Студенты

Студенты годовой программы по биоинформатике 2017/18
Биоинформатика для биологов
Елена
Белолипецкая
Киевский национальный университет имени Тараса Шевченко, кафедра микробиологии и общей иммунологии
Выполняла исследовательскую работу в отделе генетики человека Института Молекулярной Биологии и Генетики НАН Украины. Научная работа посвящена исследованию поведения SINE элемента Alu генома человека в прокариотической клетке. Научные интересы: молекулярная биология, генетика прокариот, экстремофильные микроорганизмы. В свободное время читает книги Каку Митио, выращивает бонсай, занимается спортом. Персональная страница: https://www.linkedin.com/in/alyona-belolipetskaya-694990ab/
Евгений
Зорин
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Сферой интересов является генетика растительно-микробных взаимодействий. В частности, альтернативный сплайсинг мРНК генов, принимающих участие в установлении и поддержании симбиоза, поиск клубенёк-специфичных изоформ у гороха посевного (Pisum sativum).
Анастасия
Данчурова
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
Учится в магистратуре биологического факультета СПбГУ на кафедре генетики и биотехнологии. Выполняет научную работу в Ресурсном центре молекулярных и клеточных технологий Научного парка СПбГУ по изучению влияния теломерных последовательностей на стабильность генома и структуру хроматина. Научные интересы: системная биология, функциональная геномика, эволюция, анализ данных. Параллельно изучает программирование на Python и Haskell. Помимо всего этого, любит рисовать, играть на синтезаторе и кататься на лонгборде.
Даниил
Ершов
ПСПбГМУ им. И.П.Павлова, кафедра клинической лабораторной диагностики и генетики СЗФМИЦ им.В.А. Алмазова.
Врач клинической лабораторной диагностики. По итогам обучения в ординатуре защитил дипломную работу, на тему "Определение химерного гемопоэза у больных, перенесших трансплантацию гемопоэтических стволовых клеток". Участвует в проекте, посвященном определению роли стромальных клеток костного мозга в реконструкции нормально и опухолевого гемопоэза. В свободное время интересуется философией, ходит в походы, учится играть на гитаре.
Наталья
Клименко
ВИР им. Вавилова, отдел Биотехнологии
Аспирантка Всероссийского института генетических ресурсов растений им. Вавилова. Исследовательскую работу выполняет в отделе Биотехнологии. Целью диссертации является оценка генетического разнообразия сортов картофеля отечественной селекции. Научные интересы: генетика растений, биотехнология растений, физиология и биохимия растений, молекулярная генетика. Очень любит биологию во всех проявлениях, старается по возможности передавать свои знания школьникам. Интересуюсь языком и культурой Франции.
Владимир
Климов
СПБГУ, кафедра зоологии беспозвоночных
В настоящее время: Инженер-исследователь СПБГУ в проекте РНФ "Генетическое и морфологическое разнообразие опистоспоридий - ключ к предковой форме грибов", а также исполнитель гранта РФФИ: "Систематика, филогения и биоразнообразие «солнечников»". Первые научные исследования посвящены морфологии и видовому составу рода Belonocystis, в дальнейшем работа развилась в транскриптомный международный проект. Научные интересы: Биоинформатика, геномика, транскриптомика, скрытое биоразнообразие.
Юлия
Корниенко
СПбПУ, кафедра биофизики
Магистрантка СПбПУ, кафедра биофизики. Выполняет исследовательскую работу в отделе внутриклеточной сигнализации и транспорта Института цитологии РАН. Научная работа посвящена изучению ответа мезенхимных стволовых клеток человека на различные стрессовые воздействия, в частности связанные со сдвигом внутриклеточного редокс-баланса. Научные интересы: биология стволовых клеток, редокс-биология, внутриклеточная сигнализация, поддержание стабильности генома.
Владимир
Молчанов
СПХФА, Биоитехнология
Первая научная работа выполнена в рамках доклинических испытаний противоопухолевого препарата BP-C-Zn компании Meabco (Дания) на базе НИИ Онкологии им. Н.Н. Петрова и связана с исследованием влияния комплексного биополимерного лекарственного препарата на процессы мутагенеза в клетках красного костного мозга лабораторных мышей SHR. На данный момент занимается исследовательской работой, посвящённой поиску новых генетических маркеров Mycobacterium tuberculosis, ассоциированных с клиническими проявлениями туберкулеза, на основе данных полногеномного секвенирования. Научные интересы: геномная биоинформатика, генная инженерия, молекулярная биология, дизайн лекарственных молекул.
Значительную часть времени уделяет обучению на онлайн платформах(Stepik, Coursera). Изучает немецкий и английский язык. В свободное время занимается плаванием, играет на барабанах.
