Летняя школа
по биоинформатике 2019 | ОТЧЕТ
по биоинформатике 2019 | ОТЧЕТ
Москва | 29 июля — 3 августа 2019
bioinf.me/education/summer/2019
Летняя школа по биоинформатике проходит ежегодно для 100 студентов, аспирантов и начинающих специалистов попеременно в Санкт-Петербурге и Москве. Это крупнейшая школа по биоинформатике на русском языке.
bioinf.me/education/summer/2019
Летняя школа по биоинформатике проходит ежегодно для 100 студентов, аспирантов и начинающих специалистов попеременно в Санкт-Петербурге и Москве. Это крупнейшая школа по биоинформатике на русском языке.
Задачи школы
1
Популяризация науки
Популяризация наиболее перспективных областей биоинформатики среди студентов и молодых ученых
2
Знания
Передача актуальных знаний в области биоинформатики и анализа данных для успешного профессионального старта
3
Практика
Формирование практических навыков для закрепления знаний и командная работа над реальными научными проектами
4
Междисциплинарное общение
Совместные проекты биологов, информатиков, медиков и математиков. А также общение с опытными специалистами в области
Летняя школа 2019: биоинформатика в исследованиях развития и старения
Актуальность
Главная тема 2019 года — биоинформатика в исследованиях развития и старения. Достижения современной биологии и медицины позволяют решать множество проблем здоровья человека, однако механизмы возрастных изменений остаются не до конца понятными. В исследованиях старения организмов применяются современные технологии для анализа состояния тканей и отдельных клеток, полученные данные таких экспериментов требуют объемного анализа и интерпретации. На основе результатов экспериментов строятся возможные гипотезы, которые проверяются на модельных организмов.
Школа в цифрах
6
Дней школы
>56
Часов лекций
и практик
и практик
24
Приглашённых
учёных
учёных
100
Участников, отобранных из > 450 заявок
Программа
Лекции
- Знакомство с технологиями NGS
- Введение в секвенирование одиночных клеток
- Секвенирование и анализ раковых геномов
- Биологические принципы старения и контроля продолжительности жизни
- Поиск биомаркеров из протеомов и других экспрессионных данных методами машинного обучения
- Введение в иммунологию
- Протеомика и структурная биоинформатика
- Современная терапия онкологических и аутоиммунных заболеваний
- Популяционная генетика
- Эпигенетическая регуляция и старение
- Применение дизайнерских белков в медицине и биотехнологии
- Молекулярное моделирование лекарств для таргетной терапии
- Современные достижения в изучении молекулярных процессов в опухоли
- Редактирование генома человека на уровне эмбриона
- Биоинформатические методы для анализа древних ДНК
Интенсивы
Конференция
Решение научных задач в командах
- Анализ данных на языках программирования R и Python
- Молекулярная биология и генетика
- Алгоритмы в NGS
- Управление вычислениями работа с пайплайнами
- Методы MCMC в биоинформатике
- Машинное обучение для задач биологии
- Статистика
- Эпигенетека
Конференция
- конкурсный отбор исследовательских работ участников
- 12 докладов на школе
- опубликован сборник тезисов
Решение научных задач в командах
- 4 научных проекта, работа в междисциплинарных командах по 4-8 человек под руководством специалистов
- команды представили результаты перед экспертами и участниками
Лекторы
Вадим Гладышев
Harvard Medical School, ФББ МГУ
Татьяна Татаринова
University of La Verne
Антон Чугунов
ИБХ РАН
Константин Оконечников
German Cancer Research Center
Аганезов Сергей
Johns Hopkins Univeristy
Павел Синицын
Max Planck Institute of Biochemistry
Денис Ребриков
РНИМУ им.Пирогова, НМИЦ АГП им.Кулакова
Василий Раменский
ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр
профилактической медицины" Минздрава России
профилактической медицины" Минздрава России
Елена Чуклина
ETH Zürich, Institute of Molecular Systems Biology, Aebersold lab
Григорий Сапунов
Intento
Олег Шпынов
JetBrains Research
Андрей Пржибельский
Центр Алгоритмической Биотехнологии, СПбГУ
Алексей Сергушичев
Университет ИТМО
Вадим Назаров
ImmunoMind
Константин Зайцев
Washington University in Saint Louis, Университет ИТМО
Никита Алексеев
Университет ИТМО
Павел Яковлев
BIOCAD
Геннадий Захаров
EPAM
Андрей Афанасьев
ООО "Розалинд", yRisk
Мария Черниговская
Университет ИТМО
Пётр Власов
Institute of Science and Technology (IST) Austria
Александр Калинин
University of Michigan
Александр Ильин
Skoltech
Роман Чернятчик
JetBrains Research
Материалы
Научные проекты
- Studying transcriptional noise in single-cell RNA-seq data
- Как стареют белки у С.elegans
- Анализ данных РНК-секвенирования
- Поиск генетических основ долгожительства
География
38 городов, 9 стран: Россия, Украина, Республика Беларусь, Армения, Франция, Германия, Республика Корея, Китай, США.
Публикации по итогам
Партнеры
Контакты
По вопросам сотрудничества:
Екатерина Вяххи
k@bioinf.me
k@bioinf.me
По другим вопросам:
summer@bioinf.me
summer@bioinf.me