ПРОГРАММЫ ПО БИОИНФОРМАТИКЕ

МОСКВА

С 2019 года в Москве открываются основные образовательные программы Института биоинформатики для студентов и недавних выпускников естественно-научных, технических и математических специальностей.

Обучение проходит по направлениям: «Биоинформатика для биологов»
и «Алгоритмическая биоинформатика». Занятия по субботам и вечерам — можно совмещать с учёбой в вузе, работой и наукой.

Ключевые даты

до 15 июня

Прием заявок закрыт.
до 25 июня

Выполнить онлайн-задания
до 30 августа

Пройти собеседование
Формат
Полтора года по субботам и в 1–2 вечера будних дней. Лекции, семинары, научные проекты, хакатон и стажировки с возможностью трудоустройства.
Стоимость
Студентам, магистрантам и аспирантам 1-го года очной формы бесплатно. Остальным 20 000 руб. в семестр. За сессию на «отлично» — скидка 50% на следующий семестр.
Сертификат
При успешном окончании выдается сертификат Института биоинформатики о повышении квалификации.
О программах
Программы направлены на изучение биологических процессов с помощью современных вычислительных технологий.
БИОЛОГАМ
ИНФОРМАТИКАМ
Программа «Биоинформатика для биологов» разработана для студентов и аспирантов биологических, биотехнологических и медицинских специальностей.

Биоинформатика помогает биологам значительно ускорить профессиональный рост и решать интересные и сложные научные задачи. Цель программы — развитие практических навыков программирования, статистического анализа, обработки данных и визуализации результатов.

Биологи получат основные знания в области статистики, научатся программировать на Python и R, анализировать данные секвенирования, а также общаться на одном языке с техническими специалистами, грамотно ставить задачи, проверять полученные решения и эффективно работать вместе с программистами над улучшением и созданием удобных биоинформатических программ.

Как поступить
Прием заявок в 2019 году закрыт.

Отбор проводится на конкурсной основе в три этапа:

1. Подать заявку

Заполните анкету, в которой отметьте, что поступаете на программу «Биоинформатика для биологов». Мы ждем мотивированные заявки, с описанием того, для чего вам важно обучение на программе.

2. Пройти вводный онлайн-курс

Ссылка на онлайн-курс и инструкции по выполнению придут на почту после отправки анкеты. Прохождение курса — обязательное условие для рассмотрения вашей заявки. Пожалуйста, внимательно проверяйте правильность указанной электронной почты. Письмо также может попасть в папку «Спам». Учитывайте, что на прохождение новых уроков требуется время.

Если вы уже проходили онлайн-курсы Института «Программирование на Python», «Введение в Linux» и «Анализ данных в R», баллы перезачтутся автоматически при записи на курс.

Только после выполнения этого этапа ваша заявка поступит на рассмотрение комиссии. Отбор на следующий, третий, этап проходят не все заявки. Мы ответим до 30 августа всем, в случае приглашения на собеседования или отказа.

3. Собеседование

На собеседование приглашаются кандидаты, прошедшие онлайн-курс и конкурсный отбор анкет. Собеседование длится полтора часа: час на решение заданий и полчаса на общение с комиссией.

Примеры заданий на собеседовании:
  • ответить письменно на подобные вопросы;
  • ознакомиться со статьей (пример) и быть готовым ответить на вопросы по ее содержанию
    Требования
    От вас, помимо интереса к биоинформатике, ожидаются хорошо систематизированные знания генетики и клеточной биологии, молекулярных механизмов хранения, передачи и изменения наследственной информации, умение разбираться в принципах и методах генетической инженерии и биотехнологии в целом.

    Успешные кандидаты — это, как правило, студенты старших курсов, магистранты и начинающие аспиранты. В процессе учебы вам понадобится читать научные статьи на английском языке.
    Подготовка
    Освежить знания рекомендуем с помощью:

    Онлайн-курсов «Mолекулярная биология и генетика» и «Молекулярная биология клетки».

    Литературы:
    Глик, Б. — Молекулярная биотехнология (2002),
    Щелкунов, С. — Генетическая инженерия (2004),
    Alberts, B. — Molecular biology of the cell (2008),
    Lodish, H. — Molecular Cell Biology (7th ed., 2012).


