Магистратура
«Алгоритмы и анализ данных в биоинформатике»

Программа направлена на подготовку программистов высокого уровня в области биоинформатики и вычислительной биологии.
DETAILS
Детали программы
Обучение включает в себя углублённые курсы по алгоритмам и структурам данных, применяемым для анализа больших массивов данных, которые получаются с помощью современных биотехнологических методов. Также в обучение входит программирование, дискретная математика, основы молекулярной биологии, статистика, машинное обучение и другие более специализированные предметы.

В качестве научной работы студенты под руководством сотрудников лаборатории принимают участие в решении реальных задач биоинформатики. Это разработка алгоритмов и программных систем для сборки геномных последовательностей (de novo genome sequence assembly), а также теоретические и практические задачи в области вычислительной протеомики и масс-спектрометрии.

Программа рассчитана на выпуск высококвалифицированных специалистов по алгоритмическим вопросам биоинформатики, востребованных как в науке, так и в индустрии.
Поступление
К поступлению в магистратуру Академического университета допускаются лица, имеющие высшее профессиональное образование (диплом бакалавра, специалиста или магистра) и прошедшие вступительные испытания.

Обучение является бесплатным для лиц, имеющих диплом бакалавра или квалификацию дипломированного специалиста и не проходивших ранее обучение в магистратуре. Для лиц, имеющих диплом магистра или специалиста, обучение в магистратуре считается получением второго высшего образования и потому является платным. Специально для таких случаев в университете установлена плата за обучение — 85 470 руб. за учебный год. Граждане Республики Беларусь, Республики Казахстан, Кыргызской Республики и Республики Таджикистан на основе взаимно признаваемых эквивалентными документов государственного образца, дающими право на поступление в магистратуру, имеют право на участие в конкурсе на места, финансируемые из средств федерального бюджета РФ. Для граждан стран СНГ и иностранных граждан, за исключением соотечественников и постоянно проживающих на территории РФ граждан Армении, Белоруссии, Казахстана, Киргизии, Молдавии, Таджикистана, Туркмении, Узбекистана, Украины, обучение в российских вузах является платным. В Академическом университете для таких студентов стоимость обучения составляет 85 470 руб. за учебный год.

Абитуриенты, имеющие профильные дипломы (физико-математические, технические или естественнонаучные специальности), проходят собеседование. Остальные сдают экзамены по математике и информатике. Вступительные испытания проходят в апреле, мае, июне и начале июля. Один участник может принять участие в одном вступительном испытании в году. Для того, чтобы принять участие во вступительных испытаниях, следует подать электронную заявку.

Вопросы можно задать через форму обратной связи (пожалуйста, перед отправкой вопроса поищите его в списке часто задаваемых вопросов).
Подготовка
Собеседование состоит из устной и письменной части. На собеседовании выявляется хорошее знание алгоритмов и структур данных, умение решать задачи и программировать свои идеи, общая математическая подготовка. Знание молекулярной биологии и опыт участия в проектах/исследованиях по биоинформатике приветствуется, но не является обязательным.

Примерный список вопросов и тем для собеседования по специализации «Алгоритмы и анализ данных в биоинформатике».
Программа обучения
Ориентировочный список курсов по семестрам

1 семестр (5 курс, осень)
Алгоритмы и структуры данных (зачет, экзамен)
Комбинаторика и теория графов (зачет, экзамен)
Программирование на языке C++ (экзамен)
Анализ данных Next Generation Sequencing (зачет)
Статистика (зачет)
Молекулярная биология (экзамен)
Алгоритмы в биоинформатике (экзамен)
Введение в Unix и Скриптовые языки (зачёт)
Биоинформатика, семинар (зачет)
Научная работа* 10+ часов (оценка)
Иностранный язык (факультатив)

2 семестр (5 курс, весна)
Сборка геномов (зачет)
Алгоритмы в биоинформатике (зачет)
Молекулярная эволюция (экзамен)
Программирование на языке C++ (зачет, экзамен)
Алгоритмы и структуры данных (зачет, экзамен)
Статистика 1 пара зачет, экзамен Java (зачет с оценкой)
Машинное обучение (экзамен)
Биоинформатика (семинар) (зачет)
Научная работа* 10+ часов (оценка)
Иностранный язык (факультатив)
Летняя практика

3 семестр (6 курс, осень)
Statistical Learning (зачет, экзамен)
Алгоритмическая биоинформатика (семинар по НИР) (зачет)
Параллельные и распределенные вычисления (зачет, экзамен)
Моделирование в живых системах (экзамен)
Научная работа* 10+ часов (оценка)
Иностранный язык (факультатив) (оценка)

4 семестр (6 курс, весна)
Алгоритмическая биоинформатика (семинар по НИР) (зачет)
Курс по выбору (зачёт)
Магистерская диссертация* 20+ часов (оценка)

* научная работа проходит подруководством специалистов в области разработки алгоритмов, системы анализа молекулярно-биологических данных в биоинформатических лабораториях и компаниях. Это могут быть алгоритмы хранения и обработки последовательностей, базы данных последовательностей, программы анализа сигнальных путей, моделирование структур белков и другие практические и теоретические задачи в биоинформатике. Примеры НИР студентов.
Мы с радостью ответим на возникшие вопросы info@bioinf.me.