Интенсив по анализу данных NGS:
введение в медицинскую и статистическую генетику

апрель 2020
Интенсив по анализу данных NGS для исследователей биологических направлений позволяет в сжатые сроки получить максимум практических навыков по работе с геномными и транскриптомными данными.

В связи со сложившийся ситуацией интенсив был перенесен на весну 2020 года.
Программа
1
Пайплайны и форматы
Форматы данных и их отличия на разных этапах анализа
2
Оценка качества ридов и выравнивания
Какие программы использовать и на какие метрики следует обратить внимание
3
Выравнивание коротких фрагментов и SNP-calling
Как найти однонуклеотидные замены в коротких ридах
4
Дифференциальная экспрессия генов
Сравнение результатов RNA-seq между образцами
5
Визуализация данных
Как правильно нарисовать красивые картинки из имеющихся у вас данных или посмотреть на геномное выравнивание
6
Обзор других развивающихся областей биоинформатики
Метагеномные исследования, технологии секвенирования одиночных клеток
Для кого
Для всех, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.

В первую очередь приглашаются исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, поиска вариаций и GWAS.

Ожидания от участников

  • Интерес к биоинформатике и анализу данных
  • Знания в молекулярной биологии
  • Наличие ноутбука для работы на практических занятиях
  • Возможность подключиться для удаленной работы
  • Умение работать в командной строке Linux или желание быстро её освоить на вводном онлайн-курсе
        Формат
        Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке. Занятия проходят в бизнес-центре «Таймс» с 10:00 до 18:00. По вечерам — полезный нетворкинг.

        Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть: 2019, 2018, 2016
              Условия участия
              За четыре дня сложно рассказать все детали анализа данных, но программа интенсива разработана с целью дать максимум полезных навыков за этот срок.

              При записи на мероприятие необходимо пройти вводный онлайн-курс. Это позволит разобраться в программном обеспечении, используемом на занятиях, и сэкономит время на решении технических проблем.

              Как принять участие:

              1. Заполнить заявку.
              2. Пройти вводный онлайн-курс.
                • Ссылка на курс придёт в ответ на заполненную заявку. Пожалуйста, внимательно вносите и проверяйте адрес вашей электронной почты.
              3. Оплатить взнос в течение 5 дней с момента получения реквизитов.
                • Ссылка на детали оплаты придёт на почту в течение двух дней после завершения онлайн-курса. Если вы её не получили, проверьте папку «Спам».

              Запись на интенсив закрывается по мере заполнения группы.

                    Организационные взносы
                    • Физическим лицам — 13 000 (при оплате до 15 февраля — 10 000), сотрудники государственных и коммерческих учреждений по договору оферты
                    • Юридическим лицам — 18 000 (при заключении договора с организацией)

                    Взносы принимаются в рублях и покрывают участие и материалы.

                    Количество мест ограничено.

                    Договор оферты для физических лиц
                      Часто задаваемые вопросы
                      На какой уровень рассчитана программа интенсива?
                      Программа рассчитана на начинающих биоинформатиков. Однако мы ожидаем от участников владение командной строкой и базовым синтаксисом языка R на уровне обязательного к прохождению онлайн-курса.
                      Я набрал необходимое количество баллов в онлайн-курсе, что делать дальше?
                      Для тех, кто наберет необходимое количество баллов, в курсе станет доступен дополнительный модуль с инструкциями по заполнению анкеты и оплате.

                      Если модуль недоступен, значит на ближайшем интенсиве закончились места. Однако набранные баллы перезачтутся для будущих интенсивов.
                      Я прошел курс, но подача анкет уже закончилась, когда я смогу записаться на следующий интенсив?
                      Интенсив проводится ежегодно один или два раза в год. Советуем подписаться на новости Института и следить за анонсами.
                      Для участия необходим ноутбук, какое ПО требуется установить?
                      Если вы планируете участие в семинаре, то рекомендуем вам выполнять здания онлайн-курса на том же ноутбуке, который вы планируете использовать на семинаре, чтобы устанавливать необходимое ПО один раз в процессе решения задач. Накануне семинара организаторы вышлют подробные инструкции по установке дополнительных программ.
                      Партнеры
                      Контакты
                      Санкт-Петербург
                      ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»
                      Ближайшее метро: Лесная

                      По всем вопросам:
                      info@bioinf.me
                      Подписаться на новости Института биоинформатики

                      Интенсив по анализу данных NGS 2021