    Глоссария для биологов Института биоинформатики.
    Предварительная программа 2019/20
    Осенний семестр
    Программирование на Python
    Статистика
    Дискретная математика
    Программирование на R
    Научный проект

    Весенний семестр
    Статистика и программирование на R
    Анализ данных NGS
    Программирование на Python
    Практикум по биоинформатике
    Journal club
    Научный проект

    Летняя стажировка (факультативно, конкурсный отбор)

    Осенний семестр
    Практикум по биоинформатике
    Машинное обучение
    Journal club
    Научный проект
    Программа 2018/19 (Санкт-Петербург)
    Осенний семестр
    Программирование на Python (программа, слайды лекций)
    Статистика (программа)
    Дискретная математика (программа)
    Программирование на R (программа)
    Практикум по биоинформатике (программа, слайды лекций)
    Научный проект

    Весенний семестр
    Молекулярная эволюция и филогенетика (программа, слайды лекций)
    Введение в машинное обучение (программа)
    Программирование на Python (программа, слайды лекций)
    Journal club (программа)
    Анализ данных NGS (программа, слайды лекций)
    Практикум по биоинформатике (программа, слайды лекций)
    Научный проект

    Летняя стажировка (факультативно, конкурсный отбор)
    Научные проекты
    Каждый студент Института биоинформатики во время обучения занимается несколькими научно-исследовательскими проектами. Проект подразумевает еженедельные встречи с руководителем, а также 5-10 часов в неделю самостоятельной работы.

    Руководят научными проектами ведущие специалисты из научных лабораторий и компаний, работающих в области биоинформатики и биотехнологий. Ряд проектов курируют иностранные специалисты.

    Примеры проектов: разработка алгоритмов хранения и обработки последовательностей, базы данных последовательностей, программы анализа сигнальных путей, моделирование структур белков и другие практические и теоретические задачи в биоинформатике.
    Программа «Алгоритмическая биоинформатика» разработана для студентов технических и математических специальностей. Обучение включает углублённые курсы по алгоритмам и структурам данных, статистику, молекулярную биологию, биотехнологии и другие предметы, а также работу над научными проектами.

    Для информатиков и математиков биоинформатика — это возможность:

    • приложить знания Сomputer Science к актуальным предметным областям — медицине, биологии и эволюции;
    • решать интересные и сложные алгоритмические задачи;
    • создавать программные инструменты для биологов и медиков;
    • применять свои знания для решения важнейших задач человечества, связанных со здоровьем, качеством и продолжительностью жизни людей и сделать реальный вклад в развитие наук о жизни.

    На программе студенты получат знания в биологии и генетики, необходимые для реализации проектов в сфере естественных наук, повысят подготовку по статистике и анализу данных. Ожидается, что вы уже умеете программировать на одном из распространённых языков программирования.

    Как поступить
    Прием заявок в 2019 году закрыт. Отбор проводится на конкурсной основе в три этапа:

    1. Подать заявку

    Заполните анкету, в которой отметьте, что поступаете на программу «Алгоритмическая биоинформатика». Мы ждем мотивированные заявки, с описанием того, для чего вам важно обучение на программе.

    2. Пройти вступительный онлайн-курс и решить 15 задач на Rosalind Bioinformatics Stronghold

    Ссылка на онлайн-курс и инструкции по выполнению задач придут на почту после отправки анкеты. Прохождение этого этапа — обязательное условие для рассмотрения вашей заявки. Пожалуйста, внимательно проверяйте правильность указанной электронной почты. Письмо также может попасть в папку «Спам». Учитывайте, что на решение заданий требуется время.

    Если вы уже проходили онлайн-курс Института «Молекулярная биология и генетика», эти баллы вам перезачтутся автоматически при записи на курс.

    Только после выполнения этого этапа, ваша заявка поступит на рассмотрение комиссии. Отбор на следующий, третий, этап проходят не все заявки. Мы ответим до 30 августа всем, в случае приглашения на собеседования или отказа.