Наталья
Родина
СПбПУ, ИФНиТ, кафедра биофизики
Магистрантка СПбПУ Петра Великого на кафедре биофизики. Выпускница ФТШ (2012б). С 2011 по 2013 год проходила научную практику в лаборатории Нанобиотехнологий Академического университета по моделированию структуры антимикробных пептидов методом молекулярной динамики. С 2013 года работаю в Лаборатории структурной динамики, стабильности и фолдинга белков Института цитологии РАН. Научная работа посвящена исследованию структуры, свойств, механизмов и причин образования амилоидных фибрилл - упорядоченных белковых агрегатов, ассоциированных с многими заболеваниями. Научные интересы: молекулярная биология, фолдинг белков, амилоидогенные белки, амилоидозы, амилоидные фибриллы, болезнь Альцгеймера, Паркинсона. https://www.linkedin.com/in/наталья-родина-543a58125/
Елизавета
Скалон
СПбГУ, кафедра зоологии беспозвоночных
На кафедре зоологии беспозвоночных выполняет научную работу по изучению паразитического плазмодия ортонектид. Научные интересы: паразитология, морские беспозвоночные, молекулярная биология, биотехнология. В свободное время катается на сноуборде и занимается танцами.
Антон
Шиков
СПбГУ, кафедра физиологии и биохимии растений
Занимается изучением влияния аноксии и постаноксической реаэрации на повреждения белков и липидов в проростках пшеницы и риса. Проводит анализ перекисного окисления липидов, карбонилирования белков, также уровня низкомолекулярных антиоксидантов в указанных условиях. На данный момент изучает редокс-протеома риса. Научные интересы - физиология и биохимия растений, протеомика. В свободное время проходит курсы на платформах Stepic и Coursera.
Ксения
Черенкова
ПСПбГМУ им.ак. И.П. Павлова, лечебное дело
Зона научных интересов: микробиология, иммунология, онкология. Участник конференций кафедр биохимии, иммунологии и микробиологии.
Александр
Чеблоков
СПбПУ, Медицинская физика
Создание гиалуронан-синтезирующего штамма B. subtilis
Ростислав
Скитченко
СПХФА, Промышленная технология лекарственных препаратов
Профессиональный опыт: молекулярная биология, газовая хроматография, высокоэффективная жидкостная хроматография, капиллярный электрофорез.
Елена
Паженкова
СПбГУ
Окончила магистратуру СПбГУ (кафедра энтомологии), осуществляю исследовательскую деятельность в Зоологическом институте РАН.
Олег
Кучур
СПБГУ, кафедра биохимии
Магистр СПБГУ, кафедра биохимии. Научную работу выполняет в ФГБУ "НИИ гриппа" Минздрава России. Дипломная посвящена разработке и характеристике вакцинного противотуберкулёзного штамма, способного заменить - или использоваться в тандеме - с БЦЖ-вакциной. Участвовал в научном проекте ФМБА ОЧБ по разработке и созданию ДНК-вакцин нового поколения против туберкулёза. Научные интересы: биохимия и молекулярная биология, биотехнологии, вакцинология. Также, помимо научных интересов - есть своя музыкальная группа, увлекается походами.
Юрий
Маловичко
СПбГУ, кафедра генетики и биотехнологии
В данный момент выполняет работу, посвященную локализации клеточных рецепторов к пептидным гормонам семейства CLE в меристематических тканях растений. Задействованный инструментарий включает в себя создание репортерных конструкций с использованием гена бета-глюкуронидазы и генов флуоресцентных белков, рекомбинационное клонирование по методу Gateway, гистохимию растений, флуоресцентную микроскопию. Сфера научных интересов: генетика, генная инженерия и биотехнология, клеточная и молекулярная биология, физиология и биохимия растений (биология развития, регуляция активности стволовых клеток, фитогормоны и сигнальные системы).
Играет в спортивное «Что? Где? Когда?», изучает испанский язык, любит путешествия.
Юрий
Орлов
Университет ИТМО
Принимаю участие в двух исследованиях, одно их которых посвящено метаболизму меди, а другое наночастицам серебра. В рамках первого изучаю клонированный в E. coli N-концевой домен белка hCTR1, занимаюсь его выделением. Работа по второму направлению посвящена механизму действия наночастиц серебра на бактерии.
В область научных интересов в первую очередь входят метаболизм микроэлементов, молекулярные основы нейродегенеративных заболеваний и подходы для направленной генетической терапии.
Александр
Ильин
СПбГУ
Магистрант Биологического факультета СПБГУ. Научная работа посвящена исследованию метаболома водоросли F. vesiculosus при различных условиях окружающей среды. Научные интересы: генотерапия, синтетическая биология, системная биология. Проходит различные онлайн-курсы и учится программировать. Также увлекается чтением научной фантастики и плаванием.
Андрей
Золотарев
СПбГУ, кафедра зоологии беспозвоночных
Обнаружение и исследование геномов РНК-вирусов в транскриптомах беспозвоночных животных
Алгоритмическая биоинформатика
Евгения
Федотова
МГУ, кафедра квантовой статистики и теории поля
Научные интересы: генетика, биоинформатика.
Андрей
Распопов
Лаборатория Касперского, инженер по автоматизации тестирования
Заинтересован в принесении реальной пользы и работе над проектами имеющими больше отношения к реальной жизни, чем очередные системы документооборота или контроля времени. Приверженец OSS и CC.
Даниил
Казаков
СПбГУ, Факультет прикладной математики — процессов управления
Научные интересы: теория вероятностей и математическая статистика, анализ данных.
