Интенсив по анализу данных NGS:
введение в медицинскую и статистическую генетику

Лето 2022 | ОНЛАЙН
Онлайн-интенсив для исследователей биологических направлений позволяет в сжатые сроки получить максимум практических навыков по работе с геномными данными.

Интенсив должен был пройти в конце апреля, но был перенесен на лето 2022 года

Регистрация на интенсив еще не началась
Программа
1
Пайплайны и форматы
Форматы данных и их отличия на разных этапах анализа
2
Оценка качества ридов и выравнивания
Какие программы использовать и на какие метрики следует обратить внимание
3
Выравнивание коротких фрагментов и SNP-calling
Как найти однонуклеотидные замены в коротких ридах
4
Обзор других развивающихся областей биоинформатики
Генетика сложных признаков, дифференциальная экспрессия генов, метагеномные исследования
Для кого
Для всех, кто хочет приобрести навыки работы с данными полногеномного секвенирования.

В первую очередь приглашаются исследователи биологических и смежных направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, поиска вариаций и GWAS.

Ожидания от участников

  • Интерес к биоинформатике и анализу данных
  • Знания в молекулярной биологии
  • Наличие ноутбука для работы на практических занятиях
  • Возможность подключиться для удаленной работы
  • Умение работать в командной строке Linux или желание быстро её освоить на вводном онлайн-курсе
        Формат
        Интенсив состоит из теоретических и практических модулей на русском языке. В промежутках между занятиями будет организована работа над проектами под руководством специалистов для закрепления материала.

        Занятия проходят удаленно на платформе Zoom.

        Программы прошлых мероприятий в похожем формате можно посмотреть: осень 2021, весна 2021, 2019, 2018
              Как принять участие
              Для того чтобы принять участие, необходимо выполнить два шага:

              1. Пройти вводный онлайн-курс. Это первый обязательный этап подготовки.

              За интенсив сложно рассказать все детали анализа данных, но программа разработана с целью дать максимум полезных навыков. Онлайн-курс короткий, но позволит вам разобраться в программном обеспечении, используемом на занятиях, и сэкономит время на решении технических проблем.

              2. Заполнить анкету и оплатить взнос.

              Ссылка на анкету станет доступна после того как вы наберете необходимые баллы в онлайн-курсе – для вас откроется следующий модуль курса на Stepik.
              Заявка оцениваться не будет, но ее заполнение обязательно — так мы сможем скорректировать программу и понять ваши ожидания.

              Запись на интенсив еще не началась, однако вы можете пройти вводный онлайн-курс заранее. Все набранные баллы зачтутся, для участия останется только оплатить организационный взнос.
                    Часто задаваемые вопросы
                    На какой уровень рассчитана программа интенсива?
                    Программа рассчитана на начинающих биоинформатиков. Однако мы ожидаем от участников владение командной строкой и знаниями в области технологий NGS уровне обязательного к прохождению онлайн-курса.
                    Для записи на интенсив необходимо пройти онлайн-курс. Это обязательное условие?
                    Да. На интенсиве мы хотим сконцентрироваться на максимально полезной информации, поэтому важно подготовиться к ее получению и установить нужные программы.
                    Я набрал необходимое количество баллов в онлайн-курсе, что делать дальше?
                    Для тех, кто наберет необходимое количество баллов, в курсе станет доступен дополнительный модуль с инструкциями по заполнению анкеты и оплате.

                    Если модуль недоступен, значит на ближайшем интенсиве закончились места. Однако набранные баллы перезачтутся для будущих интенсивов.
                    Я оплатил участие, необходимо ли высылать чек или скриншот с подтверждением?
                    Мы получаем уведомления об оплатах в течение 2–3 рабочих дней. Присылать чек необязательно, но вы можете это сделать на info@bioinf.me с указанием темы письма "Оплата интенсива – год", чтобы ускорить подтверждение оплаты и места.
                    Я прошел курс, но подача анкет уже закончилась, когда я смогу записаться на следующий интенсив?
                    Интенсив проводится ежегодно один или два раза в год. Советуем подписаться на новости Института и следить за анонсами.
                    Для участия необходим ноутбук, какое ПО требуется установить?
                    Если вы планируете участие в семинаре, то рекомендуем вам выполнять здания онлайн-курса на том же ноутбуке, который вы планируете использовать на семинаре, чтобы устанавливать необходимое ПО один раз в процессе решения задач. Накануне семинара организаторы вышлют подробные инструкции по установке дополнительных программ.
                    Отзывы
                    Партнеры
                    Контакты
                    Санкт-Петербург
                    ул. Кантемировская 2А, Бизнес-центр «Таймс»
                    Ближайшее метро: Лесная

                    По всем вопросам:
                    info@bioinf.me

                    Интенсив по анализу данных NGS 2022