Интенсив по анализу данных NGS
13 июля - 6 августа | ОНЛАЙН

запись на курс завершена
Онлайн-интенсив для исследователей биологических направлений позволяет в сжатые сроки получить максимум практических навыков по работе с геномными данными

По итогам выдается удостоверение о повышении квалификации
Программа 13 июля – 6 августа

По средам 19:00 – 21:00 по московскому времени
По субботам 11:00 – 19:00 по московскому времени

Версия для печати
1
Пайплайны и форматы
Какие существуют форматы данных и в чем их отличия на разных этапах анализа
2
Оценка качества ридов и выравнивания
Какие программы использовать и на какие метрики следует обратить внимание
3
Выравнивание коротких фрагментов и SNP-calling
Как найти однонуклеотидные замены в коротких ридах
4
Обзор развивающихся областей биоинформатики
Генетика сложных признаков, дифференциальная экспрессия генов, метагеномные исследования
Для кого
Для всех, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.

Ожидания от участников

  • Интерес к биоинформатике и анализу данных
  • Знания в молекулярной биологии
  • Наличие ноутбука для работы на практических занятиях
  • Возможность подключиться для удаленной работы
  • Умение работать в командной строке Linux или желание быстро её освоить на вводном онлайн-курсе
        Формат
        Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке.

        Занятия проходят удаленно на платформе Zoom в течение восьми дней:
        13, 20, 27 июля и 3 августа (среда) с 19:00 до 21:00
        16, 23, 30 июля и 6 августа (суббота) с 11:00 до 19:00

        В этом году у участников будет возможность выбрать одно, два или три направления: анализ данных NGS в популяционной генетике, анализ данных RNA-seq и метагеномика. Программа включает общую вводную часть, после чего пройдут занятия по трем направлениям, которые можно совмещать или брать отдельные блоки. Время семинаров не пересекается.

        Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть: осень 2021, весна 2021, 2019, 2018
              Организационные взносы
              Взносы оплачиваются в рублях.

              • 21 000 рублей – физические лица, регистрация на одно любое направление .
              • 26 000 рублей физические лица, регистрация на два любых направления.
              • 30 000 рублей физические лица, регистрация на все занятия интенсива.
              • 40 000 рублей – юридическим лицам при заключении договора с организацией (запись только на все три направления).

              Место бронируется после произведения оплаты или по официальному гарантийному письму.
              Количество мест ограничено.
                Как принять участие
                Для того чтобы принять участие, необходимо выполнить два шага:

                1. Пройти вводный онлайн-курс. Это первый обязательный этап подготовки.

                За интенсив сложно рассказать все детали анализа данных, но программа разработана с целью дать максимум полезных навыков. Онлайн-курс короткий, но позволит вам разобраться в программном обеспечении, используемом на занятиях, и сэкономит время на решении технических проблем.

                2. Заполнить анкету и оплатить взнос.