Вячеслав
Боровицкий
ПОМИ РАН
Интересы: математика и программирование.


Кристина
Кривоносова
СПбАУ РАН, кафедра математических и информационных технологий
Закончила МатМех СПбГУ по специальности математическое обеспечение и администрирование информационных систем. Защитила диплом на тему улучшения чувствительности поиска синтенных блоков. Участвует в биоинформатическом проекте Sibelia.
Анастасия
Виноградова
СПбАУ РАН, кафедра математических и информационных технологий
Выпускница СПбГУ, математико-механический факультет, кафедра информационно-аналитических систем.
Александр
Бебяков
СПбГУ, ПМ-ПУ
Участвует в научном исследовании в лаборатории иммунологии и вирусологии ВИЧ-инфекции Санкт-Петербургского НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера. Работа посвящена разработке алгоритма анализа метагеномных данных, позволяющего выявлять в сложных образцах присутствие возбудителей особо опасных инфекций. Научные интересы: анализ данных, машинное обучение. Имеется опыт разработки клиентов баз данных и приложений параллельного вычисления. Базовое знание LaTeX, знание С++, MATLAB, C#, C, Python. SPIN-код: 3885-1158.
Александра
Климина
ЭПАМ Системс, Junior Software Engineer
Окончила Сибирский Аэрокосмический университет по специальности "Комплексное обеспечение информационной безопасности автоматизированных систем".
Занимается разработкой программного обеспечения, работает на проекте, связанном с исследованием редких заболеваний. Есть опыт автоматизации тестирования.Интересы: разработка ПО, математика, алгоритмы, биология, генная инженерия.
Владимир
Сухов
СПбГУ, кафедра Теории Упругости
Студент СПбГУ на кафедре Теории Упругости. В университете занимается динамическими задачами механики, такие как высокоскоростные нагружения, удары, импульсы. Учится применять различные энергетические критерии для описания момента разрушения материала. Попутно учебе в университете, проходит курсы на stepik, coursera. Интересы: программирование и его применение в естественных науках.
Константин
Шалыгин
МалтиЧартс Рус, Инженер-программист
Закончил МИЭТ. Успел побывать маляром, грузчиком, разнорабочим, инженером-технологом, кинопрокатчиком, барменом, бариста, свадебным фотографом, владельцем книжного магазина, программистом. Но всегда хранил любовь к науке и только недавно пришёл к выводу, что можно попробовать заниматься ею самому, а не только читать об интеллектуальных подвигах в книгах. Наибольший интерес представляет вопрос происхождения / иллюзии сознания, который вырастает из увлечения философией как попытки объять необъятное. Возможно, детальное знакомство с механизмами, лежащими в основе живого, как мы его определяем, поможет сделать нетривиальные ходы в этом направлении. LinkedIn: https://www.linkedin.com/in/константин-шалыгин-668008103
Николай
Дурникин
СПбГУ, Государственное и муниципальное управление
Студент бакалавриата ВШМ СПбГУ. Дорабатывает статью под рабочим названием "Renormalization group analysis of the generalized Rayleigh equation" для дальнейшего направления в International Journal of Pure and Applied Mathematics. Эта работа посвящена изучению приближенных аналитических решений обобщенного уравнения Рэлея. Интересуется информационной безопасностью. Регулярно посещает семинары по информационной безопасности, проводимые SpbCTF, DEFCON-RUSSIA. Участвовал в конференции PHD VII.
Сверх вышеперечисленного имеет интересы в области экономики, менеджмента, математики, программирования, психологии, биоинформатики
Участник движения Code For Good SPb (https://t.me/codeforgood_spb), занимающегося разработкой социальных проектов.
Регулярно принимает участие в хакатонах, CTF, конкурсах, олимпиадах.
Специфические навыки: игра на фортепиано, гитаре, баяне, блок-флейте, губной гармошке; художественная ковка; геометрическая резьба.

Евгений
Полевиков
СПБАУ РАН, МиИТ
Закончил бакалавриат СПбГЭТУ "ЛЭТИ" по направлению "Системный анализ и управление". Участвовал в летней школе по биоинформатике в 2016 году, а также в научном проекте летней школы "Поиск и классификация эндогенных ретровирусов". Последние два года активно проходил курсы по математике и программированию на Stepik, а также изучал биоинформатику на Rosalind. Во время обучения в бакалавриате в течение семестра работал на кафедре Высшей математики, а именно: проводил практические занятия по дисциплине "Линейная алгебра" для студентов 1-го курса. На данный момент продолжаю обучение в магистратуре СПБАУ РАН по направлению "Алгоритмы и анализ данных в биоинформатике".
Ангира
Кектеева
СПбАУ, МиИТ
Алексей
Куделькин
СПбГУ, кафедра геометрии (специальность: фундаментальная математика)

Антон
Елисеев
СПбАУ, МиИТ
Екатерина
Небожатко
СПбГУ, кафедра статистического моделирования
Учится в магистратуре мат-меха СПбГУ. Научная работа связана с оценкой вероятностей редких событий. В свободное время занимается музыкой.