Онлайн-школа
по биоинформатике

10 — 12 июля 2020

Материалы школы
В 2020 году школа прошла в онлайн-формате. В течение трех дней участники познакомились с различными областями биоинформатики. Ниже мы собрали материалы по итогам школы.
Лекции

Среди приглашенных лекторов были учёные из России, а также представители биоинформатических лабораторий из университетов Европы и США.

  1. Биоинформатика в 2025: чего ждать в следующие 5 лет? Александр Предеус, Институт биоинформатики, University of Liverpool (слайды, видео)
  2. Введение в технологии секвенирования и форматы данных, Юрий Барбитов, Институт биоинформатики (слайды, видео)
  3. Молекулярная биология, Юрий Барбитов, Институт биоинформатики (слайды)
  4. Машинное обучение в биомедицинских данных, Зоя Червонцева, Сколтех, ИППИ РАН (слайды)
  5. Вычислительные методы в анализе данных масс-спектрометрии, Алексей Гуревич, ЦАБ СПбГУ (слайды, видео)
  6. Публикации - что-где-когда, Олег Шпынов, JetBrains Research (слайды, видео)
  7. Методы сравнительной геномики прокариот и их применение для задач эволюционной биологии и биомедицины, Ольга Бочкарева, IST Austria (слайды, видео)
  8. (практика) Хемоинформатика и дизайн малых молекул, Павел Полищук, Университет Палацкого в Оломоуце, Чехия и Тимур Маджидов, КФУ (слайды, видео)
Конференция участников школы

В рамках онлайн-школы участники представили устные доклады о своей научной работе в ходе конференции участников.

Свои биоинформатические работы презентовали восемь участников школы:

  • Вадим Карнаухов | Разработка алгоритма для предсказания специфичности Т-клеточных рецепторов, ассоциированных с аутоиммунным заболеванием
  • Елена Минина | Функциональный анализ транскриптомов клеток назального лаважа у пациентов с бронхиальной астмой на фоне вирусной инфекции
  • Алина Михайлова | Mitochondrial mutational spectrum in poikilothermic versus homeothermic vertebrates: effects of the temperature
  • Анна Рыбина | Функциональный и филогенетический анализ кассеты генов Escherichia coli, участвующей в деградации сульфоквиновозы и лактозы
  • Элина Смолкина | Computer-aided screening for LDH inhibitors with the use of structural filtration
  • Мария Узун | The reconstruction of magnetotactic bacteria genomes from open databases
  • Виктория Федотовская | Распределение генов митохондрий грибов в пространстве аминокислот
  • Виктор Шаманский | A genetic handicap approach: how to estimate the genome-wide burden of slightly-deleterious variants in a model population

Жюри присудило приз за лучший доклад Марии Узун. Приз зрительских симпатий вручен Алине Михайловой и Анне Рыбиной.

Тезисы конференции доступны по ссылке.
    Партнеры
    Контакты
    По всем вопросам пишите на summer@bioinf.me, но заранее ознакомьтесь с ответами на самые распространенные вопросы.