Семинар по системной биологии 2020
18–23 мая | Санкт-Петербург
Программа семинара подготовлена для сотрудников академических заведений и коммерческих компаний, которые хотят разобраться в подходах, используемых в математической и системной биологии, а также научиться применять их в своей работе.
В 2020 году семинар был перенесен на 2021 год
В 2020 году семинар был перенесен на 2021 год
Программа семинара фокусируется на переходе от биоинформатики к экспериментальной биологии. В лекция внимание уделяется биологическим основах омиксных данных и соответствующих экспериментальных подходах для сбора данных и проверки гипотез.
Кроме того, будут рассматриваться подходы к анализу полногеномных данных от экспрессии генов, РНК-, ChIP-, и экзомного секвенирования до высокоэффективной метаболомики и интеграции данных при помощи сетевых методов.
Для участия требуется базовое знание молекулярной биологии и навыки работы в командной строке Linux. Тем, кто не уверен в своих знаниях, настоятельно рекомендуется пройти бесплатный онлайн-курс Института биоинформатики «Введение в Linux». Отбор на семинар проходит на конкурсной основе по анкетам.
Семинар проводится с 2014 года.
Кроме того, будут рассматриваться подходы к анализу полногеномных данных от экспрессии генов, РНК-, ChIP-, и экзомного секвенирования до высокоэффективной метаболомики и интеграции данных при помощи сетевых методов.
Для участия требуется базовое знание молекулярной биологии и навыки работы в командной строке Linux. Тем, кто не уверен в своих знаниях, настоятельно рекомендуется пройти бесплатный онлайн-курс Института биоинформатики «Введение в Linux». Отбор на семинар проходит на конкурсной основе по анкетам.
Семинар проводится с 2014 года.
Формат
Пять дней интенсивных занятий с перерывами на еду и прогулки в загородном пансионате в пригороде Санкт-Петербурга. Теоретические занятия сопровождаются практиками, на которых участники в парах выполняют простые вычисления и обсуждают биологические выводы.
В программе также предусмотрены вечерние неформальные лекции и нетворкинг. Рабочие языки — русский и английский.
Фотографии прошлых лет: 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019.
В программе также предусмотрены вечерние неформальные лекции и нетворкинг. Рабочие языки — русский и английский.
Фотографии прошлых лет: 2014, 2015, 2016, 2017, 2018, 2019.
Программа
- Медицинская и популяционная генетика.
Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) и экзомное секвенирование: от основ к фенотипу (BWA, PLINK, GATK, ExAC и gnomAD).
- РНК-секвенирование.
От основ подготовки библиотек к анализу экспрессии генов. Поиск новых биологических фенотипов по данным экспрессии генов.
- РНК-секвенирование одиночных клеток.
Экспериментальный дизайн, анализ данных и их интерпретация (с фокусом на данные 10X Genomics). Разбор примеров из последних публикаций. - Эпигенетическая регуляция и работа с данными ChIP-seq.
Понимание данных и использование открытых ресурсов: Roadmap Epigenomics Project, Blueprint Epigenome, ENCODE.
- Основы метаболомики.
Введение в метаболомику, интеграция данных с помощью сетевых методов. Разбор примеров из области иммунометаболизма.
Спикеры
Максим Артемов (PhD)
Никита Артемов (PhD)
Алексей Сергушичев, к.т.н.
Олег Шпынов
Константин Зайцев
Организационные взносы
Размеры организационных взносов в 2020 году
Физическим лицам — 35 000 рублей (сотрудники государственных и коммерческих учреждений по договору оферты).
Юридическим лицам — 50 000 рублей (при заключении договора с организацией).
Взнос покрывает проживание, трёхразовое питание, кофе-брейки, трансфер от Санкт-Петербурга до места проведения семинара, участие и сопутствующие материалы.
Скидки
За регистрацию до 11 февраля предоставляется скидка 10% при успешном прохождении конкурсного отбора. Лучшим академическим заявкам могут быть предоставлены гранты от организаторов. Для студентов бакалавриата и магистратуры очной формы обучения скидка 15%. Для студентов и выпускников Института биоинформатики — скидка 20%. Скидки не суммируются и предоставляются только для физических лиц.
Договор оферты.
Физическим лицам — 35 000 рублей (сотрудники государственных и коммерческих учреждений по договору оферты).
Юридическим лицам — 50 000 рублей (при заключении договора с организацией).
Взнос покрывает проживание, трёхразовое питание, кофе-брейки, трансфер от Санкт-Петербурга до места проведения семинара, участие и сопутствующие материалы.
Скидки
За регистрацию до 11 февраля предоставляется скидка 10% при успешном прохождении конкурсного отбора. Лучшим академическим заявкам могут быть предоставлены гранты от организаторов. Для студентов бакалавриата и магистратуры очной формы обучения скидка 15%. Для студентов и выпускников Института биоинформатики — скидка 20%. Скидки не суммируются и предоставляются только для физических лиц.
Договор оферты.
Мы с радостью ответим на возникшие вопросы info@bioinf.me.
Организаторы
Партнеры
Подписаться на новости Института биоинформатики
© Bioinformatics Institute
направления