    3. Собеседование

    На собеседование приглашаются кандидаты, решившие онлайн-задания и прошедшие конкурсный отбор анкет. Собеседование длится полтора часа: час на решение задач на программирование, алгоритмы, математику, и полчаса — общение с комиссией.

    Пример задания на собеседование: решить подобные задачи.
    Требования
    Как правило, успешные кандидаты — это студенты старших курсов, магистранты и начинающие аспиранты, которые умеют программировать на одном из распространённых языков и владеют основами алгоритмов и струтур данных.

    Кандидатам, поступающим на программу «Алгоритмическая биоинформатика» важно:

    1. Знать основы алгоритмов и структур данных (списки, массивы, сортировки, деревья, хеширование и хеш-таблицы, алгоритмы на графах, алгоритмы на строках, оценка асимптотики памяти и времени работы алгоритма, динамическое программирование).

    2. Уметь программировать основные алгоритмы и выражать в коде свои идеи.

    3. Владеть основами:
    — теории вероятностей (зависимые и независимые события, условные вероятности, формула полной вероятности, теорема Байеса, математическое ожидание);
    — дискретной математики и комбинаторики (сочетания, перестановки, биномиальные коэффициенты, целочисленные последовательности, основы теории графов);
    — математической логики (отображения и отношения, эквивалентность, отношения порядка, кванторы, метод математической индукции), алгебры и теории чисел (группы, факторизация, алгоритм Евклида, теоремы Эйлера и Ферма, базис, размерность, ранг);
    — математического анализа (числовые ряды и сходимость, предел, асимптотические оценки, обозначения O( ) и o( ), непрерывность, производная, первообразная, определенный интеграл, нахождение экстремума функции, формула Тейлора).

    Подготовка
    Освежить или дополнить знания можно с помощью онлайн-курсов:

    Если вы считаете, что вам не хватает навыков программирования, то вам могут быть полезны онлайн-курсы:


    Для получения дополнительной практики в программировании алгоритмических задач можно также воспользоваться платформой Rosalind.

    Предварительная программа 2019/20 год
    Осенний семестр
    Молекулярная биология
    Статистика
    Алгоритмы в биоинформатике
    Практикум по биоинформатике
    Научный проект

    Весенний семестр
    Молекулярная биология и эволюция
    Анализ данных NGS
    Журнальный клуб
    Практикум по биоинформатике
    Научный проект

    Летняя стажировка (конкурсный отбор)

    Осенний семестр
    Машинное обучение
    Практикум по биоинформатике
    Журнальный клуб
    Научный проект
    Программа 2018/19 год (Санкт-Петербург)
    Осенний семестр
    Молекулярная биология (программа, слайды лекций)
    Статистика (программа)
    Алгоритмы в биоинформатике (программа, слайды лекций)
    Практикум по биоинформатике (программа, слайды лекций)
    Научный проект

    Весенний семестр
    Молекулярная эволюция и филогенетика (программа, слайды лекций)
    Статистика (материалы)
    Анализ данных NGS (программа, слайды лекций)
    Машинное обучение (программа, слайды лекций, задания)
    Journal club (программа)
    Практикум по биоинформатике (программа, слайды лекций)
    Научный проект

    Летняя стажировка (факультативно, конкурсный отбор)
    Научные проекты
    Каждый студент Института биоинформатики во время обучения занимается несколькими научно-исследовательскими проектами. Проект подразумевает еженедельные встречи с руководителем, а также 5-10 часов в неделю самостоятельной работы.

    Руководят научными проектами ведущие специалисты из научных лабораторий и компаний, работающих в области биоинформатики и биотехнологий. Ряд проектов курируют иностранные специалисты.

    Примеры проектов: разработка алгоритмов хранения и обработки последовательностей, базы данных последовательностей, программы анализа сигнальных путей, моделирование структур белков и другие практические и теоретические задачи в биоинформатике.
    Мы собрали для вас ответы на часто задаваемые вопросы.
    Если вы не нашли свой вопрос — пишите на info@bioinf.me.

    Подписаться на новости Института биоинформатики

    Программы по биоинформатике

    МОСКВА