитель - Александр Карабельский (BIOCAD)

Летняя стажировка:
Reference-assisted assembly using colored breakpoint graphs
Руководитель - Son Pham (SALK)

Учится на первом курсе магистратуры СПбАУ по направлению "Биоинформатика". Текущий проект -- "Мать-плод" в компании iBinom. Закончила НИУ ИТМО в 2013 году по специальности "математика и прикладная информатика". Защитила бакалаврскую работу по теме "Метод нахождения настоящих экземпляров дуплицированных генов для близкородственных геномов".

Проект осеннего семестра:
Multiple libraries pathsets
Руководитель - Son Pham (SALK)

Проект весеннего семестра:
Метод нахождения настоящих экземпляров дуплицированных генов для близкородственных геномов
Руководители - Son Pham (SALK), Николай Вяххи (Stepic)

Летняя стажировка:
The "Mother-Fetus" Project
Руководитель - Антон Афанасьев (iBinom)

Студент первого курса СПбАУ РАН по направлению "Алгоритмическая биоинформатика". Окончила СПбНИУ ИТМО по направлению "Информатика и вычислительная техника". Ранее работала программистом в компании, занимающейся трейдинговыми системами. Участвовала в проектах, связанных с обработкой и хранением данных секвенирования и проекте CSibelia. На данный момент к области научных интересов относятся анализ данных секвенирования и сравнительная геномика.

Проект осеннего семестра:
Biolinux
Руководитель - Суворов Владимир (EMC)

Проект весеннего семестра:
Biological context in C-Sibelia
Руководители - Son Pham (SALK), Николай Вяххи (Stepic)

Закончил СПбГПУ, получил степень кандидата технических наук в СПбГЭТУ «ЛЭТИ». На данный момент работает разработчиком в компании "Яндекс". Проходил стажировки в биоинформатических компаниях Sequoia Genetics и BIOCAD. На данный момент в рамках стажировки в BIOCAD работает над проектом "Создание современного эффективного программного комплекса для гуманизации последовательностей антител".

Проект осеннего семестра:
Данные секвенирования IonTorrent
Руководитель - Брагин Антон (JetBrains Inc.)

Проект весеннего семестра:
QC pipeline
Руководитель - Антон Коробейников (ЦАБ СПбГУ)

Летняя стажировка:
Нахождение регионов в вариабельных доменах иммуноглобулинов
Руководитель - Александр Карабельский (BIOCAD)

Проект осеннего семестра:
Нахождение регионов в вариабельных доменах иммуноглобулинов
Руководитель - Александр Карабельский (BIOCAD)

Текущее место работы: BIOCAD

Закончил Физико-Математический Лицей №30 в 2008 году. Поступил в СПбГПУ на факультет технической кибернетики. С 2012 года учится в магистратуре СПбАУ РАН по направлению "Биоинформатика". С октября 2012 года сотрудничает с компанией Биокад, с сентября 2013 возглавляет в ней группу биоинформатики. Решает задачи аннотирования белков функциональными характеристиками, а также математической обработки результатов экспериментов. Научные интересы: иммунология, протеомика, алгоритмы.

Проект осеннего семестра:
Immunoglobulin humanization
Руководитель - Александр Карабельский (BIOCAD)

Проект весеннего семестра:
RNA-seq: analysis and de novo assembly
Руководитель - Сергей Нурк (ЦАБ СПбГУ)

Летняя стажировка:
Система автоматической обработки иммуноглобулинов
Руководитель - Александр Карабельский (BIOCAD)

Проект осеннего семестра:
Система нахождения регионов на IG V-chains
Руководитель - Александр Карабельский (BIOCAD)