Семинар по системной биологии 2020
18–23 мая | Санкт-Петербург

Институт биоинформатики, Университет ИТМО и Университет Вашингтона в Сент-Луисе с 18 по 23 мая 2020 года проведут седьмой семинар по системной биологии в пригороде Санкт-Петербурга.

Программа семинара подготовлена для сотрудников академических заведений и коммерческих компаний, которые хотят разобраться в подходах, используемых в математической и системной биологии, а также научиться применять их в своей работе.
Ключевые даты

11 февраля

Скидка 10% за раннюю подачу заявки.
1 марта

Окончание приёма заявок.
11 марта

Объявление результатов.
Программа семинара фокусируется на переходе от биоинформатики к экспериментальной биологии. В лекция внимание уделяется биологическим основах омиксных данных и соответствующих экспериментальных подходах для сбора данных и проверки гипотез.

Кроме того, будут рассматриваться подходы к анализу полногеномных данных от экспрессии генов, РНК-, ChIP-, и экзомного секвенирования до высокоэффективной метаболомики и интеграции данных при помощи сетевых методов.

Для участия требуется базовое знание молекулярной биологии и навыки работы в командной строке Linux. Тем, кто не уверен в своих знаниях, настоятельно рекомендуется пройти бесплатный онлайн-курс Института биоинформатики «Введение в Linux». Отбор на семинар проходит на конкурсной основе по анкетам.

Семинар проводится с 2014 года.
Формат
Пять дней интенсивных занятий с перерывами на еду и прогулки в загородном пансионате в пригороде Санкт-Петербурга. Теоретические занятия сопровождаются практиками, на которых участники в парах выполняют простые вычисления и обсуждают биологические выводы.

В программе также предусмотрены вечерние неформальные лекции и нетворкинг.
Рабочие языки русский и английский.

Фотографии прошлых лет: 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019.
        Программа
        • Медицинская и популяционная генетика.
          Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) и экзомное секвенирование: от основ к фенотипу (BWA, PLINK, GATK, ExAC и gnomAD).
        • РНК-секвенирование.
          От основ подготовки библиотек к анализу экспрессии генов. Поиск новых биологических фенотипов по данным экспрессии генов.
        • РНК-секвенирование одиночных клеток.
          Экспериментальный дизайн, анализ данных и их интерпретация (с фокусом на данные 10X Genomics). Разбор примеров из последних публикаций.
        • Эпигенетическая регуляция и работа с данными ChIP-seq.
          Понимание данных и использование открытых ресурсов: Roadmap Epigenomics Project, Blueprint Epigenome, ENCODE.
        • Основы метаболомики.
          Введение в метаболомику, интеграция данных с помощью сетевых методов. Разбор примеров из области иммунометаболизма.
              Спикеры
              Максим Артемов (PhD)
              Алексей Сергушичев, к.т.н.
              Константин Зайцев
              Организационные взносы
              Размеры организационных взносов в 2020 году

              Физическим лицам — 35 000 рублей (сотрудники государственных и коммерческих учреждений по договору оферты).
              Юридическим лицам — 50 000 рублей (при заключении договора с организацией).

              Взнос покрывает проживание, трёхразовое питание, кофе-брейки, трансфер от Санкт-Петербурга до места проведения семинара, участие и сопутствующие материалы.

              Скидки

              За регистрацию до 11 февраля предоставляется скидка 10% при успешном прохождении конкурсного отбора. Лучшим академическим заявкам могут быть предоставлены гранты от организаторов. Для студентов бакалавриата и магистратуры очной формы обучения скидка 15%. Для студентов и выпускников Института биоинформатики скидка 20%. Скидки не суммируются и предоставляются только для физических лиц.

              Договор оферты.
                Мы с радостью ответим на возникшие вопросы info@bioinf.me.
                Организаторы
                Партнеры
                Подписаться на новости Института биоинформатики