Летняя школа по биоинформатике 2019
ОТЧЕТ

Москва | 29 июля — 3 августа 2019
bioinf.me/education/summer/2019

Летняя школа по биоинформатике проходит ежегодно для 100 студентов, аспирантов и начинающих специалистов. Это крупнейшая школа по биоинформатике на русском языке.
Задачи школы
1
Популяризация науки
Популяризация наиболее перспективных областей биоинформатики среди студентов и молодых ученых
2
Знания
Передача актуальных знаний в области биоинформатики и анализа данных для успешного профессионального старта
3
Практика
Формирование практических навыков для закрепления знаний и командная работа над реальными научными проектами
4
Междисциплинарное общение
Совместные проекты биологов, информатиков, медиков и математиков
Актуальность
Главная тема 2019 года — биоинформатика в изучении процессов старения и развития. Одним из главных вопросов, над которым работают ведущие лаборатории и компании мира — это вопрос изучения механизмов старения, поиска возможных мишенией для их остановки. Биоинформатические подходы к анализу позволяют работать с данными, полученными современными методами молекулярной биологии, которые в свою очередь, позволяют получить новое знание об изучаемых биологических объектах.
Программа
Лекции

  • Технологии и анализ данных NGS
  • Анализ данных секвенирования одиночных клеток
  • Сборка геномов
  • Биоинформатика в изучении демографической истории
  • Методы вычислительной и системной биологии
  • Биоинформатические подходы в изучении транскриптомики
  • Протеомика и структурная биоинформатика
  • Эпигенетика
  • Популяционная генетика
  • Карьера в биоинформатике
  • Молекулярное моделирование лекарств для таргетной терапии
  • Современные достижения в изучении механизмов старения и развития
Интенсивы

  • Анализ данных на языках программирования R и Python
  • Молекулярная биология и генетика
  • Статистический анализ
  • Анализ секвенирования древней ДНК
  • Протеомика
  • Машинное обучение в анализе биологических данных
  • Управление вычислениями работа с пайплайнами
  • Алгоритмы в биоинформатике
  • Методы MCMC в биоинформатике

Конференция

  • конкурсный отбор исследовательских работ участников
  • 12 докладов на школе
  • опубликован сборник тезисов

Решение научных задач в командах

  • 4 научных проектов, 6 междисциплинарных команд по 5-7 человек под руководством специалистов
  • команды представили результаты перед экспертами и участниками
Лекторы и преподаватели
Вадим Гладышев
Harvard Medical School, ФББ МГУ
Татьяна Татаринова
University of La Verne
Антон Чугунов
ИБХ РАН
Константин Оконечников
German Cancer Research Center
Аганезов Сергей
Johns Hopkins Univeristy
Павел Синицын
Max Planck Institute of Biochemistry
Денис Ребриков
РНИМУ им.Пирогова, НМИЦ АГП им.Кулакова
Василий Раменский
ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр
профилактической медицины" Минздрава России
Елена Чуклина
ETH Zürich, Institute of Molecular Systems Biology, Aebersold lab
Григорий Сапунов
Intento
Олег Шпынов
JetBrains Research
Андрей Пржибельский
Центр Алгоритмической Биотехнологии, СПбГУ
Алексей Сергушичев
Университет ИТМО
Вадим Назаров
ImmunoMind
Константин Зайцев
Washington University in Saint Louis, Университет ИТМО
Никита Алексеев
Университет ИТМО
Павел Яковлев
BIOCAD
Геннадий Захаров
EPAM
Андрей Афанасьев
ООО "Розалинд", yRisk
Мария Черниговская
Университет ИТМО
Пётр Власов
Institute of Science and Technology (IST) Austria
Александр Калинин
University of Michigan
Александр Ильин
Skoltech
Роман Чернятчик
JetBrains Research
Материалы
Научные проекты
  • Studying transcriptional noise in single-cell RNA-seq data
  • Как стареют белки у С.elegans?
  • Анализ данных РНК-секвенирования
  • Поиск генетических основ долгожительств
Школа в цифрах
6
Дней школы
>54
Часов лекций
и практик
24
Приглашённых
учёных
100
Участников, отобранных из > 450 заявок
География
36 городов, 7 стран: Россия, Белоруссия, Украина, Казахстан, США, Южная Корея, ОАЭ.
Публикации по итогам
Партнеры
Организатор
Институт биоинформатики
Некоммерческая организация, занимается подготовкой высококвалифицированных специалистов в области биоинформатики и популяризацией биоинформатики в России. Организовывает летнюю школу с 2013 года.
Контакты
По вопросам сотрудничества:
Екатерина Вяххи
k@bioinf.me
Подробная информация:
bioinf.me/summer
По другим вопросам:
summer@bioinf.me