                Ссылка на анкету станет доступна после того как вы наберете необходимые баллы в онлайн-курсе – для вас откроется следующий модуль курса на Stepik.
                Заявка оцениваться не будет, но ее заполнение обязательно — так мы сможем скорректировать программу и понять ваши ожидания.
                      Преподаватели и кураторы
                      Юрий Барбитов
                      Институт биоинформатики
                      Александр Предеус
                      Институт биоинформатики
                      Ольга Бочкарева
                      Institute of Science and Technology Austria
                      Константин Зайцев
                      Университет ИТМО
                      Михаил Райко
                      СПбГУ ЦАБ
                      Михаил Скоблов
                      МГНЦ
                      Михаил Ушаков
                      Лаборатория Сербалаб
                      Участники
                      1. Андрусенко Елена, СПбГУ
                      2. Арнаут Олег, Государственный Университет Медицины и Фармации им. Николае Тестемицану, Онкологический Институт, Кишинёв, Молдавия
                      3. Арутюнова Аракся, BostonGene
                      4. Белоусова Ксения, ДГКБ№5
                      5. Богомолова Ольга, ГБ №1 им. Н.А. Семашко города Ростов-на-Дону
                      6. Болотина Елена, МГУ им. М. В. Ломоносова
                      7. Бурмистров Павел, Сколтех
                      8. Валиева Лия, ЕВРОГЕН
                      9. Вершинина Ольга, ННГУ им. Н.И. Лобачевского
                      10. Гуськова Мария, ФГБУ "ЦСП" ФМБА РОССИИ
                      11. Джуманиязова Ирина, ЦСП ФМБА
                      12. Жук Сергей, ФГБУ «НМИЦ им. В. А. Алмазова» Минздрава России
                      13. Зыбин Михаил, Сколтех и ВШЭ
                      14. Камкина Татьяна, МГУ им. М. В. Ломоносова
                      15. Каплина Александра, ФГБУ «НМИЦ им. В. А. Алмазова» Минздрава России
                      16. Корбут Алина, АО ЦГРМ "Генетико"
                      17. Кудрявцева Ольга, МГУ им. М. В. Ломоносова
                      18. Лисова Екатерина, МГУ им. М. В. Ломоносова
                      19. Логвин Федор, Parexel
                      20. Поздина Варвара, Институт Иммунологии и Физиологии УрО РАН
                      21. Полякова Анастасия, ЭКЦ МВД России
                      22. Савинова Татьяна, ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
                      23. Сергеева Анна, НМИЦ гематологии МЗ РФ
                      24. Сивцев Алексей, НИИ медицинской генетики ТНИМЦ
                      25. Скороделова Ксения, ФГБОУ ВО «ПИМУ» Минздрава России
                      26. Смертина Елена, University of Canberra
                      27. Спотарь Геннадий, ФГБУН "ВННИИВиВ "Магарач" РАН"
                      28. Толстенков Олег, ИПЭЭРАН
                      29. Черняева Мария, НИУ ВШЭ
                      30. Шавронская Дарья, ИТМО
                      Часто задаваемые вопросы
                      Какой документ выдается по окончании?
                      По итогам выдается удостоверение о повышении квалификации Института биоинформатики с указанием прослушанных занятий и академических часов.
                      На какой уровень рассчитана программа интенсива?
                      Программа рассчитана на начинающих биоинформатиков. Однако мы ожидаем от участников владение командной строкой и знаниями в области технологий NGS уровне обязательного к прохождению онлайн-курса.
                      Претендуют ли студенты и аспиранты на скидку?
                      Нет, скидка не предоставляется.
                      Для записи на интенсив необходимо пройти онлайн-курс. Это обязательное условие?
                      Да. На интенсиве мы хотим сконцентрироваться на максимально полезной информации, поэтому важно подготовиться к ее получению и установить нужные программы.
                      Я набрал необходимое количество баллов в онлайн-курсе, что делать дальше?
                      Для тех, кто наберет необходимое количество баллов, в курсе станет доступен дополнительный модуль с инструкциями по заполнению анкеты и оплате.

                      Если модуль недоступен, значит на ближайшем интенсиве закончились места. Однако набранные баллы перезачтутся для будущих интенсивов.
                      Я прошел курс, но подача анкет уже закончилась, когда я смогу записаться на следующий интенсив?
                      Интенсив проводится ежегодно один или два раза в год. Советуем подписаться на новости Института и следить за анонсами.
                      Для участия необходим ноутбук, какое ПО требуется установить?
                      Если вы планируете участие в семинаре, то рекомендуем вам выполнять здания онлайн-курса на том же ноутбуке, который вы планируете использовать на семинаре, чтобы устанавливать необходимое ПО один раз в процессе решения задач. Накануне семинара организаторы вышлют подробные инструкции по установке дополнительных программ.
                      Отзывы
                      Контакты
                      Санкт-Петербург
                      ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»
                      Ближайшее метро: Лесная

                      По всем вопросам:
                      info@bioinf.me

                      Интенсив по анализу данных NGS 2022