Онлайн-школа
по биоинформатике

Отчет

10 — 12 июля 2020
bioinf.me/education/summer/2020

Школа по биоинформатике проходит ежегодно для 100 студентов, аспирантов и начинающих специалистов. Это крупнейшая школа по биоинформатике на русском языке.
Задачи школы
1
Популяризация науки
Популяризация наиболее перспективных областей биоинформатики среди студентов и молодых ученых
2
Знания
Передача актуальных знаний в области биоинформатики и анализа данных для успешного профессионального старта
3
Практика
Формирование практических навыков для закрепления знаний и командная работа над реальными научными проектами
4
Междисциплинарное общение
Совместные проекты биологов, информатиков, медиков и математиков
Программа
В 2020 году летняя школа прошла в нестандартном для мероприятия онлайн-формате. На протяжении трех дней участники удаленно знакомились с разными направлениями биоинформатики. Несмотря на онлайн-формат в программе школы были не только лекции, но и практические занятия, дающие участникам возможность самостоятельно повторить задачи, которые решает биоинформатика.

Заявки на школу из разных городов России и ближнего зарубежья. Большая часть лекций записывалась, а практики сопровождали методические пособия, которые позволили самостоятельно освоить материал школы. Записи лекций доступны на странице с материалами школы.

У участников школы была также возможность представить свои работы в области биоинформатики на конференции, которые оценивались комиссией и самими участниками.
10 июля
11:30 – 11:50
11:30 – 11:50
Открытие
12:00 – 12:50
12:00 – 12:50
Биоинформатика в 2025: чего ждать в следующие 5 лет? | лекция
13:00 – 13:50
13:00 – 13:50
Введение в технологии секвенирования и форматы данных | лекция
14:00 – 15:00
14:00 – 15:00
Обед
15:00 – 16:30
15:00 – 16:30
4 буквы и куча проблем. Форматы данных и best practices * | практика
Михаил Райко | ЦАБ СПбГУ
15:00 – 16:30
15:00 – 16:30
Молекулярная биология ** | лекция
17:00 – 18:30
17:00 – 18:30
Оценка дифференциальной экспрессии генов по данным микрочипов * | практика
17:00 – 18:30
17:00 – 18:30
Машинное обучение в биомедицинских данных ** | лекция
Елена Чуклина | Novartis
Зоя Червонцева | Сколтех, ИППИ РАН
18:45 – 19:45
18:45 – 19:45
Кофе и дискуссии
11 июля
11:00 – 11:45
11:00 – 11:45
Кофе и дискуссии
12:00 – 12:50
12:00 – 12:50
Вычислительные методы в анализе данных масс-спектрометрии | лекция
Алексей Гуревич | ЦАБ СПбГУ
13:00 – 13:50
13:00 – 13:50
Публикации – что-где-когда | лекция
Олег Шпынов | JetBrains Research
14:00 – 15:00
14:00 – 15:00
Обед
15:00 – 16:30
15:00 – 16:30
Конференция участников
17:00 – 18:30
17:00 – 18:30
Введение в Biopython * | практика
17:00 – 18:30
17:00 – 18:30
Введение в алгоритмы ** | практика
Андрей Пржибельский | ЦАБ СПбГУ
19:00 – 20:00
19:00 – 20:00
Population genomics of the critically endangered spoon-billed sandpiper | лекция
Федор Кондрашов | IST Austria
20:10 – 21:10
20:10 – 21:10
Не_только_кофе и дискуссии

12 июля
11:00 – 11:45
11:00 – 11:45
Кофе и дискуссии

12:00 – 14:00
12:00 – 14:00
Как поймать правильную рыбу. Сборка и анализ вирусов на примере исходного варианта SARS-CoV-2 | практика
Михаил Райко | ЦАБ СПбГУ
14:00 – 15:00
14:00 – 15:00
Обед
15:00 – 16:30
15:00 – 16:30
Введение в анализ данных GWAS | практика
17:00 – 18:30
17:00 – 18:30
Методы сравнительной геномики прокариот и их применение для задач эволюционной биологии и биомедицины | лекция
Ольга Бочкарева | IST Austria
17:00 – 18:30
17:00 – 18:30
Хемоинформатика и дизайн малых молекул ** | практика
Павел Полищук | Университет Палацкого в Оломоуце, Чехия
Тимур Маджидов | КФУ

18:45
18:45
Закрытие
Летняя школа — место для новых знакомств с единомышленниками, а также людьми из другой области, что способствует образованию новых междисциплинарных диалогов, которые перерастают в коллаборации.
Воссоздать атмосферу очного присутствия на онлайн-школе помогли вечерние дискуссии с лекторами и другими участниками.

Проведение школы в 2021 году планируется в Москве, право участие сохранится для всех тех, кто прошел отбор в 2020 году.
Контакты
По вопросам сотрудничества:
Екатерина Вяххи
k@bioinf.me
Подробная информация:
bioinf.me/summer
По другим вопросам:
summer@bioinf.me